Diagnostika multirezistentní tuberkulózy v Africe (DIAMA)

Navrhovaná studie DIAMA (DIAgnostics for Multidrug resistant tuberculosis in Africa) si klade za cíl řešit současné mezery v diagnostice a léčbě pacientů s multirezistentní (MDR) tuberkulózou. Tento projekt, který staví na stávajících sítích a výzkumných spolupracích, které byly dříve financované Evropským partnerstvím pro klinické zkoušky evropských a rozvojových zemí (EDCTP), zahrnoval partnery ze západní, střední a východní Afriky. Jeho cílem je vyhodnotit a zavést rychlé a přesné molekulární testy pro několik léků proti tuberkulóze, aby nahradily současnou závislost na testování fenotypové lékové rezistence, které trvá až 4 měsíce a je technicky tak náročné, že jej dokáže správně provést jen málo laboratoří.

Projekt staví na nepřetržitém sledování pacientů s přeléčením tuberkulózy na rezistenci na rifampicin. Dva afričtí partneři (Benin a Rwanda) s pokročilými molekulárními laboratořemi zakládají referenční laboratoře pro test „Deeplex“, novou platformu pro diagnostiku rezistence na léky založenou na multiplexním hlubokém sekvenování, která současně poskytuje informace o sekvenci genů, které udělují rezistenci k několika klíčovým lékům proti tuberkulóze. . Partneři přijímají všechny pacienty s tuberkulózou rezistentní na rifampicin a podskupinu pacientů s tuberkulózou citlivou na rifampicin. V první fázi bude sputum odesláno pro test Deeplex pro srovnání s fenotypovým DST, referenční metodou pro detekci rezistence na léky 1. a 2. linie. Kromě toho, protože sekvenování celého genomu je "referenční" molekulárními testy, bude test Deeplex také znovu validován tímto testem. Ve druhé fázi budou také ověřeny testy Cepheid 2nd line Xpert a Molbio Truenat, dva testy „nižší technologie“ v posledních fázích laboratorních validací. Kazetu Cepheid Xpert 2. řady lze implementovat do stávajících strojů Xpert používaných pro testy Xpert MTB/Rif. Tyto testy budou porovnány s testem Deeplex a s WGS

Pomocí nejnovějších pokroků v softwaru DataTocare vyvinutém jedním z partnerů projektu budou molekulární výsledky sděleny v reálném čase Národním programům tuberkulózy, aby pacienti s multirezistentní tuberkulózou mohli rychle zahájit vhodnou léčbu. Přidaná hodnota tohoto systému bude v některých lokalitách vyhodnocena jako pilotní studie.

Konečně, jakmile pacienti zahájí léčbu MDR, budou sledováni z hlediska úspěšnosti léčby pomocí rychlejších alternativních přístupů k měsíčním kultivacím doporučeným WHO: sériové vzorky sputa budou mít mikroskopii vitálního barviva Fluorescein diacetát (FDA), měření bakteriální zátěže pomocí Xpert MTB /Rif a také prekurzor měření ribozomální RNA (pre-rRNA).

Očekává se, že tyto pokroky společně dramaticky zlepší současnou neutěšenou prognózu MDR-TB ve zdravotnických systémech v prostředí s nedostatkem zdrojů.