Découverte intégrée de nouveaux biomarqueurs actionnables immuno-moléculaires pour les tumeurs avec un environnement immunodéprimé (IDeATIon)

L'objectif principal est de découvrir de nouveaux biomarqueurs immunomoléculaires actionnables invasifs et non invasifs dans des tumeurs rares mais graves survenant chez des patients immunodéprimés par rapport à certaines tumeurs chez des patients immunocompétents. En effet, ces tumeurs présentent un environnement immunitaire déficient, soit en raison d'un déficit immunitaire acquis par l'hôte, c'est-à-dire les greffes ou l'infection par le VIH, soit parce que le tissu malade appartient à un sanctuaire immunitaire comme le cerveau. L'hypothèse principale, dans ce contexte, est que ces profils mutationnels tumoraux et leurs modifications au cours du traitement médicamenteux doivent être influencés par l'environnement et la réponse immunitaires. Ceci doit conduire à des différences avec des tumeurs similaires observées dans des environnements immunocompétents (individus immunocompétents ou tissus exprimant une immunité), responsables de : modification des cibles moléculaires pour des médicaments appropriés ; altération de l'immunogénicité tumorale et des futures immunothérapies ; biomarqueurs spécifiques pour le suivi de la réponse au traitement médicamenteux. Les objectifs de ce programme sont de mener des investigations invasives et non invasives afin de définir le profil mutationnel de ces types libres de tumeurs sévères, les lymphomes non hodgkiniens (LNH), les cancers du poumon et les gliomes survenant chez des hôtes ou des tissus à immunité altérée. . Ces investigations conduiront à : identifier de nouveaux biomarqueurs invasifs et non invasifs pour prédire et évaluer l'efficacité des futures thérapies personnalisées et immunitaires ; comparer les tumeurs d'hôtes immunodéprimés et immunocompétents ; découvrir les points chauds des mutations tumorales en tant que mécanismes de résistance des tumeurs, nouvelles cibles moléculaires pour de futures stratégies thérapeutiques moléculaires et immunitaires ; définir l'immunomutanome tumoral comme un score de néo-épitopes prédisant : l'immunogénicité tumorale, l'évolution de la maladie et l'efficacité des immunothérapies ; détecter des biomarqueurs tumoraux non invasifs à partir de biopsies liquides basées sur l'ADN tumoral circulant et les cellules tumorales circulantes pour faciliter le diagnostic et la surveillance futurs de ces tumeurs ; identifier des biomarqueurs d'échappement tumoral ou de résistance aux traitements.