Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Steril inflammation og molekylære aberrationer i MDS (InflamGen)

6. april 2022 opdateret af: Medical University Innsbruck

Steril inflammation og molekylære aberrationer i myelodysplastisk syndrom: Determinanter for livskvalitet og sårbarhed

Formålet med denne undersøgelse er beskrivelsen af ​​den mulige sammenhæng mellem genetiske mutations-/aberrationsprofiler, inflammatorisk tonus og klinisk fænotype baseret på PROM'er og HRQoL. Udover at få en bedre forståelse af årsagssammenhængen mellem genetik, sterile inflammatoriske processer og QoL (f.eks. træthed) i MDS, formodes denne undersøgelse at identificere potentielle nye biomarkører og i sidste ende terapeutiske mål.

Studieoversigt

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

130

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Undersøgelse Kontakt Backup

  • Navn: Verena Petzer, MD
  • Telefonnummer: 82979 0043512504

Studiesteder

    • Tyrol
      • Innsbruck, Tyrol, Østrig, 6020

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år og ældre (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

MDS, MDS/MPN diagnose baseret på nuværende WHO klassifikation. CCUS og CHIP defineret af Valent (Valent, Oncotarget, 2018) og af Stauder (Stauder, Blood, 2018)

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Kvindelige og mandlige patienter > 18 år
  • MDS, MDS/MPN diagnose baseret på nuværende WHO klassifikation. CCUS og CHIP defineret af Valent (Valent, Oncotarget, 2018) og af Stauder (Stauder, Blood, 2018)
  • Underskrevet og dateret samtykkeerklæring fra patienten i henhold til ICH-GCP Guidelines

Ekskluderingskriterier:

  • Enhver anden sygdom, hvad enten den er fysisk eller psykisk, eller laboratorieabnormiteter, der forhindrer en erklæring om samtykke fra patienten
  • Patienter med en akut og/eller ukontrolleret infektion, herunder patienter, der er afebrile under behandling med antibiotika/svampemidler/antiviral profylaktisk medicin
  • Enhver allerede eksisterende autoimmun sygdom, der kræver en systemisk immunsuppression
  • Steroidbehandling (>10 mg Prednison/dag eller tilsvarende), uanset dets nødvendighed op til 4 uger før inklusion i undersøgelsen
  • Anamnestisk og/eller aktuel behandling med hypomethylerende midler (HMA) eller immunmodulerende imidlægemidler (IMiD'er)
  • Status efter allogen stamcelletransplantation
  • Tidligere eller igangværende kemoterapi
  • Graviditet eller ammeperiode

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Kohorte
  • Tidsperspektiver: Fremadrettet

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
MDS
  • Kvindelige og mandlige patienter i alderen 18 år og ældre
  • MDS, MDS/MPN diagnose baseret på nuværende WHO klassifikation. CCUS og CHIP defineret af Valent (Valent, Oncotarget, 2018) og af Stauder (Stauder, Blood, 2018)
Sekventering af patientprøver vil blive udført i ZIMCL's faciliteter. Efter DNA-ekstraktion vil sekventering af granulocytter samt af lymfocytter (kontrol) blive udført. Ud over hel exome-sekventering vil et panel fra SOPHIA GENETICS (som også er tilgængeligt til rutinediagnostik) blive anvendt, herunder følgende MDS-specifikke gener: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Hver patientprøve vil blive "bulk-sekventeret", hvilket betyder, at relevante mutationer detekteres ned til en allelfrekvens på 2 %.

Inflammasomaktivering kvantificeres ved analyser af inflammasomassocierede cytokinmønstre. Multiplex assays til kvantificering af de inflammasom-specifikke cytokiner vil blive udført fra serum såvel som fra supernatanter de stimulerede blodceller. Cytokin kvantificering udføres med Luminex FlexMap 3D. Serumcytokinniveauer vil blive kvantificeret parallelt.

Kvantificering af RNA-ekspressionsniveauer af inflammasom-relaterede genprodukter vil blive udført af qPCR'er fra ustimulerede og stimulerede (=kryorør) blodceller. Den nødvendige RNA-ekstraktion vil blive udført ved hjælp af et RNA-ekstraktionssæt.

