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Infiammazione sterile e aberrazioni molecolari nelle MDS (InflamGen)

6 aprile 2022 aggiornato da: Medical University Innsbruck

Infiammazione sterile e aberrazioni molecolari nella sindrome mielodisplastica: determinanti della qualità della vita e della vulnerabilità

L'obiettivo di questo studio è la descrizione della possibile associazione tra mutazione genetica/profili di aberrazione, tono infiammatorio e fenotipo clinico sulla base di PROM e HRQoL. Oltre ad acquisire una migliore comprensione della correlazione causale tra genetica, processi infiammatori sterili e QoL (ad es. fatica) nelle MDS, questo studio dovrebbe identificare potenziali nuovi biomarcatori e, in ultima analisi, bersagli terapeutici.

Panoramica dello studio

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

130

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

  • Nome: Verena Petzer, MD
  • Numero di telefono: 82979 0043512504

Luoghi di studio

    • Tyrol
      • Innsbruck, Tyrol, Austria, 6020
        • Reclutamento
        • Medical University of Innsbruck
        • Contatto:
        • Contatto:

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

18 anni e precedenti (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione di probabilità

Popolazione di studio

Diagnosi di MDS, MDS/MPN basata sull'attuale classificazione dell'OMS. CCUS e CHIP definiti da Valent (Valent, Oncotarget, 2018) e da Stauder (Stauder, Blood, 2018)

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Pazienti di sesso femminile e maschile > 18 anni
  • Diagnosi di MDS, MDS/MPN basata sull'attuale classificazione dell'OMS. CCUS e CHIP definiti da Valent (Valent, Oncotarget, 2018) e da Stauder (Stauder, Blood, 2018)
  • Dichiarazione di consenso firmata e datata del paziente secondo le linee guida ICH-GCP

Criteri di esclusione:

  • Qualsiasi altra malattia, sia fisica che mentale, o qualsiasi anomalia di laboratorio che impedisca una dichiarazione di consenso da parte del paziente
  • Pazienti con un'infezione acuta e/o incontrollata, compresi i pazienti afebbrili in trattamento con farmaci profilattici antibiotici/antimicotici/antivirali
  • Qualsiasi malattia autoimmune preesistente che richieda un'immunosoppressione sistemica
  • Terapia steroidea (>10 mg di Prednison/giorno o equivalente), indipendentemente dalla sua necessità fino a 4 settimane prima dell'inclusione nello studio
  • Terapia anamnestica e/o in corso con agenti ipometilanti (HMA) o farmaci immidici immunomodulatori (IMiD)
  • Stato post trapianto di cellule staminali allogeniche
  • Chemioterapia precedente o in corso
  • Periodo di gravidanza o allattamento

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Coorte
  • Prospettive temporali: Prospettiva

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
MDS
  • Pazienti di sesso femminile e maschile di età pari o superiore a 18 anni
  • Diagnosi di MDS, MDS/MPN basata sull'attuale classificazione dell'OMS. CCUS e CHIP definiti da Valent (Valent, Oncotarget, 2018) e da Stauder (Stauder, Blood, 2018)
Il sequenziamento dei campioni dei pazienti sarà eseguito nelle strutture di ZIMCL. Dopo l'estrazione del DNA, verrà effettuato il sequenziamento dei granulociti e dei linfociti (controllo). Oltre al sequenziamento dell'intero esoma, verrà applicato un pannello di SOPHIA GENETICS (disponibile anche per la diagnostica di routine) che include i seguenti geni specifici per MDS: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Ogni campione del paziente sarà "sequenziato in blocco", il che significa che le mutazioni rilevanti vengono rilevate fino a una frequenza allelica del 2%.

L'attivazione dell'inflammasoma è quantificata dall'analisi dei modelli di citochine associati all'inflammasoma. Saranno effettuate analisi multiplex per la quantificazione delle citochine specifiche dell'inflammasoma sia dal siero che dai supernatanti delle cellule ematiche stimolate. La quantificazione delle citochine viene eseguita con Luminex FlexMap 3D. I livelli sierici di citochine saranno quantificati in parallelo.

La quantificazione dei livelli di espressione dell'RNA dei prodotti genici correlati all'inflammasoma sarà eseguita mediante qPCR da cellule del sangue non stimolate e stimolate (= criotubi). L'estrazione dell'RNA necessaria verrà eseguita utilizzando un kit di estrazione dell'RNA.

