Ziekteverwekkers die verantwoordelijk zijn voor luchtweginfecties die verband houden met verdrinking in zeewater (APIR-NOY)

Er zijn momenteel weinig gegevens beschikbaar over het type ziekteverwekker dat verantwoordelijk is voor luchtweginfecties na verdrinking. Veel omgevingsbacteriën die in zeewater aanwezig zijn, worden beschreven als moeilijk te kweken op standaardmedia, maar zijn potentieel pathogeen. Zelfs bij gebruik van specifieke kweekmedia blijft bijna 90% van de in het water aanwezige bacteriën niet-kweekbaar. Het gebruik van 16S- en 18S-rDNA-amplificatie gevolgd door high-throughput-sequencing op ademhalingsmonsters zou ons in staat kunnen stellen om deze bacteriën die mogelijk betrokken zijn bij het fysiopathologische proces secundair aan verdrinking te objectiveren en zo hun algehele beheer te verbeteren.

Uitvoeren van een bronchoalveolaire lavage (BAL) binnen 24 uur na opname op de intensive care met analyse van standaard en specifieke kweekmedia van omgevingskiemen, uitvoeren van antibiogrammen, DNA-extractie, amplificatie door universele 16 en 18S rDNA-primers gevolgd door high flow sequencing en fylogenetische analyse van gevonden ziekteverwekkers. Vergelijking van deze resultaten met dezelfde analyses uitgevoerd op zeewatermonsters genomen in de buurt van de plaats van verdrinking en tijdens een nieuwe AML om 72 uur voor patiënten die nog geïntubeerd zijn en tekenen van longontsteking vertonen om te bepalen of de bij de ingang gedetecteerde ziekteverwekkers aanhouden en aanwezig zijn in de omgeving.

AML bij de ingang van de patiënt, op dag 3 en omgevingsbemonstering in de drenkomgeving binnen 24 uur. Standaard en specifieke bacteriologische analyses met moleculair biologische technieken (amplificatie 16 en 18S rDNA) uitgevoerd in het laboratorium van Pr RUIMY (Nice University Hospital) sequencing op INRA's Toulouse genomics platform. Fylogenetische gegevensverzameling en -analyse bij IRCAN (Bio-informatica, Croce Olivier). Opvolging van de patiënt tot ontslag uit de reanimatie.