En detaljeret evaluering af den individuelle immunstatus udføres ved analyse af to specialiserede paneler: Panel A giver et bredt overblik over forskellige immuncellepopulationer, mens panel B identificerer T-celle sup-populationer.
DNA vil blive ekstraheret fra frosne fækale prøver ved at anvende en perleslåningsmetode ved hjælp af et GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). DNA-kvaliteten vil blive vurderet ved hjælp af en Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Efter endelig præcipitation vil DNA-prøver blive resuspenderet i TE-buffer og opbevaret ved -80 °C til yderligere sekventeringsanalyse. Til dette formål vil sekventeringsbiblioteker blive genereret ved hjælp af et Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Bibliotekets kvalitet vil blive bekræftet ved hjælp af en Agilent 4200 TapeStation. Helgenom-haglgeværsekventering af fækale prøver vil blive udført på en HiSeq2500-platform (Illumina).
Demografiske og kliniske data omfatter: alder, alder ved indledende diagnose, køn, diagnose, faktiske komorbiditeter, medicin ved optagelse i undersøgelsen, cytogenetiske og molekylære profiler og standard laboratorieparametre (blodtal, differentielt leukocyttal, biokemi, jernstatus, inflammatoriske markører som f.eks. CRP, albumin, fibrinogen).
Evaluering af HRQOL, af funktionelle aktiviteter og præstationsstatus vil blive udført af patienten og/eller lægen ved hjælp af validerede scores.
styring
aldersvarende raske personer
Sekventering af patientprøver vil blive udført i ZIMCL's faciliteter. Efter DNA-ekstraktion vil sekventering af granulocytter samt af lymfocytter (kontrol) blive udført. Ud over hel exome-sekventering vil et panel fra SOPHIA GENETICS (som også er tilgængeligt til rutinediagnostik) blive anvendt, herunder følgende MDS-specifikke gener: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Hver patientprøve vil blive "bulk-sekventeret", hvilket betyder, at relevante mutationer detekteres ned til en allelfrekvens på 2 %.

Inflammasomaktivering kvantificeres ved analyser af inflammasomassocierede cytokinmønstre. Multiplex assays til kvantificering af de inflammasom-specifikke cytokiner vil blive udført fra serum såvel som fra supernatanter de stimulerede blodceller. Cytokin kvantificering udføres med Luminex FlexMap 3D. Serumcytokinniveauer vil blive kvantificeret parallelt.

Kvantificering af RNA-ekspressionsniveauer af inflammasom-relaterede genprodukter vil blive udført af qPCR'er fra ustimulerede og stimulerede (=kryorør) blodceller. Den nødvendige RNA-ekstraktion vil blive udført ved hjælp af et RNA-ekstraktionssæt.

En detaljeret evaluering af den individuelle immunstatus udføres ved analyse af to specialiserede paneler: Panel A giver et bredt overblik over forskellige immuncellepopulationer, mens panel B identificerer T-celle sup-populationer.
DNA vil blive ekstraheret fra frosne fækale prøver ved at anvende en perleslåningsmetode ved hjælp af et GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals). DNA-kvaliteten vil blive vurderet ved hjælp af en Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Efter endelig præcipitation vil DNA-prøver blive resuspenderet i TE-buffer og opbevaret ved -80 °C til yderligere sekventeringsanalyse. Til dette formål vil sekventeringsbiblioteker blive genereret ved hjælp af et Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). Bibliotekets kvalitet vil blive bekræftet ved hjælp af en Agilent 4200 TapeStation. Helgenom-haglgeværsekventering af fækale prøver vil blive udført på en HiSeq2500-platform (Illumina).
Demografiske og kliniske data omfatter: alder, alder ved indledende diagnose, køn, diagnose, faktiske komorbiditeter, medicin ved optagelse i undersøgelsen, cytogenetiske og molekylære profiler og standard laboratorieparametre (blodtal, differentielt leukocyttal, biokemi, jernstatus, inflammatoriske markører som f.eks. CRP, albumin, fibrinogen).
Evaluering af HRQOL, af funktionelle aktiviteter og præstationsstatus vil blive udført af patienten og/eller lægen ved hjælp af validerede scores.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Definition af sammenhæng mellem molekylære aberrationer og den sterile inflammatoriske tonus
Tidsramme: baseline
baseline
Definition af, hvordan genetiske aberrationer og tilhørende steril inflammation påvirker sundhedsrelateret livskvalitet (HRQoL, f.eks. træthed) og funktionelle aktiviteter hos patienter med MDS, MDS/MPN eller CHIP/CCUS
Tidsramme: baseline
baseline

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tidsramme
Definition af korrelation af steril inflammatorisk tonus med kliniske variabler (fx progression til sekundær akut myeloid leukæmi (sAML), komplikationer (f.eks. infektioner) og overlevelse)
Tidsramme: baseline
baseline

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

22. januar 2020

Primær færdiggørelse (Forventet)

1. januar 2023

Studieafslutning (Forventet)

1. januar 2023

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

16. marts 2020

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

16. marts 2020

Først opslået (Faktiske)

18. marts 2020

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

7. april 2022

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

6. april 2022

Sidst verificeret

1. januar 2022

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

Uafklaret

IPD-planbeskrivelse

Præsentation på konferencer og publicering i et peer-reviewed tidsskrift

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Myelodysplastiske syndromer

Kliniske forsøg med Næste generations sekvensering

Abonner