Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Sterilní záněty a molekulární aberace u MDS (InflamGen)

6. dubna 2022 aktualizováno: Medical University Innsbruck

Sterilní zánět a molekulární aberace u myelodysplastického syndromu: determinanty kvality života a zranitelnosti

Cílem této studie je popsat možnou souvislost mezi profily genetických mutací/aberací, zánětlivým tonem a klinickým fenotypem na základě PROM a HRQoL. Kromě lepšího pochopení kauzální korelace mezi genetikou, sterilními zánětlivými procesy a QoL (např. únava) u MDS má tato studie identifikovat potenciální nové biomarkery a nakonec i terapeutické cíle.

Přehled studie

Postavení

Nábor

Podmínky

Intervence / Léčba

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

130

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní záloha kontaktů

  • Jméno: Verena Petzer, MD
  • Telefonní číslo: 82979 0043512504

Studijní místa

  • Rakousko
    • Tyrol
      • Innsbruck, Tyrol, Rakousko, 6020

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Ukázka pravděpodobnosti

Studijní populace

Diagnostika MDS, MDS/MPN na základě aktuální klasifikace WHO. CCUS a CHIP definované Valentem (Valent, Oncotarget, 2018) a Stauderem (Stauder, Blood, 2018)

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Pacientky a pacientky > 18 let
  • Diagnostika MDS, MDS/MPN na základě aktuální klasifikace WHO. CCUS a CHIP definované Valentem (Valent, Oncotarget, 2018) a Stauderem (Stauder, Blood, 2018)
  • Podepsané a datované prohlášení o souhlasu pacienta podle pokynů ICH-GCP

Kritéria vyloučení:

  • Jakékoli jiné onemocnění, ať už fyzické nebo duševní, nebo jakékoli laboratorní abnormality, které brání vyjádření souhlasu pacienta
  • Pacienti s akutní a/nebo nekontrolovanou infekcí, včetně pacientů afebrilních léčených antibiotiky/antifungálními/antivirovými profylaktickými léky
  • Jakékoli již existující autoimunitní onemocnění vyžadující systémovou imunosupresi
  • Steroidní terapie (>10 mg prednisonu/den nebo ekvivalent), bez ohledu na její nutnost, až 4 týdny před zařazením do studie
  • Anamnestická a/nebo současná léčba hypometylačními činidly (HMA) nebo imunomodulačními imidy (IMiD)
  • Stav po alogenní transplantaci kmenových buněk
  • Předchozí nebo probíhající chemoterapie
  • Období těhotenství nebo kojení

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Observační modely: Kohorta
  • Časové perspektivy: Budoucí

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
MDS
  • Pacientky a pacientky ve věku 18 let a starší
  • Diagnostika MDS, MDS/MPN na základě aktuální klasifikace WHO. CCUS a CHIP definované Valentem (Valent, Oncotarget, 2018) a Stauderem (Stauder, Blood, 2018)
Diagnostický test: Sekvenování nové generace
Sekvenování vzorků pacientů bude prováděno v zařízeních ZIMCL. Po extrakci DNA bude provedeno sekvenování granulocytů i lymfocytů (kontrola). Kromě sekvenování celého exomu bude použit panel od SOPHIA GENETICS (který je k dispozici i pro rutinní diagnostiku) zahrnující následující geny specifické pro MDS: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Každý vzorek pacienta bude „hromadně sekvenován“, což znamená, že relevantní mutace jsou detekovány až do frekvence alel 2 %.
Diagnostický test: Tumorimunologická vyšetření - multiplexní testy/kvantitativní polymerázová řetězová reakce

Aktivace zánětu je kvantifikována analýzami vzorců cytokinů spojených s zánětem. Multiplexní testy pro kvantifikaci cytokinů specifických pro zánětlivé buňky budou provedeny ze séra a také ze supernatantů stimulovaných krevních buněk. Kvantifikace cytokinů se provádí pomocí Luminex FlexMap 3D. Paralelně budou kvantifikovány hladiny cytokinů v séru.

Kvantifikace hladin exprese RNA genových produktů souvisejících s zánětem bude provedena pomocí qPCR z nestimulovaných a stimulovaných (=kryotube) krevních buněk. Nezbytná extrakce RNA bude provedena pomocí soupravy pro extrakci RNA.

