Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Sterylne zapalenie i aberracje molekularne w MDS (InflamGen)

6 kwietnia 2022 zaktualizowane przez: Medical University Innsbruck

Jałowe zapalenie i aberracje molekularne w zespole mielodysplastycznym: determinanty jakości życia i wrażliwości

Celem tego badania jest opis możliwego związku między profilami mutacji/aberracji genetycznych, tonusem zapalnym a fenotypem klinicznym w oparciu o PROM i HRQoL. Oprócz lepszego zrozumienia związku przyczynowego między genetyką, jałowymi procesami zapalnymi a jakością życia (np. zmęczenie) w MDS, badanie to ma zidentyfikować potencjalne nowe biomarkery, a ostatecznie cele terapeutyczne.

Przegląd badań

Status

Rekrutacyjny

Warunki

Interwencja / Leczenie

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Oczekiwany)

130

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Kopia zapasowa kontaktu do badania

  • Nazwa: Verena Petzer, MD
  • Numer telefonu: 82979 0043512504

Lokalizacje studiów

  • Austria
    • Tyrol
      • Innsbruck, Tyrol, Austria, 6020

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat i starsze (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Metoda próbkowania

Próbka prawdopodobieństwa

Badana populacja

Rozpoznanie MDS, MDS/MPN na podstawie aktualnej klasyfikacji WHO. CCUS i CHIP zdefiniowane przez Valenta (Valent, Oncotarget, 2018) i Staudera (Stauder, Blood, 2018)

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Pacjenci płci żeńskiej i męskiej > 18 lat
  • Rozpoznanie MDS, MDS/MPN na podstawie aktualnej klasyfikacji WHO. CCUS i CHIP zdefiniowane przez Valenta (Valent, Oncotarget, 2018) i Staudera (Stauder, Blood, 2018)
  • Podpisana i datowana deklaracja zgody pacjenta zgodnie z wytycznymi ICH-GCP

Kryteria wyłączenia:

  • Każda inna choroba, fizyczna lub psychiczna, lub jakiekolwiek nieprawidłowości laboratoryjne, które uniemożliwiają wyrażenie zgody przez pacjenta
  • Pacjenci z ostrą i (lub) niekontrolowaną infekcją, w tym pacjenci bez gorączki podczas profilaktycznego leczenia antybiotykami/przeciwgrzybiczymi/przeciwwirusowymi lekami
  • Każda istniejąca wcześniej choroba autoimmunologiczna wymagająca ogólnoustrojowej immunosupresji
  • Terapia sterydowa (>10mg Prednison/dobę lub ekwiwalent), niezależnie od jej konieczności do 4 tygodni przed włączeniem do badania
  • Anamnestyczna i/lub bieżąca terapia lekami hipometylującymi (HMA) lub immunomodulującymi lekami imidowymi (IMiD)
  • Stan po allogenicznym przeszczepieniu komórek macierzystych
  • Przebyta lub trwająca chemioterapia
  • Okres ciąży lub karmienia piersią

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Modele obserwacyjne: Kohorta
  • Perspektywy czasowe: Spodziewany

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
MDS
  • Kobiety i mężczyźni w wieku 18 lat i starsi
  • Rozpoznanie MDS, MDS/MPN na podstawie aktualnej klasyfikacji WHO. CCUS i CHIP zdefiniowane przez Valenta (Valent, Oncotarget, 2018) i Staudera (Stauder, Blood, 2018)
Test diagnostyczny: Sekwencjonowanie nowej generacji
Sekwencjonowanie próbek pacjentów zostanie przeprowadzone w obiektach ZIMCL. Po ekstrakcji DNA przeprowadzone zostanie sekwencjonowanie granulocytów oraz limfocytów (kontrolnych). Oprócz sekwencjonowania całego egzomu zastosowany zostanie panel firmy SOPHIA GENETICS (który jest również dostępny do rutynowej diagnostyki) obejmujący następujące geny specyficzne dla MDS: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Każda próbka pacjenta zostanie „zsekwencjonowana masowo”, co oznacza, że ​​odpowiednie mutacje zostaną wykryte do częstości alleli wynoszącej 2%.
Test diagnostyczny: Badania immunologiczne nowotworów - testy multipleksowe/ilościowa reakcja łańcuchowa polimerazy

