Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Steril betennelse og molekylære aberrasjoner i MDS (InflamGen)

6. april 2022 oppdatert av: Medical University Innsbruck

Steril betennelse og molekylære avvik ved myelodysplastisk syndrom: Determinanter for livskvalitet og sårbarhet

Målet med denne studien er beskrivelsen av den mulige assosiasjonen mellom genetiske mutasjons-/aberrasjonsprofiler, inflammatorisk tonus og klinisk fenotype basert på PROMs og HRQoL. Bortsett fra å få en bedre forståelse av årsakssammenhengen mellom genetikk, sterile inflammatoriske prosesser og QoL (f.eks. fatigue) i MDS, er denne studien ment å identifisere potensielle nye biomarkører og, til slutt, terapeutiske mål.

Studieoversikt

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

130

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

  • Navn: Verena Petzer, MD
  • Telefonnummer: 82979 0043512504

Studiesteder

    • Tyrol
      • Innsbruck, Tyrol, Østerrike, 6020
        • Rekruttering
        • Medical University of Innsbruck
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år og eldre (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

MDS, MDS/MPN-diagnose basert på gjeldende WHO-klassifisering. CCUS og CHIP definert av Valent (Valent, Oncotarget, 2018) og av Stauder (Stauder, Blood, 2018)

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Kvinnelige og mannlige pasienter > 18 år
  • MDS, MDS/MPN-diagnose basert på gjeldende WHO-klassifisering. CCUS og CHIP definert av Valent (Valent, Oncotarget, 2018) og av Stauder (Stauder, Blood, 2018)
  • Signert og datert samtykkeerklæring fra pasienten i henhold til ICH-GCP Guidelines

Ekskluderingskriterier:

  • Enhver annen sykdom, enten fysisk eller psykisk, eller laboratorieavvik som hindrer en samtykkeerklæring fra pasienten
  • Pasienter med en akutt og/eller ukontrollert infeksjon, inkludert pasienter som er afebrile under behandling med antibiotika/soppdrepende/antivirale profylaktiske medisiner
  • Enhver allerede eksisterende autoimmun sykdom som krever systemisk immunsuppresjon
  • Steroidbehandling (>10mg Prednison/dag eller tilsvarende), uavhengig av nødvendigheten inntil 4 uker før inkludering i studien
  • Anamnestisk og/eller aktuell behandling med hypometylerende midler (HMA) eller immunmodulerende imidmedisiner (IMiDs)
  • Status etter allogen stamcelletransplantasjon
  • Tidligere eller pågående kjemoterapi
  • Graviditet eller ammeperiode

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Observasjonsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiver: Potensielle

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
MDS
  • Kvinnelige og mannlige pasienter i alderen 18 år og eldre
  • MDS, MDS/MPN-diagnose basert på gjeldende WHO-klassifisering. CCUS og CHIP definert av Valent (Valent, Oncotarget, 2018) og av Stauder (Stauder, Blood, 2018)
Sekvensering av pasientprøver vil bli utført i fasilitetene til ZIMCL. Etter DNA-ekstraksjon vil sekvensering av granulocytter så vel som av lymfocytter (kontroll) utføres. I tillegg til hel eksomsekvensering vil et panel fra SOPHIA GENETICS (som også er tilgjengelig for rutinediagnostikk) bli brukt, inkludert følgende MDS-spesifikke gener: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Hver pasientprøve vil bli "bulksekvensert", noe som betyr at relevante mutasjoner oppdages ned til en allelfrekvens på 2 %.

Inflammasomaktivering kvantifiseres ved analyser av inflammasomassosierte cytokinmønstre. Multipleksanalyser for kvantifisering av de inflammasomspesifikke cytokinene vil bli gjort fra serum så vel som fra supernatanter de stimulerte blodcellene. Cytokinkvantifisering utføres med Luminex FlexMap 3D. Serumcytokinnivåer vil kvantifiseres parallelt.

Kvantifisering av RNA-ekspresjonsnivåer av inflammasomrelaterte genprodukter vil bli utført av qPCRer fra ustimulerte og stimulerte (=kryotube) blodceller. Nødvendig RNA-ekstraksjon vil bli utført ved hjelp av et RNA-ekstraksjonssett.

En detaljert evaluering av den individuelle immunstatusen blir utført ved analyse av to spesialiserte paneler: Panel A gir en bred oversikt over ulike immuncellepopulasjoner, mens panel B identifiserer T-celle sup-populasjoner.
DNA vil bli ekstrahert fra frosne avføringsprøver ved å bruke en perleslagmetode ved bruk av et GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). DNA-kvalitet vil bli vurdert ved hjelp av en Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Etter endelig utfelling vil DNA-prøver bli resuspendert i TE-buffer og lagret ved -80 °C for videre sekvenseringsanalyse. For dette formål vil sekvenseringsbiblioteker bli generert ved hjelp av et Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Bibliotekets kvalitet vil bli bekreftet med en Agilent 4200 TapeStation. Helgenom haglesekvensering av fekale prøver vil bli utført på en HiSeq2500-plattform (Illumina).
Demografiske og kliniske data inkluderer: alder, alder ved første diagnose, kjønn, diagnose, faktiske komorbiditeter, medisinering ved inkludering i studien, cytogenetiske og molekylære profiler og standard laboratorieparametre (blodtelling, differensiell leukocytttelling, biokjemi, jernstatus, inflammatoriske markører som f.eks. CRP, albumin, fibrinogen).
Evaluering av HRQOL, funksjonelle aktiviteter og prestasjonsstatus vil bli gjort av pasienten og/eller legen ved å bruke validerte skårer.
kontroll
alderstilpassede friske personer
Sekvensering av pasientprøver vil bli utført i fasilitetene til ZIMCL. Etter DNA-ekstraksjon vil sekvensering av granulocytter så vel som av lymfocytter (kontroll) utføres. I tillegg til hel eksomsekvensering vil et panel fra SOPHIA GENETICS (som også er tilgjengelig for rutinediagnostikk) bli brukt, inkludert følgende MDS-spesifikke gener: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Hver pasientprøve vil bli "bulksekvensert", noe som betyr at relevante mutasjoner oppdages ned til en allelfrekvens på 2 %.

Inflammasomaktivering kvantifiseres ved analyser av inflammasomassosierte cytokinmønstre. Multipleksanalyser for kvantifisering av de inflammasomspesifikke cytokinene vil bli gjort fra serum så vel som fra supernatanter de stimulerte blodcellene. Cytokinkvantifisering utføres med Luminex FlexMap 3D. Serumcytokinnivåer vil kvantifiseres parallelt.

Kvantifisering av RNA-ekspresjonsnivåer av inflammasomrelaterte genprodukter vil bli utført av qPCRer fra ustimulerte og stimulerte (=kryotube) blodceller. Nødvendig RNA-ekstraksjon vil bli utført ved hjelp av et RNA-ekstraksjonssett.

En detaljert evaluering av den individuelle immunstatusen blir utført ved analyse av to spesialiserte paneler: Panel A gir en bred oversikt over ulike immuncellepopulasjoner, mens panel B identifiserer T-celle sup-populasjoner.
DNA vil bli ekstrahert fra frosne avføringsprøver ved å bruke en perleslagmetode ved bruk av et GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). DNA-kvalitet vil bli vurdert ved hjelp av en Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Etter endelig utfelling vil DNA-prøver bli resuspendert i TE-buffer og lagret ved -80 °C for videre sekvenseringsanalyse. For dette formål vil sekvenseringsbiblioteker bli generert ved hjelp av et Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Bibliotekets kvalitet vil bli bekreftet med en Agilent 4200 TapeStation. Helgenom haglesekvensering av fekale prøver vil bli utført på en HiSeq2500-plattform (Illumina).
Demografiske og kliniske data inkluderer: alder, alder ved første diagnose, kjønn, diagnose, faktiske komorbiditeter, medisinering ved inkludering i studien, cytogenetiske og molekylære profiler og standard laboratorieparametre (blodtelling, differensiell leukocytttelling, biokjemi, jernstatus, inflammatoriske markører som f.eks. CRP, albumin, fibrinogen).
Evaluering av HRQOL, funksjonelle aktiviteter og prestasjonsstatus vil bli gjort av pasienten og/eller legen ved å bruke validerte skårer.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Definisjon av korrelasjon mellom molekylære aberrasjoner og den sterile inflammatoriske tonus
Tidsramme: grunnlinje
grunnlinje
Definisjon av hvordan genetiske aberrasjoner og tilhørende steril betennelse påvirker helserelatert livskvalitet (HRQoL, f.eks. tretthet) og funksjonelle aktiviteter hos pasienter med MDS, MDS/MPN eller CHIP/CCUS
Tidsramme: grunnlinje
grunnlinje

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Definisjon av korrelasjon av steril inflammatorisk tonus med kliniske variabler (f.eks. progresjon til sekundær akutt myeloid leukemi (sAML), komplikasjoner (f.eks. infeksjoner) og overlevelse)
Tidsramme: grunnlinje
grunnlinje

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

22. januar 2020

Primær fullføring (Forventet)

1. januar 2023

Studiet fullført (Forventet)

1. januar 2023

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

16. mars 2020

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

16. mars 2020

Først lagt ut (Faktiske)

18. mars 2020

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

7. april 2022

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

6. april 2022

Sist bekreftet

1. januar 2022

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

Ubestemt

IPD-planbeskrivelse

Presentasjon på konferanser og publisering i fagfellevurdert tidsskrift

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Myelodysplastiske syndromer

Kliniske studier på Neste generasjons sekvensering

3
Abonnere