Variantes moléculaires associées à la schizophrénie : analyse différentielle de jumeaux monozygotes à phénotype variable 22q11 (CSRK05)
8 février 2021 mis à jour par: Hôpital le Vinatier
22q11.2 translationnel : " Variantes moléculaires associées à la schizophrénie : analyse différentielle de jumeaux monozygotes avec syndrome de microdélétion phénotypique variable 22q11.2 »
Le syndrome de microdélétion 22q11.2 (22q11.2DS) est une maladie rare de phénotype psychiatrique.
En effet, le diagnostic de schizophrénie est posé chez 5 à 10 % des adolescents et 25 à 40 % des adultes porteurs du DS 22q11.
Ainsi, bien que cette pathologie ait pu fournir un modèle génétiquement homogène pour l'étiologie de la psychose étudiée, il n'est pas possible actuellement d'établir un lien entre le réarrangement génomique et les symptômes psychotiques.
Cependant, ce modèle robuste de vulnérabilité génétique pourrait nous fournir de nombreuses informations translationnelles sur la génétique de la schizophrénie.
Pour aller plus loin, les études de jumeaux nous ont fourni des données précieuses pour l'étude des maladies héréditaires.
En combinant ces deux approches, le 22q11.2 translationnel
projet propose une étude moléculaire de deux 22q11.2DS monozygotes
jumeaux discordants pour le phénotype psychiatrique -l'un porteur de schizophrénie et l'autre n'ayant aucun symptôme psychiatrique-.
Aperçu de l'étude
Statut
Complété
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
L'objectif principal de l'étude est de proposer une approche de séquençage de l'exome entier (WES), pan-génomique dans le séquençage du génome entier (WGS), transcriptomique, épigénomique et du microbiome intestinal afin de déterminer la base moléculaire spécifique des symptômes psychotiques dans 22q11.2DS.
Type d'étude
Interventionnel
Inscription (Réel)
2
Phase
- N'est pas applicable
Contacts et emplacements
Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.
Lieux d'étude
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Rhone Alpes
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Lyon, Rhone Alpes, France, 69678
- Hopital Vinatier
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Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
18 ans à 45 ans (ADULTE)
Accepte les volontaires sains
Non
Sexes éligibles pour l'étude
Homme
La description
Critère d'intégration:
- • La fraternité de jumeaux monozygotes diagnostiqués avec le 22q11.2DS de novo est confirmée par le tableau CGH et discordante pour le phénotype psychiatrique
Critère d'exclusion:
- • Refus d'utiliser les données à des fins de recherche
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Objectif principal: DIAGNOSTIQUE
- Répartition: NON_RANDOMIZED
- Modèle interventionnel: PARALLÈLE
- Masquage: AUCUN
Armes et Interventions
Groupe de participants / Bras |
Intervention / Traitement |
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AUTRE: Groupe "Twin 1"
Jumeau 1 avec symptômes psychotiques (PANSS+) Analyses moléculaires 1
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Comparaison du profil moléculaire entre deux jumeaux monozygotes porteurs d'une délétion 22q11.2
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AUTRE: Groupe "Twin 2"
Jumeau 2 sans symptômes psychotiques (PANSS+) Analyses moléculaires 2
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Comparaison du profil moléculaire entre deux jumeaux monozygotes porteurs d'une délétion 22q11.2
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Séquençage complet de l'exome
Délai: 6 mois
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Recherche de variations génétiques en mosaïque qui peuvent avoir eu lieu secondairement à la conception
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6 mois
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Transcriptome
Délai: 6 mois
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deux méthodes d'extraction d'ARNm seront utilisées : à partir de l'établissement de lignées lymphoblastoïdes et à partir de sang total prélevé sur tube paxgene®.
Après épuisement des ARN ribosomiques, les ARN seront convertis en ADN complémentaires et des librairies seront constituées à partir de 100 à 200ng d'ARN total.
Les bibliothèques seront séquencées dans une extrémité appariée pour générer 80 millions de lectures par échantillon.
Les données seront analysées avec la suite HTSeq pour compter le nombre de lectures associées à chaque gène annoté dans la dernière version du génome.
La suite bioconductrice DESeq sera utilisée pour normaliser l'expression.
