Krankheitserreger, die für Atemwegsinfektionen im Zusammenhang mit dem Ertrinken im Meerwasser verantwortlich sind (APIR-NOY)

Derzeit liegen nur wenige Daten über die Art des Erregers vor, der für Atemwegsinfektionen nach dem Ertrinken verantwortlich ist. Viele im Meerwasser vorhandene Umweltkeime werden als schwierig auf Standardmedien zu kultivieren beschrieben, sind aber potenziell pathogen. Selbst unter Verwendung spezieller Nährmedien bleiben fast 90 % der im Wasser vorhandenen Bakterien nicht kultivierbar. Die Verwendung von 16S- und 18S-rDNA-Amplifikation, gefolgt von Hochdurchsatz-Sequenzierung von Atemwegsproben, könnte es uns ermöglichen, diese Bakterien zu objektivieren, die möglicherweise an dem physiopathologischen Prozess nach dem Ertrinken beteiligt sind, und somit ihr Gesamtmanagement zu verbessern.

Durchführung einer bronchoalveolären Lavage (BAL) innerhalb von 24 Stunden nach Intensivaufnahme mit Analyse auf Standard- und spezifischen Nährmedien von Umweltkeimen, Durchführung von Antibiogrammen, DNA-Extraktion, Amplifikation durch universelle 16- und 18S-rDNA-Primer mit anschließender High-Flow-Sequenzierung und Phylogenetik Analyse der gefundenen Krankheitserreger. Vergleich dieser Ergebnisse mit den gleichen Analysen, die an Meerwasserproben durchgeführt wurden, die in der Nähe der Ertrinkungsstelle und während einer neuen AML um 72 h für Patienten durchgeführt wurden, die noch intubiert waren und Anzeichen einer Lungenentzündung zeigten, um festzustellen, ob die am Eingang nachgewiesenen Krankheitserreger bestehen bleiben und in der vorhanden sind Umfeld.

AML am Eingang des Patienten, an Tag 3 und Umgebungsprobenahme in der Ertrinkungsumgebung innerhalb von 24 Stunden. Standard- und spezifische bakteriologische Analysen mit molekularbiologischen Techniken (Amplifikation 16- und 18S-rDNA), durchgeführt im Labor von Pr RUIMY (Universitätskrankenhaus Nizza), Sequenzierung auf der Toulouse-Genomikplattform von INRA. Phylogenetische Datenerfassung und -analyse bei IRCAN (Bioinformatics, Croce Olivier). Patientennachsorge bis zur Reanimationsentlassung.