- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT04313231
Steril inflammation og molekylære aberrationer i MDS (InflamGen)
Steril inflammation og molekylære aberrationer i myelodysplastisk syndrom: Determinanter for livskvalitet og sårbarhed
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
- Diagnostisk test: Næste generations sekvensering
- Diagnostisk test: Tumorimmunologiske undersøgelser - multiplex assays/kvantitativ polymerasekædereaktion
- Diagnostisk test: flowcytometri
- Diagnostisk test: Metagenomi af afføringsprøver
- Diagnostisk test: Kliniske/demografiske data
- Andet: Fremkaldelse af HRQoL
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Domink Wolf, Univ.Prof.
- Telefonnummer: 24003 0043512504
- E-mail: dominik.wolf@i-med.ac.at
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Verena Petzer, MD
- Telefonnummer: 82979 0043512504
Studiesteder
-
-
Tyrol
-
Innsbruck, Tyrol, Østrig, 6020
- Rekruttering
- Medical University of Innsbruck
-
Kontakt:
- Dominik Wolf, Univ.Prof.
- Telefonnummer: 24003 0043512504
- E-mail: dominik.wolf@i-med.ac.at
-
Kontakt:
- Verena Petzer, MD
- Telefonnummer: 82979 +43-512-504
- E-mail: verena.petzer@i-med.ac.at
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Kvindelige og mandlige patienter > 18 år
- MDS, MDS/MPN diagnose baseret på nuværende WHO klassifikation. CCUS og CHIP defineret af Valent (Valent, Oncotarget, 2018) og af Stauder (Stauder, Blood, 2018)
- Underskrevet og dateret samtykkeerklæring fra patienten i henhold til ICH-GCP Guidelines
Ekskluderingskriterier:
- Enhver anden sygdom, hvad enten den er fysisk eller psykisk, eller laboratorieabnormiteter, der forhindrer en erklæring om samtykke fra patienten
- Patienter med en akut og/eller ukontrolleret infektion, herunder patienter, der er afebrile under behandling med antibiotika/svampemidler/antiviral profylaktisk medicin
- Enhver allerede eksisterende autoimmun sygdom, der kræver en systemisk immunsuppression
- Steroidbehandling (>10 mg Prednison/dag eller tilsvarende), uanset dets nødvendighed op til 4 uger før inklusion i undersøgelsen
- Anamnestisk og/eller aktuel behandling med hypomethylerende midler (HMA) eller immunmodulerende imidlægemidler (IMiD'er)
- Status efter allogen stamcelletransplantation
- Tidligere eller igangværende kemoterapi
- Graviditet eller ammeperiode
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
MDS
|
Sekventering af patientprøver vil blive udført i ZIMCL's faciliteter.
Efter DNA-ekstraktion vil sekventering af granulocytter samt af lymfocytter (kontrol) blive udført.
Ud over hel exome-sekventering vil et panel fra SOPHIA GENETICS (som også er tilgængeligt til rutinediagnostik) blive anvendt, herunder følgende MDS-specifikke gener: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR.
Hver patientprøve vil blive "bulk-sekventeret", hvilket betyder, at relevante mutationer detekteres ned til en allelfrekvens på 2 %.
Inflammasomaktivering kvantificeres ved analyser af inflammasomassocierede cytokinmønstre. Multiplex assays til kvantificering af de inflammasom-specifikke cytokiner vil blive udført fra serum såvel som fra supernatanter de stimulerede blodceller. Cytokin kvantificering udføres med Luminex FlexMap 3D. Serumcytokinniveauer vil blive kvantificeret parallelt. Kvantificering af RNA-ekspressionsniveauer af inflammasom-relaterede genprodukter vil blive udført af qPCR'er fra ustimulerede og stimulerede (=kryorør) blodceller. Den nødvendige RNA-ekstraktion vil blive udført ved hjælp af et RNA-ekstraktionssæt.
En detaljeret evaluering af den individuelle immunstatus udføres ved analyse af to specialiserede paneler: Panel A giver et bredt overblik over forskellige immuncellepopulationer, mens panel B identificerer T-celle sup-populationer.