Diagnostický test: průtoková cytometrie
Podrobné hodnocení individuálního imunitního stavu se provádí analýzou dvou specializovaných panelů: Panel A poskytuje široký přehled o různých populacích imunitních buněk, zatímco Panel B identifikuje sup-populace T-buněk.
Diagnostický test: Metagenomika vzorků stolice
DNA bude extrahována ze zmrazených fekálních vzorků pomocí metody narážení kuliček pomocí GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). Kvalita DNA bude hodnocena pomocí Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Po konečné precipitaci budou vzorky DNA resuspendovány v TE pufru a uloženy při -80 °C pro další sekvenační analýzu. Za tímto účelem budou sekvenační knihovny vytvořeny pomocí Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Kvalita knihovny bude potvrzena pomocí Agilent 4200 TapeStation. Celogenomové sekvenování vzorků stolice bude provedeno na platformě HiSeq2500 (Illumina).
Diagnostický test: Klinická/demografická data
Demografické a klinické údaje zahrnují: věk, věk při počáteční diagnóze, pohlaví, diagnózu, aktuální komorbidity, medikaci při zařazení do studie, cytogenetické a molekulární profily a standardní laboratorní parametry (krevní obraz, diferenciální počet leukocytů, biochemie, stav železa, zánětlivé markery jako např. CRP, albumin, fibrinogen).
Jiný: Vyvolání HRQoL
Hodnocení HRQOL, funkčních aktivit a výkonnostního stavu provede pacient a/nebo lékař pomocí ověřených skóre.
řízení
zdravých osob stejného věku
Diagnostický test: Sekvenování nové generace
Sekvenování vzorků pacientů bude prováděno v zařízeních ZIMCL. Po extrakci DNA bude provedeno sekvenování granulocytů i lymfocytů (kontrola). Kromě sekvenování celého exomu bude použit panel od SOPHIA GENETICS (který je k dispozici i pro rutinní diagnostiku) zahrnující následující geny specifické pro MDS: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Každý vzorek pacienta bude „hromadně sekvenován“, což znamená, že relevantní mutace jsou detekovány až do frekvence alel 2 %.
Diagnostický test: Tumorimunologická vyšetření - multiplexní testy/kvantitativní polymerázová řetězová reakce

Aktivace zánětu je kvantifikována analýzami vzorců cytokinů spojených s zánětem. Multiplexní testy pro kvantifikaci cytokinů specifických pro zánětlivé buňky budou provedeny ze séra a také ze supernatantů stimulovaných krevních buněk. Kvantifikace cytokinů se provádí pomocí Luminex FlexMap 3D. Paralelně budou kvantifikovány hladiny cytokinů v séru.

Kvantifikace hladin exprese RNA genových produktů souvisejících s zánětem bude provedena pomocí qPCR z nestimulovaných a stimulovaných (=kryotube) krevních buněk. Nezbytná extrakce RNA bude provedena pomocí soupravy pro extrakci RNA.

Diagnostický test: průtoková cytometrie
Podrobné hodnocení individuálního imunitního stavu se provádí analýzou dvou specializovaných panelů: Panel A poskytuje široký přehled o různých populacích imunitních buněk, zatímco Panel B identifikuje sup-populace T-buněk.
Diagnostický test: Metagenomika vzorků stolice
DNA bude extrahována ze zmrazených fekálních vzorků pomocí metody narážení kuliček pomocí GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). Kvalita DNA bude hodnocena pomocí Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Po konečné precipitaci budou vzorky DNA resuspendovány v TE pufru a uloženy při -80 °C pro další sekvenační analýzu. Za tímto účelem budou sekvenační knihovny vytvořeny pomocí Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Kvalita knihovny bude potvrzena pomocí Agilent 4200 TapeStation. Celogenomové sekvenování vzorků stolice bude provedeno na platformě HiSeq2500 (Illumina).
Diagnostický test: Klinická/demografická data
Demografické a klinické údaje zahrnují: věk, věk při počáteční diagnóze, pohlaví, diagnózu, aktuální komorbidity, medikaci při zařazení do studie, cytogenetické a molekulární profily a standardní laboratorní parametry (krevní obraz, diferenciální počet leukocytů, biochemie, stav železa, zánětlivé markery jako např. CRP, albumin, fibrinogen).
Jiný: Vyvolání HRQoL
Hodnocení HRQOL, funkčních aktivit a výkonnostního stavu provede pacient a/nebo lékař pomocí ověřených skóre.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Časové okno
Definice korelace mezi molekulárními aberacemi a sterilním zánětlivým tonem
Časové okno: základní linie
základní linie
Definice toho, jak genetické aberace a související sterilní zánět ovlivňují kvalitu života související se zdravím (HRQoL, např. únava) a funkční aktivity u pacientů s MDS, MDS/MPN nebo CHIP/CCUS
Časové okno: základní linie
základní linie

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Časové okno
Definice korelace sterilního zánětlivého tonu s klinickými proměnnými (např. progrese do sekundární akutní myeloidní leukémie (sAML), komplikace (např. infekce) a přežití)
Časové okno: základní linie
základní linie

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Medical University Innsbruck

Spolupracovníci

University Hospital, Bonn
Universitätsklinikum Leipzig

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Obecné publikace

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

22. ledna 2020

Primární dokončení (Očekávaný)

1. ledna 2023

Dokončení studie (Očekávaný)

1. ledna 2023

Termíny zápisu do studia

První předloženo

16. března 2020

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

16. března 2020

První zveřejněno (Aktuální)

18. března 2020

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

7. dubna 2022

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

6. dubna 2022

Naposledy ověřeno

1. ledna 2022

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 20200129-2183

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

Nerozhodný

Popis plánu IPD

Prezentace na konferencích a publikace v recenzovaném časopise

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Myelodysplastické syndromy

Klinické studie na Sekvenování nové generace

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Panama

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

Předplatit