Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Steriili tulehdus ja molekyylipoikkeamat MDS:ssä (InflamGen)

keskiviikko 6. huhtikuuta 2022 päivittänyt: Medical University Innsbruck

Steriili tulehdus ja molekyylipoikkeamat myelodysplastisessa oireyhtymässä: elämänlaadun ja haavoittuvuuden määräävät tekijät

Tämän tutkimuksen tavoitteena on kuvata mahdollista yhteyttä geneettisten mutaatio-/poikkeavuusprofiilien, tulehduksellisen tonuksen ja kliinisen fenotyypin välillä PROM:ien ja HRQoL:n perusteella. Sen lisäksi, että saamme paremman ymmärryksen genetiikan, steriilien tulehdusprosessien ja elämänlaadun välisestä kausaalisesta korrelaatiosta (esim. väsymys) MDS:ssä, tämän tutkimuksen oletetaan tunnistavan mahdollisia uusia biomarkkereita ja viime kädessä terapeuttisia kohteita.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Rekrytointi

Ehdot

Interventio / Hoito

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Odotettu)

130

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskeluyhteys

Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi

  • Nimi: Verena Petzer, MD
  • Puhelinnumero: 82979 0043512504

Opiskelupaikat

  • Itävalta
    • Tyrol
      • Innsbruck, Tyrol, Itävalta, 6020
        • Rekrytointi
        • Medical University of Innsbruck
        • Ottaa yhteyttä:
        • Ottaa yhteyttä:

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

MDS, MDS/MPN-diagnoosi perustuu nykyiseen WHO:n luokitukseen. Valentin (Valent, Oncotarget, 2018) ja Stauderin (Stauder, Blood, 2018) määrittelemät CCUS ja CHIP

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Nais- ja miespotilaat > 18 vuotta
  • MDS, MDS/MPN-diagnoosi perustuu nykyiseen WHO:n luokitukseen. Valentin (Valent, Oncotarget, 2018) ja Stauderin (Stauder, Blood, 2018) määrittelemät CCUS ja CHIP
  • Potilaan allekirjoittama ja päivätty suostumusilmoitus ICH-GCP-ohjeiden mukaisesti

Poissulkemiskriteerit:

  • Mikä tahansa muu fyysinen tai henkinen sairaus tai mikä tahansa laboratoriovirhe, joka estää potilaan suostumuksen ilmoittamisen
  • Potilaat, joilla on akuutti ja/tai hallitsematon infektio, mukaan lukien potilaat, jotka ovat kuumeisia profylaktisella antibiootti-/sieni-/viruslääkkeillä
  • Mikä tahansa olemassa oleva autoimmuunisairaus, joka vaatii systeemistä immunosuppressiota
  • Steroidihoito (>10mg Prednisonia/vrk tai vastaava) sen tarpeellisuudesta riippumatta enintään 4 viikkoa ennen tutkimukseen ottamista
  • Anamnestinen ja/tai nykyinen hoito hypometyloivilla aineilla (HMA) tai immunomoduloivilla imidilääkkeillä (IMiD)
  • Tila allogeenisen kantasolusiirron jälkeen
  • Aiempi tai meneillään oleva kemoterapia
  • Raskaus tai imetysaika

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Havaintomallit: Kohortti
  • Aikanäkymät: Tulevaisuuden

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Interventio / Hoito
MDS
  • 18-vuotiaat ja sitä vanhemmat nais- ja miespotilaat
  • MDS, MDS/MPN-diagnoosi perustuu nykyiseen WHO:n luokitukseen. Valentin (Valent, Oncotarget, 2018) ja Stauderin (Stauder, Blood, 2018) määrittelemät CCUS ja CHIP
Diagnostinen testi: Seuraavan sukupolven sekvensointi
Potilasnäytteiden sekvensointi suoritetaan ZIMCL:n tiloissa. DNA-uuton jälkeen suoritetaan granulosyyttien sekä lymfosyyttien sekvensointi (kontrolli). Koko eksomin sekvensoinnin lisäksi käytetään SOPHIA GENETICSin paneelia (joka on saatavilla myös rutiinidiagnostiikkaan), joka sisältää seuraavat MDS-spesifiset geenit: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Jokainen potilasnäyte "bulk-sekvensoidaan", mikä tarkoittaa, että asiaankuuluvat mutaatiot havaitaan alle 2 %:n alleelitaajuuteen asti.
Diagnostinen testi: Tumorimmunologiset tutkimukset - multipleksimääritykset/kvantitatiivinen polymeraasiketjureaktio

Tulehdusaktivaatio kvantifioidaan tulehdukseen liittyvien sytokiinimallien analyyseillä. Multipleksimääritykset tulehdukselle spesifisten sytokiinien kvantifiointia varten tehdään seerumista sekä supernatanteista, jotka ovat stimuloituja verisoluja. Sytokiinien kvantifiointi suoritetaan Luminex FlexMap 3D:llä. Seerumin sytokiinitasot kvantifioidaan samanaikaisesti.

