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Inflammation stérile et aberrations moléculaires dans le SMD (InflamGen)

6 avril 2022 mis à jour par: Medical University Innsbruck

Inflammation stérile et aberrations moléculaires dans le syndrome myélodysplasique : déterminants de la qualité de vie et de la vulnérabilité

L'objectif de cette étude est la description de l'association possible entre les profils de mutation/aberration génétique, le tonus inflammatoire et le phénotype clinique basé sur les PROM et la HRQoL. Outre une meilleure compréhension de la corrélation causale entre la génétique, les processus inflammatoires stériles et la qualité de vie (par ex. fatigue) dans le SMD, cette étude est censée identifier de nouveaux biomarqueurs potentiels et, à terme, des cibles thérapeutiques.

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

130

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

  • Nom: Verena Petzer, MD
  • Numéro de téléphone: 82979 0043512504

Lieux d'étude

  • L'Autriche
    • Tyrol
      • Innsbruck, Tyrol, L'Autriche, 6020
        • Recrutement
        • Medical University of Innsbruck
        • Contact:
        • Contact:

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

Diagnostic MDS, MDS/MPN basé sur la classification actuelle de l'OMS. CCUS et CHIP définis par Valent (Valent, Oncotarget, 2018) et par Stauder (Stauder, Blood, 2018)

La description

Critère d'intégration:

  • Patients féminins et masculins > 18 ans
  • Diagnostic MDS, MDS/MPN basé sur la classification actuelle de l'OMS. CCUS et CHIP définis par Valent (Valent, Oncotarget, 2018) et par Stauder (Stauder, Blood, 2018)
  • Déclaration de consentement signée et datée par le patient conformément aux directives ICH-GCP

Critère d'exclusion:

  • Toute autre maladie, physique ou mentale, ou toute anomalie de laboratoire empêchant une déclaration de consentement par le patient
  • Patients présentant une infection aiguë et/ou non contrôlée, y compris les patients apyrétiques sous traitement par antibiotique/antifongique/antiviral prophylactique
  • Toute maladie auto-immune préexistante nécessitant une immunosuppression systémique
  • Corticothérapie (>10 mg de Prednison/jour ou équivalent), quelle que soit sa nécessité jusqu'à 4 semaines avant l'inclusion dans l'étude
  • Thérapie anamnestique et/ou en cours avec des agents hypométhylants (HMA) ou des médicaments imides immunomodulateurs (IMiD)
  • Statut post allogreffe de cellules souches
  • Chimiothérapie antérieure ou en cours
  • Période de grossesse ou d'allaitement

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
MDS
  • Patients féminins et masculins âgés de 18 ans et plus
  • Diagnostic MDS, MDS/MPN basé sur la classification actuelle de l'OMS. CCUS et CHIP définis par Valent (Valent, Oncotarget, 2018) et par Stauder (Stauder, Blood, 2018)
Test diagnostique: Séquençage de nouvelle génération
Le séquençage des échantillons de patients sera effectué dans les installations de ZIMCL. Suite à l'extraction de l'ADN, le séquençage des granulocytes ainsi que des lymphocytes (contrôle) sera réalisé. En plus du séquençage de l'exome entier, un panel de SOPHIA GENETICS (qui est également disponible pour les diagnostics de routine) sera appliqué, y compris les gènes spécifiques MDS suivants : ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Chaque échantillon de patient sera "séquencé en masse", ce qui signifie que les mutations pertinentes sont détectées jusqu'à une fréquence d'allèle de 2 %.
Test diagnostique: Examens immunologiques tumoraux - dosages multiplex/amplification en chaîne par polymérase quantitative

L'activation de l'inflammasome est quantifiée par des analyses des modèles de cytokines associées à l'inflammasome. Des tests multiplex pour la quantification des cytokines spécifiques de l'inflammasome seront effectués à partir du sérum ainsi que des surnageants des cellules sanguines stimulées. La quantification des cytokines est réalisée avec Luminex FlexMap 3D. Les niveaux de cytokines sériques seront quantifiés en parallèle.

La quantification des niveaux d'expression d'ARN des produits géniques liés à l'inflammasome sera effectuée par qPCR à partir de cellules sanguines non stimulées et stimulées (= cryotube). L'extraction d'ARN nécessaire sera effectuée à l'aide d'un kit d'extraction d'ARN.

