Молекулярные варианты, связанные с шизофренией: дифференциальный анализ монозиготных близнецов с вариабельным фенотипом 22q11 (CSRK05)
8 февраля 2021 г. обновлено: Hôpital le Vinatier
Перевод 22q11.2: «Молекулярные варианты, связанные с шизофренией: дифференциальный анализ монозиготных близнецов с вариабельным фенотипическим микроделеционным синдромом 22q11.2»
Синдром микроделеции 22q11.2 (22q11.2DS) — редкое заболевание с психическим фенотипом.
Действительно, диагноз шизофрении ставят от 5 до 10% подростков и от 25 до 40% взрослых с 22q11DS.
Таким образом, хотя эта патология смогла обеспечить генетически однородную модель для изучения этиологии психоза, в настоящее время невозможно установить связь между геномной перестройкой и психотическими симптомами.
Тем не менее, эта надежная модель генетической уязвимости может предоставить нам много трансляционной информации о генетике шизофрении.
Более того, исследования близнецов предоставили нам ценные данные для изучения наследственных болезней.
Комбинируя эти два подхода, трансляционный 22q11.2
проект предлагает молекулярное исследование двух монозиготных 22q11.2DS
близнецы, диссонирующие по психическому фенотипу — один с шизофренией, а другой без психических симптомов.
Обзор исследования
Статус
Завершенный
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Основная цель исследования состоит в том, чтобы предложить полноэкзомное секвенирование (WES), пангеномное секвенирование всего генома (WGS), транскриптомный, эпигеномный и микробиомный подходы для определения специфической молекулярной основы психотических симптомов при 22q11.2DS.
Тип исследования
Интервенционный
Регистрация (Действительный)
2
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
Rhone Alpes
-
Lyon, Rhone Alpes, Франция, 69678
- Hopital Vinatier
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
От 18 лет до 45 лет (ВЗРОСЛЫЙ)
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Полы, имеющие право на обучение
Мужской
Описание
Критерии включения:
- • Сестринство монозиготных близнецов с диагнозом de novo 22q11.2DS подтверждается массивом CGH и не соответствует психическому фенотипу.
Критерий исключения:
- • Отказ от использования данных в исследовательских целях
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: ДИАГНОСТИКА
- Распределение: НЕСЛУЧАЙНО
- Интервенционная модель: ПАРАЛЛЕЛЬ
- Маскировка: НИКТО
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
ДРУГОЙ: Группа "Твин 1"
Близнец 1 с психотическими симптомами (PANSS+) Молекулярные анализы 1
|
Сравнение молекулярного профиля двух монозиготных близнецов с делецией 22q11.2
|
|
ДРУГОЙ: Группа "Твин 2"
Близнец 2 без психотических симптомов (PANSS+) Молекулярные анализы 2
|
Сравнение молекулярного профиля двух монозиготных близнецов с делецией 22q11.2
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Секвенирование полного экзома
Временное ограничение: 6 месяцев
|
Поиск мозаичных генетических вариаций, которые могли возникнуть вторично после зачатия
|
6 месяцев
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Транскриптом
Временное ограничение: 6 месяцев
|
будут использоваться два метода выделения мРНК: из созданных лимфобластоидных линий и из цельной крови, собранной в пробирку paxgene®.
После истощения рибосомной РНК РНК будут преобразованы в комплементарные ДНК, и будут созданы библиотеки с использованием от 100 до 200 нг общей РНК.
Библиотеки будут секвенированы попарно, чтобы получить 80 миллионов считываний на образец.
Данные будут проанализированы с помощью пакета HTSeq для подсчета количества прочтений, связанных с каждым геном, аннотированным в последней версии генома.
Набор биокондукторов DESeq будет использоваться для нормализации выражения.
С помощью этого инструмента и GFold будет проведено исследование по выявлению генов с дифференциальной экспрессией.
Гены, демонстрирующие статистически значимую дифференциальную экспрессию, будут проверены с помощью RT-qPCR.
|
6 месяцев
|
|
Метилом
Временное ограничение: 6 месяцев
|
Этот анализ будет проведен в сотрудничестве с "L'hôpital de Sainte Anne2" (Inserm UMR_S894 "Физиология психических заболеваний" - профессор Мари-Одиль КРЕБС).
