Integreret opdagelse af nye immunmolekylære handlingsbare biomarkører for tumorer med immunsupprimeret miljø (IDeATIon)

Hovedformålet er at opdage nye invasive og ikke-invasive immunmolekylære biomarkører i sjældne, men alvorlige tumorer, der opstår hos immunsupprimerede sammenlignet med nogle tumorer hos immunkompetente patienter. Faktisk præsenterer disse tumorer et mangelfuldt immunmiljø, enten på grund af værtens erhvervede immundefekt, dvs. transplantationer eller HIV-infektion, eller fordi det syge væv hører hjemme i et immunreservat som hjernen. Den primære hypotese i denne sammenhæng er, at disse tumormutationsprofiler og deres ændringer under lægemiddelbehandling skal påvirkes af immunmiljøet og responsen. Dette skal føre til forskelle fra lignende tumorer observeret i immunkompetente miljøer (immunkompetente individer eller væv, der udtrykker immunitet), ansvarlige for: modifikation af de molekylære mål for passende lægemidler; ændring af tumorimmunogenicitet og af fremtidige immunbaserede terapier; specifikke biomarkører til overvågning af respons på lægemiddelbehandling. Formålet med dette program er at gennemføre invasive og ikke-invasive undersøgelser for at definere mutationsprofilen af ​​disse frie typer af alvorlige tumorer, non-Hodgkin lymfom (NHL), lungekræft og gliomer, der opstår i værter eller væv med ændret immunitet . Disse undersøgelser vil føre til: identificere nye invasive og ikke-invasive biomarkører til at forudsige og evaluere effektiviteten af ​​fremtidige personaliserede og immunbaserede terapier; sammenligne tumorer fra immunsupprimerede og immunkompetente værter; opdage hot spots af tumorale mutationer som mekanismer for tumorresistens, nye molekylære mål for fremtidige molekylære og immunbaserede terapeutiske strategier; definere tumorimmunomutanomet som en score af neo-epitoper, der forudsiger: tumorimmunogenicitet, sygdomsudfald og immunterapiers effektivitet; detektere ikke-invasive tumorale biomarkører fra flydende biopsier baseret på cirkulerende tumor-DNA og cirkulerende tumorceller for at lette fremtidig diagnose og overvågning af sådanne tumorer; identificere biomarkører for tumorflugt eller resistens over for behandlinger.