- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT04141540
Warianty molekularne związane ze schizofrenią: analiza różnicowa bliźniąt monozygotycznych ze zmiennym fenotypem 22q11 (CSRK05)
8 lutego 2021 zaktualizowane przez: Hôpital le Vinatier
Tłumaczenie 22q11.2: „Warianty molekularne związane ze schizofrenią: analiza różnicowa bliźniąt monozygotycznych ze zmiennym fenotypowym zespołem mikrodelecji 22q11.2”
Zespół mikrodelecji 22q11.2 (22q11.2DS) jest rzadką chorobą o fenotypie psychiatrycznym.
Rzeczywiście, diagnozę schizofrenii stawia się u 5 do 10% nastolatków i 25 do 40% dorosłych z 22q11DS.
Tak więc, chociaż ta patologia była w stanie zapewnić genetycznie jednorodny model etiologii psychozy, obecnie nie jest możliwe ustalenie związku między rearanżacją genomową a objawami psychotycznymi.
Jednak ten solidny model podatności genetycznej może dostarczyć nam wielu translacyjnych informacji na temat genetyki schizofrenii.
Co więcej, badania bliźniąt dostarczyły nam cennych danych do badania chorób dziedzicznych.
Łącząc te dwa podejścia, translacyjny 22q11.2
projekt proponuje badanie molekularne dwóch monozygotycznych genów 22q11.2DS
bliźnięta niezgodne pod względem fenotypu psychiatrycznego - jedno nosiciele schizofrenii, a drugie bez objawów psychiatrycznych.
Przegląd badań
Status
Zakończony
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Głównym celem pracy jest zaproponowanie metod sekwencjonowania całego egzomu (WES), pangenomicznego sekwencjonowania całego genomu (WGS), transkryptomicznego, epigenomicznego i mikrobiomu jelitowego w celu określenia specyficznych molekularnych podstaw objawów psychotycznych w 22q11.2DS.
Typ studiów
Interwencyjne
Zapisy (Rzeczywisty)
2
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
Rhone Alpes
-
Lyon, Rhone Alpes, Francja, 69678
- Hopital Vinatier
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
18 lat do 45 lat (DOROSŁY)
Akceptuje zdrowych ochotników
Nie
Płeć kwalifikująca się do nauki
Męski
Opis
Kryteria przyjęcia:
- • Siostrzeństwo bliźniąt monozygotycznych, u których zdiagnozowano de novo 22q11.2DS, potwierdzone macierzą CGH i niezgodne z fenotypem psychiatrycznym
Kryteria wyłączenia:
- • Odmowa wykorzystania danych do celów badawczych
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: DIAGNOSTYCZNY
- Przydział: NIE_RANDOMIZOWANE
- Model interwencyjny: RÓWNOLEGŁY
- Maskowanie: NIC
Broń i interwencje
Grupa uczestników / Arm |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
INNY: Grupa „Twin 1”
Bliźniak 1 z objawami psychotycznymi (PANSS +) Analizy molekularne 1
|
Porównanie profilu molekularnego dwóch bliźniąt monozygotycznych niosących delecję 22q11.2
|
|
INNY: Grupa „Twin 2”
Bliźnięta 2 bez objawów psychotycznych (PANSS +) Analizy molekularne 2
|
Porównanie profilu molekularnego dwóch bliźniąt monozygotycznych niosących delecję 22q11.2
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Sekwencjonowanie całego egzomu
Ramy czasowe: 6 miesięcy
|
Poszukiwanie mozaikowych odmian genetycznych, które mogły wystąpić wtórnie do poczęcia
|
6 miesięcy
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Transkryptomu
Ramy czasowe: 6 miesięcy
|
zastosowane zostaną dwie metody ekstrakcji mRNA: z założenia linii limfoblastoidalnych oraz z krwi pełnej pobranej do probówki paxgene®.
Po wyczerpaniu rybosomalnego RNA, RNA zostanie przekształcone w komplementarne DNA, a biblioteki zostaną utworzone przy użyciu 100 do 200 ng całkowitego RNA.
Biblioteki będą sekwencjonowane w parze, aby wygenerować 80 milionów odczytów na próbkę.
Dane zostaną przeanalizowane za pomocą pakietu HTSeq, aby policzyć liczbę odczytów związanych z każdym genem opisanym w najnowszej wersji genomu.
Do normalizacji ekspresji zostanie użyty pakiet DESeq bioconductor.
Za pomocą tego narzędzia i GFold zostanie przeprowadzone badanie mające na celu identyfikację genów o zróżnicowanej ekspresji.