Tulehdukseen liittyvien geenituotteiden RNA:n ilmentymistasojen kvantifiointi suoritetaan stimuloimattomien ja stimuloitujen (=kryoputki) verisolujen qPCR:illä. Tarvittava RNA-uutto suoritetaan käyttämällä RNA-uuttopakkausta.

Diagnostinen testi: virtaussytometria
Yksittäisen immuunitilan yksityiskohtainen arviointi suoritetaan kahden erikoistuneen paneelin analyysillä: Paneeli A tarjoaa laajan yleiskatsauksen erilaisista immuunisolupopulaatioista, kun taas paneeli B tunnistaa T-solupopulaatiot.
Diagnostinen testi: Ulostenäytteiden metagenomiikka
DNA uutetaan jäädytetyistä ulostenäytteistä käyttämällä helmiä hakkaavaa menetelmää käyttäen GNOME DNA Isolation Kit -sarjaa (MP Biomedicals). DNA:n laatu arvioidaan Agilent 4200 TapeStationilla (Agilent Technologies). Lopullisen saostuksen jälkeen DNA-näytteet suspendoidaan uudelleen TE-puskuriin ja säilytetään -80 °C:ssa lisäsekvensointianalyysiä varten. Tätä tarkoitusta varten luodaan sekvensointikirjastoja käyttämällä Nextera XT DNA Sample Prep Kit -pakkausta (Illumina). Kirjaston laatu varmistetaan Agilent 4200 TapeStationilla. Ulostenäytteiden koko genomin haulikkosekvensointi suoritetaan HiSeq2500-alustalla (Illumina).
Diagnostinen testi: Kliiniset/demografiset tiedot
Demografisia ja kliinisiä tietoja ovat: ikä, ikä alkudiagnoosissa, sukupuoli, diagnoosi, todelliset liitännäissairaudet, lääkitys tutkimukseen sisällytettäessä, sytogeneettiset ja molekyyliprofiilit ja standardilaboratorioparametrit (veriarvo, leukosyyttien erotus, biokemia, rautastatus, tulehdusmerkit, kuten CRP, albumiini, fibrinogeeni).
Muut: HRQoL:n saaminen
Potilas ja/tai lääkäri arvioi HRQOL:n, toiminnalliset toiminnot ja suorituskyvyn käyttämällä validoituja pisteitä.
ohjata
ikäisiä terveitä ihmisiä
Diagnostinen testi: Seuraavan sukupolven sekvensointi
Potilasnäytteiden sekvensointi suoritetaan ZIMCL:n tiloissa. DNA-uuton jälkeen suoritetaan granulosyyttien sekä lymfosyyttien sekvensointi (kontrolli). Koko eksomin sekvensoinnin lisäksi käytetään SOPHIA GENETICSin paneelia (joka on saatavilla myös rutiinidiagnostiikkaan), joka sisältää seuraavat MDS-spesifiset geenit: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Jokainen potilasnäyte "bulk-sekvensoidaan", mikä tarkoittaa, että asiaankuuluvat mutaatiot havaitaan alle 2 %:n alleelitaajuuteen asti.
Diagnostinen testi: Tumorimmunologiset tutkimukset - multipleksimääritykset/kvantitatiivinen polymeraasiketjureaktio

Tulehdusaktivaatio kvantifioidaan tulehdukseen liittyvien sytokiinimallien analyyseillä. Multipleksimääritykset tulehdukselle spesifisten sytokiinien kvantifiointia varten tehdään seerumista sekä supernatanteista, jotka ovat stimuloituja verisoluja. Sytokiinien kvantifiointi suoritetaan Luminex FlexMap 3D:llä. Seerumin sytokiinitasot kvantifioidaan samanaikaisesti.

Tulehdukseen liittyvien geenituotteiden RNA:n ilmentymistasojen kvantifiointi suoritetaan stimuloimattomien ja stimuloitujen (=kryoputki) verisolujen qPCR:illä. Tarvittava RNA-uutto suoritetaan käyttämällä RNA-uuttopakkausta.

