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DIAgnostics pour la tuberculose multirésistante en Afrique (DIAMA)

13 mars 2023 mis à jour par: Dissou AFFOLABI

Diagnostic sans culture et suivi des patients atteints de tuberculose multirésistante

Les progrès récents dans le diagnostic moléculaire de la tuberculose, en particulier le test GeneXpert Mycobacterium tuberculosis/Rifampicine, ont réduit le temps nécessaire pour diagnostiquer la tuberculose résistante à la rifampicine (TB-RR), mais seule la résistance à la rifampicine est diagnostiquée, ce qui conduit à un diagnostic présomptif de résistance à l'isoniazide et peut-être à d'autres médicaments. Ainsi, dans les pays à revenu faible ou intermédiaire, la plupart des tests de sensibilité aux médicaments reposent sur des tests phénotypiques de résistance aux médicaments, qui prennent jusqu'à 4 mois. De plus, actuellement, la culture sur des échantillons d'expectorations mensuels est recommandée par l'Organisation mondiale de la santé pour le suivi des patients atteints de tuberculose résistante à la rifampicine sous traitement. Malheureusement, la culture n'est souvent pas disponible localement et les échantillons doivent être transportés du terrain aux laboratoires de culture. Les retards de transport associés entraînent des taux élevés de contamination et de culture faussement négative, en particulier dans les laboratoires à faibles ressources. De nombreuses lacunes dans le diagnostic et la prise en charge des patients atteints de tuberculose RR doivent encore être comblées et l'étude du projet DIAMA (DIAgnostics for Multidrug resistant tuberculosis in Africa) vise à combler certaines d'entre elles.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

L'étude DIAMA (DIAgnostics for Multidrug resistant tuberculosis in Africa) proposée vise à combler les lacunes actuelles dans le diagnostic et la prise en charge des patients atteints de tuberculose multirésistante (MDR). S'appuyant sur les réseaux existants et les collaborations de recherche précédemment financées par l'EDCTP (European & Developing Countries Clinical Trials Partnership), ce projet a impliqué des partenaires en Afrique de l'Ouest, centrale et de l'Est. Il vise à évaluer et à mettre en œuvre des tests moléculaires rapides et précis pour plusieurs médicaments antituberculeux, afin de remplacer la dépendance actuelle aux tests phénotypiques de résistance aux médicaments, qui prennent jusqu'à 4 mois et sont techniquement si exigeants que peu de laboratoires peuvent les effectuer correctement.

Le projet s'appuie sur la surveillance continue des patients tuberculeux en retraitement pour la résistance à la rifampicine. Deux partenaires africains (Bénin et Rwanda) dotés de laboratoires moléculaires avancés établissent des laboratoires de référence pour le test « Deeplex », une nouvelle plate-forme de diagnostic de la résistance aux médicaments basée sur le séquençage profond multiplex qui fournit simultanément des informations sur la séquence des gènes qui confèrent une résistance à plusieurs médicaments antituberculeux clés . Les partenaires recrutent tous les patients atteints de tuberculose résistante à la rifampicine et un sous-ensemble de ceux atteints de tuberculose sensible à la rifampicine. Dans une première phase, les crachats seront expédiés pour le test Deeplex, pour comparaison avec le DST phénotypique, la méthode de référence pour détecter la résistance aux médicaments de 1ère et 2ème ligne. De plus, étant donné que le séquençage du génome entier est la "référence" des tests moléculaires, le test Deeplex sera également validé à nouveau pour ce test. Dans un deuxième temps, les tests Cepheid 2ème ligne Xpert et Molbio Truenat, deux tests 'lower tech' aux dernières étapes des validations en laboratoire, seront également validés. La cartouche Cepheid Xpert 2e ligne peut être mise en œuvre dans les machines Xpert existantes utilisées pour les tests Xpert MTB/Rif. Ces tests seront comparés au test Deeplex et au WGS

Grâce aux dernières avancées du logiciel DataTocare développé par l'un des partenaires du projet, les résultats moléculaires seront communiqués en temps réel aux programmes nationaux de lutte contre la tuberculose, afin que les patients atteints de tuberculose multirésistante puissent rapidement commencer un traitement approprié. La valeur ajoutée de ce système sera évaluée dans le cadre d'une étude pilote dans certains sites.

Enfin, une fois que les patients ont commencé le traitement MDR, ils seront surveillés pour le succès du traitement par des approches alternatives plus rapides aux cultures mensuelles recommandées par l'OMS : les échantillons d'expectorations en série auront une microscopie de coloration vitale au diacétate de fluorescéine (FDA), la mesure de la charge bactérienne à l'aide du Xpert MTB /Rif ainsi que précurseur de la mesure de l'ARN ribosomal (pré-ARNr).

Ensemble, ces progrès devraient améliorer considérablement le pronostic actuellement lamentable de la tuberculose multirésistante dans les systèmes de santé des milieux pauvres en ressources.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Réel)

3356

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

      • Antwerp, Belgique
        • Institute of Tropical Medecine
    • Atlantique/Littoral
      • Cotonou, Atlantique/Littoral, Bénin, 01BP321
        • Centre National Hospitalier Universitaire de Pneumo-Phtisiologie de Cotonou
      • Bamenda, Cameroun
        • The Tuberculosis Reference Laboratory Bamenda
      • Kinshasa, Congo, République démocratique du
        • Institut National de Recherche Biomédicale (INRB)
      • Jīma, Ethiopie
        • Jimma University
      • Conakry, Guinée
        • Service de Pneumophtisiologie, Hôpital Ignace Deen, Conakry
      • Bamako, Mali
        • Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako, SEREFO
      • Ibadan, Nigeria
        • Damien Fundation
      • Kigali, Rwanda
        • Rwanda Biomedical Center (RBC)
      • Dakar, Sénégal
        • Université Cheick Anta Diop (UCAD)

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

15 ans et plus (Enfant, Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Deux études observationnelles multicentriques seront menées :

Étude 1 : Étude transversale pour les cas de tuberculose (TB) âgés de ≥ 15 ans (tous résistants à la rifampicine (RR) (nouveaux cas ou patients en retraitement) et nombre égal de patients en retraitement sensibles à la rifampicine du même pays) avec comparaison des tests de diagnostic de résistance à la tuberculose performances au départ. Il y a 2 phases dans ce projet; la phase 1 est la comparaison des résultats Deeplex avec les résultats phénotypiques et WGS (Gold standard), la phase 2 est la comparaison des résultats MolBio TrueNat et GeneXpert 2ème génération avec Deeplex et WGS (gold standard).

Étude 2 : Étude de cohorte de patients RR-TB (recrutés dans l'étude 1) sous traitement avec comparaison des performances de la FDA et de GeneXpert par rapport à la culture solide

La description

Critère d'intégration:

  • Avoir ≥ 15 ans
  • Avoir un test positif sur GeneXpert (M. tuberculosis) avec ou sans résistance détectée à la rifampicine
  • Volonté et capable de fournir un consentement éclairé écrit, ou pour les mineurs : accord et consentement d'un représentant légal

Critères d'exclusion : Aucun

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Patients résistants et sensibles à la rifampicine
Etude 1 : Patients détectés positifs par le GeneXpert Mycobacterium tuberculosis/Rifampicine (sensibles et résistants à la rifampicine)

Amélioration du diagnostic des patients multirésistants à la tuberculose avec des approches sans culture. Nous avons prévu de diagnostiquer la résistance de la tuberculose aux médicaments de 1ère et 2ème ligne grâce à de nouveaux tests moléculaires multiplex (étude 1) en :

  • Validation du test Deeplex et mise en place d'un réseau d'envoi d'échantillons de crachats dans l'éthanol aux laboratoires régionaux de référence (Etude 1 - phase 1)
  • Validation du test Molbio Truenat comme test délocalisé (Etude 1 - phase 2)
  • Validation de la cartouche Cepheid GeneXpert 2ème ligne au niveau district (Etude 1 -phase2)
Patients résistants à la rifampicine
Etude 2 : Suivi des patients résistants à la rifampicine inclus dans l'étude 1 pendant leur traitement

Amélioration de la prise en charge des patients multirésistants à la tuberculose avec des approches sans culture. Nous avons prévu de mettre en place des approches alternatives sans culture pour le suivi de la réponse des patients au traitement de la Tuberculose Multirésistante aux Médicaments (Etude 2), avec :

  • Microscopie FDA
  • Mesure de la charge bactérienne en suivant les valeurs de seuil de cycle (Ct) dans GeneXpert Mycobacterium tuberculosis/Rifampicine
  • Mesure de la synthèse de pré-ARNr

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Validation du test Deeplex
Délai: 4 années
Concordance entre les résultats du test phénotypique de sensibilité aux médicaments, WGS et Deeplex
4 années
Validation de GeneXpert 2e ligne
Délai: 4 années
Concordance entre les résultats WGS, Deeplex et les résultats GeneXpert 2e ligne
4 années
Validation de MolBio TrueNat pour INH, FQ et BDQ
Délai: 4 années
Concordance entre les résultats WGS, Deeplex et MolBioTrueNat
4 années
Validation de la microscopie FDA
Délai: 4 années
Concordance entre les résultats de culture et les résultats de microscopie FDA
4 années
Validation de la valeur GeneXpert Ct
Délai: 4 années
Concordance entre les résultats de culture et les résultats de valeur GeneXpert Ct
4 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Estimation de la proportion de résistance supplémentaire chez les patients résistants à la Rifampicine
Délai: 4 années
Évaluation à faire avec le test Deeplex
4 années
Mesure de l'association de mutations spécifiques contre certains médicaments avec le résultat du traitement programmatique
Délai: 4 années
Évaluation à faire avec le test Deeplex
4 années
Évaluation de la valeur ajoutée du système de connectivité dans la prise en charge des patients multirésistants à la tuberculose
Délai: 2 années
Évaluation à faire avec le système de connectivité Data2Care
2 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

4 mai 2017

Achèvement primaire (Réel)

30 juin 2022

Achèvement de l'étude (Réel)

30 novembre 2022

Dates d'inscription aux études

Première soumission

24 septembre 2017

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

2 octobre 2017

Première publication (Réel)

6 octobre 2017

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

14 mars 2023

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

13 mars 2023

Dernière vérification

1 mars 2023

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

INDÉCIS

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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