Una valutazione dettagliata dello stato immunitario individuale viene condotta dall'analisi di due pannelli specializzati: il pannello A fornisce un'ampia panoramica su varie popolazioni di cellule immunitarie, mentre il pannello B identifica le sup-popolazioni di cellule T.
Il DNA verrà estratto da campioni fecali congelati applicando un metodo di bead-beating utilizzando un kit di isolamento del DNA GNOME (MP Biomedicals). La qualità del DNA sarà valutata utilizzando una Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Dopo la precipitazione finale, i campioni di DNA saranno risospesi in tampone TE e conservati a -80 °C per ulteriori analisi di sequenziamento. A tal fine, le librerie di sequenziamento verranno generate utilizzando un Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). La qualità della libreria verrà confermata utilizzando una TapeStation Agilent 4200. Il sequenziamento shotgun dell'intero genoma di campioni fecali sarà effettuato su una piattaforma HiSeq2500 (Illumina).
I dati demografici e clinici includono: età, età alla diagnosi iniziale, sesso, diagnosi, comorbidità effettive, farmaci all'inclusione nello studio, profili citogenetici e molecolari e parametri di laboratorio standard (emocromo, conta leucocitaria differenziale, biochimica, stato del ferro, marcatori infiammatori come PCR, albumina, fibrinogeno).
La valutazione della HRQOL, delle attività funzionali e del performance status sarà effettuata dal paziente e/o dal medico utilizzando punteggi validati.
controllo
persone sane della stessa età
Il sequenziamento dei campioni dei pazienti sarà eseguito nelle strutture di ZIMCL. Dopo l'estrazione del DNA, verrà effettuato il sequenziamento dei granulociti e dei linfociti (controllo). Oltre al sequenziamento dell'intero esoma, verrà applicato un pannello di SOPHIA GENETICS (disponibile anche per la diagnostica di routine) che include i seguenti geni specifici per MDS: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Ogni campione del paziente sarà "sequenziato in blocco", il che significa che le mutazioni rilevanti vengono rilevate fino a una frequenza allelica del 2%.

L'attivazione dell'inflammasoma è quantificata dall'analisi dei modelli di citochine associati all'inflammasoma. Saranno effettuate analisi multiplex per la quantificazione delle citochine specifiche dell'inflammasoma sia dal siero che dai supernatanti delle cellule ematiche stimolate. La quantificazione delle citochine viene eseguita con Luminex FlexMap 3D. I livelli sierici di citochine saranno quantificati in parallelo.

La quantificazione dei livelli di espressione dell'RNA dei prodotti genici correlati all'inflammasoma sarà eseguita mediante qPCR da cellule del sangue non stimolate e stimolate (= criotubi). L'estrazione dell'RNA necessaria verrà eseguita utilizzando un kit di estrazione dell'RNA.

Una valutazione dettagliata dello stato immunitario individuale viene condotta dall'analisi di due pannelli specializzati: il pannello A fornisce un'ampia panoramica su varie popolazioni di cellule immunitarie, mentre il pannello B identifica le sup-popolazioni di cellule T.
Il DNA verrà estratto da campioni fecali congelati applicando un metodo di bead-beating utilizzando un kit di isolamento del DNA GNOME (MP Biomedicals). La qualità del DNA sarà valutata utilizzando una Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Dopo la precipitazione finale, i campioni di DNA saranno risospesi in tampone TE e conservati a -80 °C per ulteriori analisi di sequenziamento. A tal fine, le librerie di sequenziamento verranno generate utilizzando un Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). La qualità della libreria verrà confermata utilizzando una TapeStation Agilent 4200. Il sequenziamento shotgun dell'intero genoma di campioni fecali sarà effettuato su una piattaforma HiSeq2500 (Illumina).
I dati demografici e clinici includono: età, età alla diagnosi iniziale, sesso, diagnosi, comorbidità effettive, farmaci all'inclusione nello studio, profili citogenetici e molecolari e parametri di laboratorio standard (emocromo, conta leucocitaria differenziale, biochimica, stato del ferro, marcatori infiammatori come PCR, albumina, fibrinogeno).
La valutazione della HRQOL, delle attività funzionali e del performance status sarà effettuata dal paziente e/o dal medico utilizzando punteggi validati.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Lasso di tempo
Definizione di correlazione tra aberrazioni molecolari e tono infiammatorio sterile
Lasso di tempo: linea di base
linea di base
Definizione di come le aberrazioni genetiche e l'infiammazione sterile associata influiscono sulla qualità della vita correlata alla salute (HRQoL, ad es. affaticamento) e sulle attività funzionali in pazienti con MDS, MDS/MPN o CHIP/CCUS
Lasso di tempo: linea di base
linea di base

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Lasso di tempo
Definizione della correlazione del tono infiammatorio sterile con variabili cliniche (ad es. progressione a leucemia mieloide acuta secondaria (sAML), complicanze (ad es. infezioni) e sopravvivenza)
Lasso di tempo: linea di base
linea di base

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

22 gennaio 2020

Completamento primario (Anticipato)

1 gennaio 2023

Completamento dello studio (Anticipato)

1 gennaio 2023

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

16 marzo 2020

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

16 marzo 2020

Primo Inserito (Effettivo)

18 marzo 2020

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

7 aprile 2022

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

6 aprile 2022

Ultimo verificato

1 gennaio 2022

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

Indeciso

Descrizione del piano IPD

Presentazione a convegni e pubblicazione su rivista peer-reviewed

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Sequenziamento di nuova generazione

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