Aktywację inflamasomu ocenia się ilościowo za pomocą analiz wzorców cytokin związanych z inflamasomem. Testy multipleksowe do oznaczania ilościowego cytokin specyficznych dla inflamasomu zostaną wykonane z surowicy, jak również z supernatantów stymulowanych komórek krwi. Oznaczenie ilościowe cytokin przeprowadza się za pomocą Luminex FlexMap 3D. Równolegle będą oznaczane ilościowo poziomy cytokin w surowicy.

Kwantyfikacja poziomów ekspresji RNA produktów genów związanych z inflamasomem zostanie przeprowadzona za pomocą qPCR z niestymulowanych i stymulowanych (= krioprobówkowych) komórek krwi. Niezbędna ekstrakcja RNA zostanie przeprowadzona przy użyciu zestawu do ekstrakcji RNA.

Test diagnostyczny: cytometrii przepływowej
Szczegółowa ocena indywidualnego statusu immunologicznego jest prowadzona poprzez analizę dwóch wyspecjalizowanych paneli: panel A zapewnia szeroki przegląd różnych populacji komórek odpornościowych, podczas gdy panel B identyfikuje sup-populacje komórek T.
Test diagnostyczny: Metagenomika próbek kału
DNA zostanie wyekstrahowane z zamrożonych próbek kału metodą ubijania kulek przy użyciu zestawu GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). Jakość DNA zostanie oceniona przy użyciu Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Po ostatecznym wytrąceniu próbki DNA zostaną ponownie zawieszone w buforze TE i przechowywane w temperaturze -80°C do dalszej analizy sekwencjonowania. W tym celu biblioteki sekwencjonowania zostaną wygenerowane przy użyciu zestawu Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Jakość biblioteki zostanie potwierdzona przy użyciu Agilent 4200 TapeStation. Sekwencjonowanie próbek kału metodą shotgun całego genomu zostanie przeprowadzone na platformie HiSeq2500 (Illumina).
Test diagnostyczny: Dane kliniczne/demograficzne
Dane demograficzne i kliniczne obejmują: wiek, wiek w momencie wstępnej diagnozy, płeć, diagnozę, rzeczywiste choroby współistniejące, leki w momencie włączenia do badania, profile cytogenetyczne i molekularne oraz standardowe parametry laboratoryjne (morfologia krwi, różnicowa liczba leukocytów, biochemia, status żelaza, markery stanu zapalnego, takie jak CRP, albuminy, fibrynogen).
Inny: Wywołanie HRQoL
Ocena HRQOL, czynności funkcjonalnych i stanu sprawności zostanie przeprowadzona przez pacjenta i/lub lekarza przy użyciu zwalidowanych wyników.
kontrola
zdrowe osoby w odpowiednim wieku
Test diagnostyczny: Sekwencjonowanie nowej generacji
Sekwencjonowanie próbek pacjentów zostanie przeprowadzone w obiektach ZIMCL. Po ekstrakcji DNA przeprowadzone zostanie sekwencjonowanie granulocytów oraz limfocytów (kontrolnych). Oprócz sekwencjonowania całego egzomu zastosowany zostanie panel firmy SOPHIA GENETICS (który jest również dostępny do rutynowej diagnostyki) obejmujący następujące geny specyficzne dla MDS: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Każda próbka pacjenta zostanie „zsekwencjonowana masowo”, co oznacza, że ​​odpowiednie mutacje zostaną wykryte do częstości alleli wynoszącej 2%.
Test diagnostyczny: Badania immunologiczne nowotworów - testy multipleksowe/ilościowa reakcja łańcuchowa polimerazy

Aktywację inflamasomu ocenia się ilościowo za pomocą analiz wzorców cytokin związanych z inflamasomem. Testy multipleksowe do oznaczania ilościowego cytokin specyficznych dla inflamasomu zostaną wykonane z surowicy, jak również z supernatantów stymulowanych komórek krwi. Oznaczenie ilościowe cytokin przeprowadza się za pomocą Luminex FlexMap 3D. Równolegle będą oznaczane ilościowo poziomy cytokin w surowicy.