Geny wykazujące statystycznie istotną zróżnicowaną ekspresję zostaną zweryfikowane przez RT-qPCR
|
6 miesięcy
|
|
Metylom
Ramy czasowe: 6 miesięcy
|
Analiza ta zostanie przeprowadzona we współpracy z " L'hôpital de Sainte Anne2 (Inserm UMR_S894 "Fizjologia chorób psychicznych" - profesor Marie-Odile KREBS).
DNA zostanie wyekstrahowane z pełnej krwi pobranej do probówki paxgene®.
Metylacja całego genomu bliźniaczego rodzeństwa będzie badana za pomocą chipa Infinium MethylationEPIC BeadChip (Illumina), który obejmuje 850 000 CpG i zestaw genów po obróbce wodorosiarczynowym DNA.
Analiza statystyczna różnic metylacji zostanie przeprowadzona za pomocą oprogramowania R (pakiety minfi i ChAMP) w celu wyróżnienia DMP (Differentially Methylated Probes) oraz DMR (Differentially Methylated Regions, probes contigues).
|
6 miesięcy
|
|
Mikrobiotyczne DNA
Ramy czasowe: 6 miesięcy
|
Ilościowa analiza metagenomiczna zostanie przeprowadzona na podstawie sekwencjonowania materiału genetycznego wyekstrahowanego z mikrobiomu jelitowego w kale dwóch bliźniąt
|
6 miesięcy
|
|
Skala Zespołu Pozytywnego i Negatywnego (PANSS)
Ramy czasowe: 6 miesięcy
|
Skala oceny pozytywnych i negatywnych zespołów symptomatologii schizofrenicznej. Pacjent oceniany jest w skali od 1 do 7 na 30 różnych objawów na podstawie wywiadu oraz relacji członków rodziny lub pracowników podstawowej opieki zdrowotnej. Jako 1 zamiast 0 przyjmuje się najniższy wynik dla każdej pozycji, pacjent nie może uzyskać mniej niż 30 punktów w całkowitej punktacji PANSS.
Wyniki są często podawane osobno dla pozycji pozytywnych, pozycji negatywnych i ogólnej psychopatologii.
|
6 miesięcy
|
|
Mini-Międzynarodowy Wywiad Neuropsychiatryczny (MINI)
Ramy czasowe: 6 miesięcy
|
Sposoby udzielania odpowiedzi na wszystkie pytania Mini-Międzynarodowego Wywiadu Neuropsychiatrycznego (MINI) to „TAK” lub „NIE”.
Jeśli odpowiedzi na te pytania filtrujące są pozytywne, zadawane są następujące pytania, które pozwalają potwierdzić lub unieważnić daną diagnozę.
|
6 miesięcy
|
|
Szpitalna Skala Lęku i Depresji (HADS)
Ramy czasowe: 6 miesięcy
|
Szpitalna Skala Lęku i Depresji (HADS) jest narzędziem służącym do wykrywania zaburzeń lękowych i depresyjnych.
Składa się z 14 pozycji od 0 do 3. Siedem pytań dotyczy lęku (suma A), a siedem innych wymiaru depresyjnego (suma D), co pozwala na uzyskanie dwóch punktów (maksymalny wynik każdego wyniku = 21).
|
6 miesięcy
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: DEMILY CAROLINE, MD PH.D, Centre Hospitalier le Vinatier & CNRS UMR 5229 (BRON, France)
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (RZECZYWISTY)
27 marca 2020
Zakończenie podstawowe (RZECZYWISTY)
30 listopada 2020
Ukończenie studiów (RZECZYWISTY)
30 grudnia 2020
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
24 października 2019
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
24 października 2019
Pierwszy wysłany (RZECZYWISTY)
28 października 2019
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (RZECZYWISTY)
9 lutego 2021
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
8 lutego 2021
Ostatnia weryfikacja
1 czerwca 2020
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Zaburzenia psychiczne
- Choroby serca
- Choroby układu krążenia
- Choroby limfatyczne
- Choroby układu hormonalnego
- Wady wrodzone
- Choroby genetyczne, wrodzone
- Choroby układu mięśniowo-szkieletowego
- Spektrum schizofrenii i inne zaburzenia psychotyczne
- Choroby przytarczyc
- Wady serca, wrodzone
- Nieprawidłowości sercowo-naczyniowe
- Nieprawidłowości twarzoczaszki
- Nieprawidłowości mięśniowo-szkieletowe
- Nieprawidłowości, mnogość
- Zaburzenia chromosomowe
- Zespół delecji 22q11
- Nieprawidłowości limfatyczne
- Niedoczynność przytarczyc
- Schizofrenia
- Zespół DiGeorge'a
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2019-A00852-55
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIE
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .