Agents pathogènes responsables d'infections respiratoires associées à la noyade dans l'eau de mer (APIR-NOY)
Détection Précoce par Technique de Biologie Moléculaire des Pathogènes Responsables des Infections Respiratoires Associées aux Noyades en Eau de Mer : Etude Pilote au CHU de Nice
Peu de données sont actuellement disponibles sur le type d'agent pathogène responsable des infections respiratoires suite à une noyade. De nombreux germes environnementaux présents dans l'eau de mer sont décrits comme difficiles à cultiver sur des milieux standards mais potentiellement pathogènes. Même en utilisant des milieux de culture spécifiques près de 90% des bactéries présentes dans l'eau restent incultivables. L'utilisation de l'amplification d'ADNr 16S et 18S suivie d'un séquençage à haut débit sur des prélèvements respiratoires pourrait permettre d'objectiver ces bactéries potentiellement impliquées dans le processus physiopathologique secondaire à la noyade et ainsi d'améliorer leur prise en charge globale.
Réalisation d'un lavage broncho-alvéolaire (LBA) dans les 24h suivant l'admission en réanimation avec analyse sur milieux de culture standards et spécifiques des germes de l'environnement, réalisation d'antibiogrammes, extraction d'ADN, amplification par amorces universelles ADNr 16 et 18S suivi d'un séquençage haut débit et phylogénétique analyse des agents pathogènes trouvés. Comparaison de ces résultats avec les mêmes analyses effectuées sur des échantillons d'eau de mer prélevés à proximité du site de noyade et lors d'un nouvel AML à 72h pour des patients encore intubés et présentant des signes de pneumonie afin de déterminer si les pathogènes détectés à l'entrée persistent et sont présents dans le environnement.
LAM à l'entrée du patient, au jour 3 et prélèvement environnemental en milieu de noyade dans les 24 heures. Analyses bactériologiques standards et spécifiques avec les techniques de biologie moléculaire (amplification ADNr 16 et 18S) réalisées au laboratoire du Pr RUIMY (CHU de Nice) séquençage sur la plateforme de génomique de l'INRA de Toulouse. Saisie et analyse de données phylogénétiques à l'IRCAN (Bioinformatique, Croce Olivier). Suivi du patient jusqu'à la sortie de réanimation.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Type d'étude
Inscription (Réel)
Phase
- N'est pas applicable
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Fréjus, France, 83600
- Frejus hospital
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Nice, France, 06000
- University Hospital of Nice
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
La description
Critère d'intégration:
- malade adulte
- hospitalisé en réanimation pour noyade grave en eau de mer (stade Spilzman 5 ou 6) (4)
- intubé dans les 24 heures suivant l'admission ou avant l'admission aux soins intensifs
- affilié à la sécurité sociale
Critère d'exclusion:
- patients sous tutelle, curatelle ou détention
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Objectif principal: Science basique
- Répartition: N / A
- Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
- Masquage: Aucun (étiquette ouverte)
Armes et Interventions
Groupe de participants / Bras |
Intervention / Traitement |
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Autre: lavage broncho-alvéolaire
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Réalisation d'un lavage broncho-alvéolaire (LBA) dans les 24h suivant l'admission en réanimation avec analyse sur milieux de culture standards et spécifiques des germes de l'environnement, réalisation d'antibiogrammes, extraction d'ADN, amplification par amorces universelles ADNr 16 et 18S suivi d'un séquençage haut débit et phylogénétique analyse des agents pathogènes trouvés.
Comparaison de ces résultats avec les mêmes analyses effectuées sur des échantillons d'eau de mer prélevés à proximité du site de noyade et lors d'un nouvel AML à 72h pour des patients encore intubés et présentant des signes de pneumonie afin de déterminer si les pathogènes détectés à l'entrée persistent et sont présents dans le environnement.
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Délai |
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présence de germes d'eau de mer potentiellement pathogènes non détectés par les cultures standards et retrouvés dans le milieu de noyade.
Délai: 3 jours
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3 jours
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 17-AOIP-03
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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