Diagnostinen testi: virtaussytometria
Yksittäisen immuunitilan yksityiskohtainen arviointi suoritetaan kahden erikoistuneen paneelin analyysillä: Paneeli A tarjoaa laajan yleiskatsauksen erilaisista immuunisolupopulaatioista, kun taas paneeli B tunnistaa T-solupopulaatiot.
Diagnostinen testi: Ulostenäytteiden metagenomiikka
DNA uutetaan jäädytetyistä ulostenäytteistä käyttämällä helmiä hakkaavaa menetelmää käyttäen GNOME DNA Isolation Kit -sarjaa (MP Biomedicals). DNA:n laatu arvioidaan Agilent 4200 TapeStationilla (Agilent Technologies). Lopullisen saostuksen jälkeen DNA-näytteet suspendoidaan uudelleen TE-puskuriin ja säilytetään -80 °C:ssa lisäsekvensointianalyysiä varten. Tätä tarkoitusta varten luodaan sekvensointikirjastoja käyttämällä Nextera XT DNA Sample Prep Kit -pakkausta (Illumina). Kirjaston laatu varmistetaan Agilent 4200 TapeStationilla. Ulostenäytteiden koko genomin haulikkosekvensointi suoritetaan HiSeq2500-alustalla (Illumina).
Diagnostinen testi: Kliiniset/demografiset tiedot
Demografisia ja kliinisiä tietoja ovat: ikä, ikä alkudiagnoosissa, sukupuoli, diagnoosi, todelliset liitännäissairaudet, lääkitys tutkimukseen sisällytettäessä, sytogeneettiset ja molekyyliprofiilit ja standardilaboratorioparametrit (veriarvo, leukosyyttien erotus, biokemia, rautastatus, tulehdusmerkit, kuten CRP, albumiini, fibrinogeeni).
Muut: HRQoL:n saaminen
Potilas ja/tai lääkäri arvioi HRQOL:n, toiminnalliset toiminnot ja suorituskyvyn käyttämällä validoituja pisteitä.

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Aikaikkuna
Molekyylipoikkeamien ja steriilin tulehduksellisen tonuksen välinen korrelaatio
Aikaikkuna: perusviiva
perusviiva
Määrittele, kuinka geneettiset poikkeamat ja niihin liittyvät steriilit tulehdukset vaikuttavat terveyteen liittyvään elämänlaatuun (HRQoL, esim. väsymys) ja toiminnallisiin aktiviteetteihin potilailla, joilla on MDS, MDS/MPN tai CHIP/CCUS
Aikaikkuna: perusviiva
perusviiva

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Aikaikkuna
Steriilin tulehduksellisen tonuksen korrelaation määritelmä kliinisten muuttujien kanssa (esim. eteneminen sekundaariseen akuuttiin myelooiseen leukemiaan (sAML), komplikaatioihin (esim. infektioihin) ja eloonjäämiseen)
Aikaikkuna: perusviiva
perusviiva

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

Medical University Innsbruck

Yhteistyökumppanit

University Hospital, Bonn
Universitätsklinikum Leipzig

Tutkijat

  • Päätutkija: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä

Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.

Yleiset julkaisut

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Keskiviikko 22. tammikuuta 2020

Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)

Sunnuntai 1. tammikuuta 2023

Opintojen valmistuminen (Odotettu)

Sunnuntai 1. tammikuuta 2023

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Maanantai 16. maaliskuuta 2020

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 16. maaliskuuta 2020

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Keskiviikko 18. maaliskuuta 2020

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Torstai 7. huhtikuuta 2022

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Keskiviikko 6. huhtikuuta 2022

Viimeksi vahvistettu

Lauantai 1. tammikuuta 2022

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Avainsanat

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • 20200129-2183

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

Päättämätön

IPD-suunnitelman kuvaus

Esittely konferensseissa ja julkaisu vertaisarvioidussa lehdessä

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Myelodysplastiset oireyhtymät

Kliiniset tutkimukset Seuraavan sukupolven sekvensointi

Hae vastaavia kokeiluja

Sponsorit ja yhteistyökumppanit

Sairaudet

Huumeiden interventiot

CROs by country

CROs in Pakistan

Ehdot

Harvinaiset sairaudet

Huumeiden interventiot

Ravintolisät

Sponsori / yhteistyökumppanit

Sijainnit

Tilaa