Kwantyfikacja poziomów ekspresji RNA produktów genów związanych z inflamasomem zostanie przeprowadzona za pomocą qPCR z niestymulowanych i stymulowanych (= krioprobówkowych) komórek krwi. Niezbędna ekstrakcja RNA zostanie przeprowadzona przy użyciu zestawu do ekstrakcji RNA.

Test diagnostyczny: cytometrii przepływowej
Szczegółowa ocena indywidualnego statusu immunologicznego jest prowadzona poprzez analizę dwóch wyspecjalizowanych paneli: panel A zapewnia szeroki przegląd różnych populacji komórek odpornościowych, podczas gdy panel B identyfikuje sup-populacje komórek T.
Test diagnostyczny: Metagenomika próbek kału
DNA zostanie wyekstrahowane z zamrożonych próbek kału metodą ubijania kulek przy użyciu zestawu GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). Jakość DNA zostanie oceniona przy użyciu Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Po ostatecznym wytrąceniu próbki DNA zostaną ponownie zawieszone w buforze TE i przechowywane w temperaturze -80°C do dalszej analizy sekwencjonowania. W tym celu biblioteki sekwencjonowania zostaną wygenerowane przy użyciu zestawu Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Jakość biblioteki zostanie potwierdzona przy użyciu Agilent 4200 TapeStation. Sekwencjonowanie próbek kału metodą shotgun całego genomu zostanie przeprowadzone na platformie HiSeq2500 (Illumina).
Test diagnostyczny: Dane kliniczne/demograficzne
Dane demograficzne i kliniczne obejmują: wiek, wiek w momencie wstępnej diagnozy, płeć, diagnozę, rzeczywiste choroby współistniejące, leki w momencie włączenia do badania, profile cytogenetyczne i molekularne oraz standardowe parametry laboratoryjne (morfologia krwi, różnicowa liczba leukocytów, biochemia, status żelaza, markery stanu zapalnego, takie jak CRP, albuminy, fibrynogen).
Inny: Wywołanie HRQoL
Ocena HRQOL, czynności funkcjonalnych i stanu sprawności zostanie przeprowadzona przez pacjenta i/lub lekarza przy użyciu zwalidowanych wyników.

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Ramy czasowe
Definicja korelacji między aberracjami molekularnymi a jałowym napięciem zapalnym
Ramy czasowe: linia bazowa
linia bazowa
Definicja wpływu aberracji genetycznych i związanego z nimi sterylnego stanu zapalnego na jakość życia związaną ze zdrowiem (HRQoL, np. zmęczenie) i czynności funkcjonalne u pacjentów z MDS, MDS/MPN lub CHIP/CCUS
Ramy czasowe: linia bazowa
linia bazowa

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Ramy czasowe
Definicja korelacji sterylnego napięcia zapalnego ze zmiennymi klinicznymi (np. progresja do wtórnej ostrej białaczki szpikowej (sAML), powikłania (np. infekcje) i przeżycie)
Ramy czasowe: linia bazowa
linia bazowa

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Medical University Innsbruck

Współpracownicy

University Hospital, Bonn
Universitätsklinikum Leipzig

Śledczy

  • Główny śledczy: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Publikacje ogólne

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

22 stycznia 2020

Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)

1 stycznia 2023

Ukończenie studiów (Oczekiwany)

1 stycznia 2023

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

16 marca 2020

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

16 marca 2020

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

18 marca 2020

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

7 kwietnia 2022

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

6 kwietnia 2022

Ostatnia weryfikacja

1 stycznia 2022

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • 20200129-2183

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

Niezdecydowany

Opis planu IPD

Prezentacja na konferencjach i publikacja w recenzowanym czasopiśmie

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Sekwencjonowanie nowej generacji

Wyszukaj podobne próby

Sponsorzy i współpracownicy

Warunki medyczne

Interwencje lekowe

CROs by country

CROs in Djibouti

Warunki

Rzadkie choroby

Interwencje lekowe

Suplementy diety

Sponsor / Współpracownicy

Lokalizacje

Subskrybuj