Test diagnostique: cytométrie en flux
Une évaluation détaillée de l'état immunitaire individuel est menée par l'analyse de deux panels spécialisés : le panel A fournit un large aperçu de diverses populations de cellules immunitaires, tandis que le panel B identifie les sup-populations de lymphocytes T.
Test diagnostique: Métagénomique des échantillons de selles
L'ADN sera extrait d'échantillons fécaux congelés en appliquant une méthode de perlage à l'aide d'un kit d'isolement d'ADN GNOME (MP Biomedicals). La qualité de l'ADN sera évaluée à l'aide d'une Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Après la précipitation finale, les échantillons d'ADN seront remis en suspension dans du tampon TE et stockés à -80 °C pour une analyse de séquençage plus poussée. À cette fin, des bibliothèques de séquençage seront générées à l'aide d'un kit de préparation d'échantillons d'ADN Nextera XT (Illumina). La qualité de la bibliothèque sera confirmée à l'aide d'une Agilent 4200 TapeStation. Le séquençage shotgun du génome entier d'échantillons fécaux sera effectué sur une plateforme HiSeq2500 (Illumina).
Test diagnostique: Données cliniques/démographiques
Les données démographiques et cliniques comprennent : l'âge, l'âge au moment du diagnostic initial, le sexe, le diagnostic, les comorbidités réelles, la médication à l'inclusion dans l'étude, les profils cytogénétiques et moléculaires et les paramètres de laboratoire standard (numération sanguine, numération leucocytaire différentielle, biochimie, statut en fer, marqueurs inflammatoires comme CRP, albumine, fibrinogène).
Autre: Élicitation de la QVLS
L'évaluation de la QVLS, des activités fonctionnelles et de l'état de performance sera effectuée par le patient et/ou le médecin à l'aide de scores validés.
contrôler
personnes en bonne santé du même âge
Test diagnostique: Séquençage de nouvelle génération
Le séquençage des échantillons de patients sera effectué dans les installations de ZIMCL. Suite à l'extraction de l'ADN, le séquençage des granulocytes ainsi que des lymphocytes (contrôle) sera réalisé. En plus du séquençage de l'exome entier, un panel de SOPHIA GENETICS (qui est également disponible pour les diagnostics de routine) sera appliqué, y compris les gènes spécifiques MDS suivants : ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Chaque échantillon de patient sera "séquencé en masse", ce qui signifie que les mutations pertinentes sont détectées jusqu'à une fréquence d'allèle de 2 %.
Test diagnostique: Examens immunologiques tumoraux - dosages multiplex/amplification en chaîne par polymérase quantitative

L'activation de l'inflammasome est quantifiée par des analyses des modèles de cytokines associées à l'inflammasome. Des tests multiplex pour la quantification des cytokines spécifiques de l'inflammasome seront effectués à partir du sérum ainsi que des surnageants des cellules sanguines stimulées. La quantification des cytokines est réalisée avec Luminex FlexMap 3D. Les niveaux de cytokines sériques seront quantifiés en parallèle.

La quantification des niveaux d'expression d'ARN des produits géniques liés à l'inflammasome sera effectuée par qPCR à partir de cellules sanguines non stimulées et stimulées (= cryotube). L'extraction d'ARN nécessaire sera effectuée à l'aide d'un kit d'extraction d'ARN.

Test diagnostique: cytométrie en flux
Une évaluation détaillée de l'état immunitaire individuel est menée par l'analyse de deux panels spécialisés : le panel A fournit un large aperçu de diverses populations de cellules immunitaires, tandis que le panel B identifie les sup-populations de lymphocytes T.
Test diagnostique: Métagénomique des échantillons de selles
L'ADN sera extrait d'échantillons fécaux congelés en appliquant une méthode de perlage à l'aide d'un kit d'isolement d'ADN GNOME (MP Biomedicals). La qualité de l'ADN sera évaluée à l'aide d'une Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Après la précipitation finale, les échantillons d'ADN seront remis en suspension dans du tampon TE et stockés à -80 °C pour une analyse de séquençage plus poussée. À cette fin, des bibliothèques de séquençage seront générées à l'aide d'un kit de préparation d'échantillons d'ADN Nextera XT (Illumina). La qualité de la bibliothèque sera confirmée à l'aide d'une Agilent 4200 TapeStation. Le séquençage shotgun du génome entier d'échantillons fécaux sera effectué sur une plateforme HiSeq2500 (Illumina).
Test diagnostique: Données cliniques/démographiques
Les données démographiques et cliniques comprennent : l'âge, l'âge au moment du diagnostic initial, le sexe, le diagnostic, les comorbidités réelles, la médication à l'inclusion dans l'étude, les profils cytogénétiques et moléculaires et les paramètres de laboratoire standard (numération sanguine, numération leucocytaire différentielle, biochimie, statut en fer, marqueurs inflammatoires comme CRP, albumine, fibrinogène).
Autre: Élicitation de la QVLS
L'évaluation de la QVLS, des activités fonctionnelles et de l'état de performance sera effectuée par le patient et/ou le médecin à l'aide de scores validés.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Délai
Définition de la corrélation entre les aberrations moléculaires et le tonus inflammatoire stérile
Délai: ligne de base
ligne de base
Définition de l'impact des aberrations génétiques et de l'inflammation stérile associée sur la qualité de vie liée à la santé (HRQoL, par exemple la fatigue) et les activités fonctionnelles chez les patients atteints de SMD, MDS/MPN ou CHIP/CCUS
Délai: ligne de base
ligne de base

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Délai
Définition de la corrélation entre le tonus inflammatoire stérile et les variables cliniques (par exemple, la progression vers la leucémie myéloïde aiguë secondaire (LMAs), les complications (par exemple, les infections) et la survie)
Délai: ligne de base
ligne de base

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Medical University Innsbruck

Collaborateurs

University Hospital, Bonn
Universitätsklinikum Leipzig

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

22 janvier 2020

Achèvement primaire (Anticipé)

1 janvier 2023

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 janvier 2023

Dates d'inscription aux études

Première soumission

16 mars 2020

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

16 mars 2020

Première publication (Réel)

18 mars 2020

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

7 avril 2022

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

6 avril 2022

Dernière vérification

1 janvier 2022

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • 20200129-2183

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Indécis

Description du régime IPD

Présentation lors de conférences et publication dans une revue à comité de lecture

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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