Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Steril inflammation och molekylära aberrationer i MDS (InflamGen)

6 april 2022 uppdaterad av: Medical University Innsbruck

Steril inflammation och molekylära aberrationer vid myelodysplastiskt syndrom: bestämningsfaktorer för livskvalitet och sårbarhet

Syftet med denna studie är att beskriva det möjliga sambandet mellan genetiska mutations-/aberrationsprofiler, inflammatorisk tonus och klinisk fenotyp baserat på PROM och HRQoL. Förutom att få en bättre förståelse för orsakssambandet mellan genetik, sterila inflammatoriska processer och QoL (t.ex. trötthet) i MDS, är denna studie tänkt att identifiera potentiella nya biomarkörer och, i slutändan, terapeutiska mål.

Studieöversikt

Status

Rekrytering

Betingelser

Intervention / Behandling

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

130

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studiekontakt

Studera Kontakt Backup

  • Namn: Verena Petzer, MD
  • Telefonnummer: 82979 0043512504

Studieorter

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år och äldre (Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Sannolikhetsprov

Studera befolkning

MDS, MDS/MPN-diagnos baserad på aktuell WHO-klassificering. CCUS och CHIP definieras av Valent (Valent, Oncotarget, 2018) och av Stauder (Stauder, Blood, 2018)

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Kvinnliga och manliga patienter > 18 år
  • MDS, MDS/MPN-diagnos baserad på aktuell WHO-klassificering. CCUS och CHIP definieras av Valent (Valent, Oncotarget, 2018) och av Stauder (Stauder, Blood, 2018)
  • Undertecknad och daterad samtyckesförklaring av patienten enligt ICH-GCP Guidelines

Exklusions kriterier:

  • Alla andra sjukdomar, vare sig fysiska eller psykiska, eller laboratorieavvikelser som förhindrar en förklaring om samtycke från patienten
  • Patienter med en akut och/eller okontrollerad infektion, inklusive patienter som är afebrila under behandling med antibiotika/svampdämpande/antivirala profylaktiska läkemedel
  • Alla redan existerande autoimmuna sjukdomar som kräver en systemisk immunsuppression
  • Steroidbehandling (>10mg Prednison/dag eller motsvarande), oavsett dess nödvändighet upp till 4 veckor innan inkludering i studien
  • Anamnestisk och/eller aktuell behandling med hypometylerande medel (HMA) eller immunmodulerande imidläkemedel (IMiD)
  • Status efter allogen stamcellstransplantation
  • Tidigare eller pågående kemoterapi
  • Graviditet eller amningsperiod

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Observationsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiv: Blivande

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
MDS
  • Kvinnliga och manliga patienter i åldern 18 år och äldre
  • MDS, MDS/MPN-diagnos baserad på aktuell WHO-klassificering. CCUS och CHIP definieras av Valent (Valent, Oncotarget, 2018) och av Stauder (Stauder, Blood, 2018)
Diagnostiskt test: Nästa generations sekvensering
Sekvensering av patientprover kommer att utföras i ZIMCLs anläggningar. Efter DNA-extraktion kommer sekvensering av granulocyter såväl som av lymfocyter (kontroll) att utföras. Förutom hel exomsekvensering kommer en panel från SOPHIA GENETICS (som också är tillgänglig för rutindiagnostik) att tillämpas inklusive följande MDS-specifika gener: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Varje patientprov kommer att "bulksekvenseras", vilket innebär att relevanta mutationer detekteras ner till en allelfrekvens på 2 %.
Diagnostiskt test: Tumörimmunologiska undersökningar - multiplexanalyser/kvantitativ polymeraskedjereaktion

Inflammasomaktivering kvantifieras genom analyser av inflammasomassocierade cytokinmönster. Multiplexanalyser för kvantifiering av de inflammasomspecifika cytokinerna kommer att göras från serum såväl som från supernatanter de stimulerade blodkropparna. Cytokinkvantifiering utförs med Luminex FlexMap 3D. Serumcytokinnivåer kommer att kvantifieras parallellt.

Kvantifiering av RNA-expressionsnivåer av inflammasomrelaterade genprodukter kommer att utföras av qPCR från ostimulerade och stimulerade (=kryotub) blodceller. Den nödvändiga RNA-extraktionen kommer att utföras med hjälp av en RNA-extraktionssats.

