Tengervízbe fulladással összefüggő légúti fertőzésekért felelős kórokozók (APIR-NOY)

Jelenleg kevés adat áll rendelkezésre a fulladást követő légúti fertőzésekért felelős kórokozó típusáról. A tengervízben jelenlévő számos környezeti csírát nehéznek tenyészteni standard táptalajon írnak le, de potenciálisan patogén. Még speciális táptalaj használatával is a vízben lévő baktériumok közel 90%-a nem tenyészthető. A 16S és 18S rDNS amplifikáció, majd a légúti minták nagy áteresztőképességű szekvenálása lehetővé teszi számunkra, hogy tárgyiasítsuk ezeket a baktériumokat, amelyek potenciálisan részt vesznek a vízbefulladás másodlagos fiziopatológiai folyamatában, és ezáltal javítsuk általános kezelésüket.

Bronhoalveoláris mosás (BAL) elvégzése az intenzív osztályba kerülést követő 24 órán belül a környezeti csírák standard és specifikus táptalajokon végzett elemzésével, antibiogramok elvégzésével, DNS extrakcióval, univerzális 16 és 18S rDNS primerekkel történő amplifikációval, majd nagy áramlású szekvenálás és filogenetikai vizsgálattal. a talált kórokozók elemzése. Ezen eredmények összehasonlítása ugyanazokkal az elemzésekkel, amelyeket a fuldoklási hely közelében vett tengervízmintákon és egy új AML során, 72 órával a még mindig intubált és tüdőgyulladás jeleit mutató betegeknél végeztek annak megállapítása érdekében, hogy a bejáratnál kimutatott kórokozók fennmaradnak-e, és jelen vannak-e a környezet.

AML a beteg bejáratánál, a 3. napon és környezeti mintavétel a fuldokló környezetben 24 órán belül. Standard és specifikus bakteriológiai elemzések molekuláris biológiai technikákkal (amplifikáció 16 és 18S rDNS) a Pr RUIMY laboratóriumában (Nice University Hospital) végzett szekvenálás az INRA toulouse-i genomikai platformján. Filogenetikai adatgyűjtés és elemzés az IRCAN-nál (Bioinformatika, Croce Olivier). A beteg követése az újraélesztésig.