DNA vil blive ekstraheret fra frosne fækale prøver ved at anvende en perleslåningsmetode ved hjælp af et GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals).
DNA-kvaliteten vil blive vurderet ved hjælp af en Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies).
Efter endelig præcipitation vil DNA-prøver blive resuspenderet i TE-buffer og opbevaret ved -80 °C til yderligere sekventeringsanalyse.
Til dette formål vil sekventeringsbiblioteker blive genereret ved hjælp af et Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina).
Bibliotekets kvalitet vil blive bekræftet ved hjælp af en Agilent 4200 TapeStation.
Helgenom-haglgeværsekventering af fækale prøver vil blive udført på en HiSeq2500-platform (Illumina).
Demografiske og kliniske data omfatter: alder, alder ved indledende diagnose, køn, diagnose, faktiske komorbiditeter, medicin ved optagelse i undersøgelsen, cytogenetiske og molekylære profiler og standard laboratorieparametre (blodtal, differentielt leukocyttal, biokemi, jernstatus, inflammatoriske markører som f.eks. CRP, albumin, fibrinogen).
Evaluering af HRQOL, af funktionelle aktiviteter og præstationsstatus vil blive udført af patienten og/eller lægen ved hjælp af validerede scores.
|
|
styring
aldersvarende raske personer
|
Sekventering af patientprøver vil blive udført i ZIMCL's faciliteter.
Efter DNA-ekstraktion vil sekventering af granulocytter samt af lymfocytter (kontrol) blive udført.
Ud over hel exome-sekventering vil et panel fra SOPHIA GENETICS (som også er tilgængeligt til rutinediagnostik) blive anvendt, herunder følgende MDS-specifikke gener: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR.
Hver patientprøve vil blive "bulk-sekventeret", hvilket betyder, at relevante mutationer detekteres ned til en allelfrekvens på 2 %.
Inflammasomaktivering kvantificeres ved analyser af inflammasomassocierede cytokinmønstre. Multiplex assays til kvantificering af de inflammasom-specifikke cytokiner vil blive udført fra serum såvel som fra supernatanter de stimulerede blodceller. Cytokin kvantificering udføres med Luminex FlexMap 3D. Serumcytokinniveauer vil blive kvantificeret parallelt. Kvantificering af RNA-ekspressionsniveauer af inflammasom-relaterede genprodukter vil blive udført af qPCR'er fra ustimulerede og stimulerede (=kryorør) blodceller. Den nødvendige RNA-ekstraktion vil blive udført ved hjælp af et RNA-ekstraktionssæt.
En detaljeret evaluering af den individuelle immunstatus udføres ved analyse af to specialiserede paneler: Panel A giver et bredt overblik over forskellige immuncellepopulationer, mens panel B identificerer T-celle sup-populationer.
DNA vil blive ekstraheret fra frosne fækale prøver ved at anvende en perleslåningsmetode ved hjælp af et GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals).
DNA-kvaliteten vil blive vurderet ved hjælp af en Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies).
Efter endelig præcipitation vil DNA-prøver blive resuspenderet i TE-buffer og opbevaret ved -80 °C til yderligere sekventeringsanalyse.
Til dette formål vil sekventeringsbiblioteker blive genereret ved hjælp af et Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina).
Bibliotekets kvalitet vil blive bekræftet ved hjælp af en Agilent 4200 TapeStation.
Helgenom-haglgeværsekventering af fækale prøver vil blive udført på en HiSeq2500-platform (Illumina).
Demografiske og kliniske data omfatter: alder, alder ved indledende diagnose, køn, diagnose, faktiske komorbiditeter, medicin ved optagelse i undersøgelsen, cytogenetiske og molekylære profiler og standard laboratorieparametre (blodtal, differentielt leukocyttal, biokemi, jernstatus, inflammatoriske markører som f.eks. CRP, albumin, fibrinogen).