Diagnostiskt test: flödescytometri
En detaljerad utvärdering av den individuella immunstatusen genomförs genom analys av två specialiserade paneler: Panel A ger en bred översikt över olika immuncellspopulationer, medan panel B identifierar T-cells sup-populationer.
Diagnostiskt test: Metagenomik av avföringsprover
DNA kommer att extraheras från frysta fekala prover med en pärlslagningsmetod med hjälp av ett GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). DNA-kvalitet kommer att bedömas med en Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Efter slutlig utfällning kommer DNA-prover att återsuspenderas i TE-buffert och lagras vid -80 °C för ytterligare sekvenseringsanalys. För detta ändamål kommer sekvenseringsbibliotek att genereras med hjälp av ett Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Bibliotekets kvalitet kommer att bekräftas med en Agilent 4200 TapeStation. Helgenom-hagelgevärssekvensering av fekala prover kommer att utföras på en HiSeq2500-plattform (Illumina).
Diagnostiskt test: Kliniska/demografiska data
Demografiska och kliniska data inkluderar: ålder, ålder vid initial diagnos, kön, diagnos, faktiska komorbiditeter, medicinering vid inkludering i studien, cytogenetiska och molekylära profiler och standardlaboratorieparametrar (blodantal, differentiellt antal leukocyter, biokemi, järnstatus, inflammatoriska markörer som t.ex. CRP, albumin, fibrinogen).
Övrig: Framkallande av HRQoL
Utvärdering av HRQOL, av funktionella aktiviteter och prestationsstatus kommer att göras av patienten och/eller läkaren med hjälp av validerade poäng.
kontrollera
åldersmatchade friska personer
Diagnostiskt test: Nästa generations sekvensering
Sekvensering av patientprover kommer att utföras i ZIMCLs anläggningar. Efter DNA-extraktion kommer sekvensering av granulocyter såväl som av lymfocyter (kontroll) att utföras. Förutom hel exomsekvensering kommer en panel från SOPHIA GENETICS (som också är tillgänglig för rutindiagnostik) att tillämpas inklusive följande MDS-specifika gener: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Varje patientprov kommer att "bulksekvenseras", vilket innebär att relevanta mutationer detekteras ner till en allelfrekvens på 2 %.
Diagnostiskt test: Tumörimmunologiska undersökningar - multiplexanalyser/kvantitativ polymeraskedjereaktion

Inflammasomaktivering kvantifieras genom analyser av inflammasomassocierade cytokinmönster. Multiplexanalyser för kvantifiering av de inflammasomspecifika cytokinerna kommer att göras från serum såväl som från supernatanter de stimulerade blodkropparna. Cytokinkvantifiering utförs med Luminex FlexMap 3D. Serumcytokinnivåer kommer att kvantifieras parallellt.

Kvantifiering av RNA-expressionsnivåer av inflammasomrelaterade genprodukter kommer att utföras av qPCR från ostimulerade och stimulerade (=kryotub) blodceller. Den nödvändiga RNA-extraktionen kommer att utföras med hjälp av en RNA-extraktionssats.

Diagnostiskt test: flödescytometri
En detaljerad utvärdering av den individuella immunstatusen genomförs genom analys av två specialiserade paneler: Panel A ger en bred översikt över olika immuncellspopulationer, medan panel B identifierar T-cells sup-populationer.
Diagnostiskt test: Metagenomik av avföringsprover
DNA kommer att extraheras från frysta fekala prover med en pärlslagningsmetod med hjälp av ett GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). DNA-kvalitet kommer att bedömas med en Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Efter slutlig utfällning kommer DNA-prover att återsuspenderas i TE-buffert och lagras vid -80 °C för ytterligare sekvenseringsanalys. För detta ändamål kommer sekvenseringsbibliotek att genereras med hjälp av ett Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Bibliotekets kvalitet kommer att bekräftas med en Agilent 4200 TapeStation. Helgenom-hagelgevärssekvensering av fekala prover kommer att utföras på en HiSeq2500-plattform (Illumina).
Diagnostiskt test: Kliniska/demografiska data
Demografiska och kliniska data inkluderar: ålder, ålder vid initial diagnos, kön, diagnos, faktiska komorbiditeter, medicinering vid inkludering i studien, cytogenetiska och molekylära profiler och standardlaboratorieparametrar (blodantal, differentiellt antal leukocyter, biokemi, järnstatus, inflammatoriska markörer som t.ex. CRP, albumin, fibrinogen).
Övrig: Framkallande av HRQoL
Utvärdering av HRQOL, av funktionella aktiviteter och prestationsstatus kommer att göras av patienten och/eller läkaren med hjälp av validerade poäng.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Tidsram
Definition av korrelation mellan molekylära aberrationer och den sterila inflammatoriska tonus
Tidsram: baslinje
baslinje
Definition av hur genetiska avvikelser och tillhörande steril inflammation påverkar hälsorelaterad livskvalitet (HRQoL, t.ex. trötthet) och funktionella aktiviteter hos patienter med MDS, MDS/MPN eller CHIP/CCUS
Tidsram: baslinje
baslinje

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Tidsram
Definition av korrelation mellan steril inflammatorisk tonus med kliniska variabler (t.ex. progression till sekundär akut myeloid leukemi (sAML), komplikationer (t.ex. infektioner) och överlevnad)
Tidsram: baslinje
baslinje

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Sponsor

Medical University Innsbruck

Samarbetspartners

University Hospital, Bonn
Universitätsklinikum Leipzig

Utredare

  • Huvudutredare: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Allmänna publikationer

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

22 januari 2020

Primärt slutförande (Förväntat)

1 januari 2023

Avslutad studie (Förväntat)

1 januari 2023

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

16 mars 2020

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

16 mars 2020

Första postat (Faktisk)

18 mars 2020

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

7 april 2022

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

6 april 2022

Senast verifierad

1 januari 2022

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Nyckelord

Ytterligare relevanta MeSH-villkor

Andra studie-ID-nummer

  • 20200129-2183

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

Obeslutsam

IPD-planbeskrivning

Presentation på konferenser och publicering i peer-reviewed tidskrift

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera