DIAgnostik för multiresistent tuberkulos i Afrika (DIAMA)

Den föreslagna DIAMA-studien (DIAgnostics for Multidrug Resistant tuberculosis in Africa) syftar till att ta itu med aktuella luckor i diagnosen och hanteringen av patienter med Multi-Drug-Resistant (MDR) tuberkulos. Byggande på befintliga nätverk och forskningssamarbeten som tidigare finansierats av European & Developing Countries Clinical Trials Partnership (EDCTP), involverade detta projekt partners i västra, centrala och östra Afrika. Den syftar till att utvärdera och implementera snabba och noggranna molekylära tester för flera läkemedel mot tuberkulos, för att ersätta det nuvarande beroendet av fenotypisk läkemedelsresistenstestning, som tar upp till 4 månader och är tekniskt så krävande att få laboratorier kan utföra det korrekt.

Projektet bygger på den kontinuerliga övervakningen av tuberkulospatienter med avseende på rifampicinresistens. Två afrikanska partners (Benin och Rwanda) med avancerade molekylära laboratorier etablerar referenslaboratorier för "Deeplex"-analysen, en ny multiplex djupsekvenseringsbaserad diagnostisk plattform för läkemedelsresistens som samtidigt tillhandahåller sekvensinformation för gener som ger resistens mot flera viktiga anti-tuberkulosläkemedel. . Partners rekryterar alla patienter med rifampicinresistent tuberkulos och en undergrupp av dem med rifampicinkänslig tuberkulos. I en första fas kommer sputum att skickas för Deeplex-analysen, för jämförelse med fenotypisk DST, referensmetoden för att upptäcka resistens mot 1:a och 2:a linjens läkemedel. Dessutom, eftersom Whole Genome Sequencing är "referensen" för molekylära tester, kommer Deeplex-analysen också att valideras igen detta test. I en andra fas, Cepheid 2nd line Xpert och Molbio Truenat-testet, två "lower tech"-tester i de sista stadierna av laboratorievalidering, kommer också att valideras. Cepheid Xpert 2nd line-kassetten kan implementeras i befintliga Xpert-maskiner som används för Xpert MTB/Rif-analyser. Dessa tester kommer att jämföras med Deeplex-analysen och mot WGS

Med hjälp av de senaste framstegen inom DataTocare-mjukvaran utvecklad av en av projektpartnerna kommer molekylära resultat att kommuniceras i realtid till de nationella tuberkulosprogrammen, så att multiresistenta tuberkulospatienter snabbt kan påbörja lämplig behandling. Mervärdet av detta system kommer att utvärderas som en pilotstudie på vissa platser.

Slutligen, när patienter har påbörjat MDR-behandling, kommer de att övervakas för behandlingsframgång genom snabbare alternativa tillvägagångssätt till WHO:s rekommenderade månatliga kulturer: seriella sputumprover kommer att ha fluorescein diacetat (FDA) vitalfärgningsmikroskopi, mätning av bakteriebelastningen med Xpert MTB /Rif samt prekursor för ribosomal RNA-mätning (pre-rRNA).

Tillsammans förväntas dessa framsteg dramatiskt förbättra den för närvarande dystra prognosen för MDR-TB i hälsosystem i resurssvaga miljöer.