Une étude pour identifier les gènes différentiellement exprimés sera réalisée avec cet outil et GFold.
Les gènes présentant une expression différentielle statistiquement significative seront validés par RT-qPCR
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6 mois
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Méthylome
Délai: 6 mois
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Cette analyse sera réalisée en collaboration avec " L'hôpital de Sainte Anne2 (Inserm UMR_S894 "Physiologie des maladies psychiatriques" - Pr Marie-Odile KREBS).
L'ADN sera extrait du sang total prélevé sur tube paxgene®.
La méthylation du génome entier des frères et sœurs jumeaux sera étudiée par la puce Infinium MethylationEPIC BeadChip (Illumina) qui couvre 850 000 CpG et l'ensemble des gènes après traitement de l'ADN au bisulfite.
L'analyse statistique des différences de méthylation sera réalisée avec le logiciel R (packages minfi et ChAMP) afin de mettre en évidence les DMP (Differentially Methylated Probes) ainsi que les DMR (Differentially Methylated Regions, probes contigues).
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6 mois
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ADN microbiotique
Délai: 6 mois
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Une analyse métagénomique quantitative sera réalisée sur la base d'un séquençage du matériel génétique extrait du microbiome intestinal dans les selles des deux jumeaux
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6 mois
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Échelle des syndromes positifs et négatifs (PANSS)
Délai: 6 mois
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Échelle d'évaluation des syndromes positifs et négatifs de la symptomatologie schizophrénique. Le patient est noté de 1 à 7 sur 30 symptômes différents sur la base de l'entretien ainsi que des rapports des membres de la famille ou du personnel hospitalier de soins primaires. Comme 1 plutôt que 0 est donné comme score le plus bas pour chaque item, un patient ne peut pas obtenir un score inférieur à 30 pour le score PANSS total.
Les scores sont souvent donnés séparément pour les items positifs, les items négatifs et la psychopathologie générale.
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6 mois
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Mini-Entretien Neuropsychiatrique International (MINI)
Délai: 6 mois
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Les modalités pour répondre à toutes les questions du Mini-International Neuropsychiatric Interview (MINI) sont "OUI" ou "NON".
Si les réponses à ces questions filtres sont positives, les suivantes sont posées permettant de valider ou d'invalider le diagnostic concerné.
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6 mois
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Échelle hospitalière d'anxiété et de dépression (HADS)
Délai: 6 mois
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L'échelle hospitalière d'anxiété et de dépression (HADS) est un instrument de détection des troubles anxieux et dépressifs.
Il comporte 14 items répertoriés de 0 à 3. Sept questions portent sur l'anxiété (total A) et sept autres sur la dimension dépressive (total D), permettant ainsi d'obtenir deux scores (score maximum de chaque score = 21).
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6 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: DEMILY CAROLINE, MD PH.D, Centre Hospitalier le Vinatier & CNRS UMR 5229 (BRON, France)
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (RÉEL)
27 mars 2020
Achèvement primaire (RÉEL)
30 novembre 2020
Achèvement de l'étude (RÉEL)
30 décembre 2020
Dates d'inscription aux études
Première soumission
24 octobre 2019
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
24 octobre 2019
Première publication (RÉEL)
28 octobre 2019
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (RÉEL)
9 février 2021
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
8 février 2021
Dernière vérification
1 juin 2020
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
- Les troubles mentaux
- Maladies cardiaques
- Maladies cardiovasculaires
- Maladies lymphatiques
- Maladies du système endocrinien
- Anomalies congénitales
- Maladies génétiques, innées
- Maladies musculo-squelettiques
- Spectre de la schizophrénie et autres troubles psychotiques
- Maladies parathyroïdiennes
- Malformations cardiaques congénitales
- Anomalies cardiovasculaires
- Anomalies craniofaciales
- Anomalies musculosquelettiques
- Anomalies multiples
- Troubles chromosomiques
- Syndrome de délétion 22q11
- Anomalies lymphatiques
- Hypoparathyroïdie
- La schizophrénie
- Syndrome de Di George
Autres numéros d'identification d'étude
- 2019-A00852-55
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?
NON
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Non
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Non
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