Evaluering af HRQOL, af funktionelle aktiviteter og præstationsstatus vil blive udført af patienten og/eller lægen ved hjælp af validerede scores.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Definition af sammenhæng mellem molekylære aberrationer og den sterile inflammatoriske tonus
Tidsramme: baseline
|
baseline
|
|
Definition af, hvordan genetiske aberrationer og tilhørende steril inflammation påvirker sundhedsrelateret livskvalitet (HRQoL, f.eks. træthed) og funktionelle aktiviteter hos patienter med MDS, MDS/MPN eller CHIP/CCUS
Tidsramme: baseline
|
baseline
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tidsramme |
|---|---|
|
Definition af korrelation af steril inflammatorisk tonus med kliniske variabler (fx progression til sekundær akut myeloid leukæmi (sAML), komplikationer (f.eks. infektioner) og overlevelse)
Tidsramme: baseline
|
baseline
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Valent P, Stauder R, Theurl I, Geissler K, Sliwa T, Sperr WR, Bettelheim P, Sill H, Pfeilstocker M. Diagnosis, management and response criteria of iron overload in myelodysplastic syndromes (MDS): updated recommendations of the Austrian MDS platform. Expert Rev Hematol. 2018 Feb;11(2):109-116. doi: 10.1080/17474086.2018.1420473. Epub 2018 Jan 2.
- Stauder R, Valent P, Theurl I. Anemia at older age: etiologies, clinical implications, and management. Blood. 2018 Feb 1;131(5):505-514. doi: 10.1182/blood-2017-07-746446. Epub 2017 Nov 15.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Forventet)
Studieafslutning (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 20200129-2183
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Myelodysplastiske syndromer
-
GlaxoSmithKlineIkke rekrutterer endnu
-
Unravel Biosciences, Inc.RekrutteringPitt Hopkins syndromColombia
-
Helen Keller Eye Research FoundationFive Lakes Clinical Research Consulting, LLCRekrutteringStickler syndrom type 2 | Stickler syndrom type 1Forenede Stater
-
University of California, Los AngelesBoston Children's Hospital; Duke University; Children's Hospital Medical...RekrutteringBohring-Opitz syndrom | ASXL1 genmutation | Shashi-Pena syndrom | ASXL2-genmutation | Bainbridge-Ropers syndrom | ASXL3 genmutationForenede Stater
-
Neuren Pharmaceuticals LimitedRekrutteringPhelan-McDermid syndromForenede Stater
-
University of California, DavisNational Cancer Institute (NCI); Celgene; Pharmacyclics LLC.AfsluttetTidligere behandlet myelodysplastisk syndrom | Myelodysplastisk syndrom | Terapi-relateret myelodysplastisk syndrom | Sekundært myelodysplastisk syndrom | Refraktært højrisiko myelodysplastisk syndromForenede Stater
-
Neuren Pharmaceuticals LimitedRekrutteringPhelan-McDermid syndromForenede Stater
-
Riphah International UniversityAfsluttet
-
Shaare Zedek Medical CenterUkendtPræmenstruelt syndrom - PMS
-
Riphah International UniversityAfsluttet
Kliniske forsøg med Næste generations sekvensering
-
Jagiellonian UniversityRekruttering
-
University Hospital TuebingenAfsluttetSjældne sygdomme | Genetisk dispositionTyskland
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteNational Cancer Institute (NCI); Dana-Farber Cancer InstituteAfsluttetIkke-småcellet lungekræftForenede Stater
-
Imperial College London Diabetes CentreUkendtMendelske lidelser | Genetisk lidelse | Roman mutation | Arvelig lidelse | De Novo Mutation | Arvelig sygdom | Enkelt-gen-defekterForenede Arabiske Emirater
-
Ambry GeneticsBeth Israel Deaconess Medical Center; HonorHealth Research Institute; University...AfsluttetDuktalt adenokarcinom i bugspytkirtlenForenede Stater
-
Peking Union Medical CollegeUkendtBryst Neoplasma Kvinde | Mutation | TerapeutikKina
-
Foundation for Innovative New Diagnostics, SwitzerlandAfsluttetTuberkulose, multiresistentGeorgien, Indien, Sydafrika
-
ReprogeneticsReproductive Medicine Lab, LLCUkendt
-
University Hospital, EssenNoscendo GmbH, Germany; Health Economics and Health Care Management, Bielefeld... og andre samarbejdspartnereAfsluttetSepsis | Septisk chokTyskland
-
Tianjin Medical University Second HospitalUkendt