ДНК будет извлечена из цельной крови, собранной в пробирку paxgene®.
Метилирование всего генома братьев-близнецов будет изучаться с помощью чипа Infinium MethylationEPIC BeadChip (Illumina), который охватывает 850 000 CpG и набор генов после обработки бисульфитной ДНК.
Статистический анализ различий в метилировании будет проводиться с помощью программного обеспечения R (пакеты minfi и ChAMP), чтобы выделить DMP (дифференциально метилированные зонды), а также DMR (дифференциально метилированные области, смежные зонды).
|
6 месяцев
|
|
Микробиотическая ДНК
Временное ограничение: 6 месяцев
|
Количественный метагеномный анализ будет проведен на основе секвенирования генетического материала, извлеченного из кишечного микробиома в стуле двух близнецов.
|
6 месяцев
|
|
Шкала положительных и отрицательных синдромов (PANSS)
Временное ограничение: 6 месяцев
|
Шкала оценки положительных и отрицательных синдромов шизофренической симптоматики. Пациент оценивается от 1 до 7 по 30 различным симптомам на основании опроса, а также сообщений членов семьи или работников больницы первичной помощи. наименьший балл по каждому пункту, пациент не может набрать менее 30 баллов по общему баллу PANSS.
Баллы часто выставляются отдельно по положительным пунктам, отрицательным пунктам и общей психопатологии.
|
6 месяцев
|
|
Мини-Международное нейропсихиатрическое интервью (МИНИ)
Временное ограничение: 6 месяцев
|
Способы ответа на все вопросы Мини-международного нейропсихиатрического интервью (МИНИ) - «ДА» или «НЕТ».
Если ответы на эти фильтрующие вопросы положительные, задаются следующие вопросы, позволяющие подтвердить или опровергнуть соответствующий диагноз.
|
6 месяцев
|
|
Госпитальная шкала тревоги и депрессии (HADS)
Временное ограничение: 6 месяцев
|
Госпитальная шкала тревоги и депрессии (HADS) — это инструмент для выявления тревожных и депрессивных расстройств.
Он состоит из 14 пунктов от 0 до 3. Семь вопросов относятся к тревожности (сумма А) и еще семь к депрессивному аспекту (сумма D), что позволяет получить два балла (максимальный балл по каждому баллу = 21).
|
6 месяцев
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: DEMILY CAROLINE, MD PH.D, Centre Hospitalier le Vinatier & CNRS UMR 5229 (BRON, France)
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
27 марта 2020 г.
Первичное завершение (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
30 ноября 2020 г.
Завершение исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
30 декабря 2020 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
24 октября 2019 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
24 октября 2019 г.
Первый опубликованный (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
28 октября 2019 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
9 февраля 2021 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
8 февраля 2021 г.
Последняя проверка
1 июня 2020 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Психические расстройства
- Сердечные заболевания
- Сердечно-сосудистые заболевания
- Лимфатические заболевания
- Заболевания эндокринной системы
- Врожденные аномалии
- Генетические заболевания, врожденные
- Заболевания опорно-двигательного аппарата
- Спектр шизофрении и другие психотические расстройства
- Заболевания паращитовидной железы
- Пороки сердца, врожденные
- Сердечно-сосудистые нарушения
- Черепно-лицевые аномалии
- Скелетно-мышечные аномалии
- Аномалии, Множественные
- Хромосомные нарушения
- Синдром делеции 22q11
- Лимфатические аномалии
- Гипопаратиреоз
- Шизофрения
- Синдром Ди Джорджи
Другие идентификационные номера исследования
- 2019-A00852-55
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .
Клинические исследования Синдром Ди Джорджа
-
Grupo Cooperativo de Estudio y Tratamiento de las...Fundació Institut de Recerca de l'Hospital de la Santa Creu i Sant Pau; Ministry...ЗавершенныйDi Novo Острый миелоидный лейкозИспания
Клинические исследования Молекулярный анализ
-
Dartmouth-Hitchcock Medical CenterРекрутингРакСоединенные Штаты
-
PT Bio FarmaЗавершенныйИнфекция вируса папилломы человекаИндонезия