MDS における無菌性炎症と分子異常 (InflamGen)
骨髄異形成症候群における無菌性炎症と分子異常:生活の質と脆弱性の決定要因
調査の概要
状態
条件
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Domink Wolf, Univ.Prof.
- 電話番号:24003 0043512504
- メール:dominik.wolf@i-med.ac.at
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Verena Petzer, MD
- 電話番号:82979 0043512504
研究場所
-
-
Tyrol
-
Innsbruck、Tyrol、オーストリア、6020
- 募集
- Medical University of Innsbruck
-
コンタクト:
- Dominik Wolf, Univ.Prof.
- 電話番号:24003 0043512504
- メール:dominik.wolf@i-med.ac.at
-
コンタクト:
- Verena Petzer, MD
- 電話番号:82979 +43-512-504
- メール:verena.petzer@i-med.ac.at
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 18歳以上の女性および男性患者
- 現在のWHO分類に基づくMDS、MDS/MPNの診断。 Valent (Valent, Oncotarget, 2018) および Stauder (Stauder, Blood, 2018) によって定義された CCUS および CHIP
- ICH-GCP ガイドラインに基づく、患者による署名と日付入りの同意書
除外基準:
- 身体的または精神的な他の病気、または患者による同意の宣言を妨げる実験室の異常
- -抗生物質/抗真菌/抗ウイルス予防薬による治療中の無熱の患者を含む、急性および/または制御不能な感染症の患者
- -全身免疫抑制を必要とする既存の自己免疫疾患
- -ステロイド療法(> 10mgプレドニソン/日または同等)、その必要性に関係なく、研究に含める4週間前まで
- -低メチル化剤(HMA)または免疫調節イミド薬(IMiD)による既往および/または現在の治療
- 同種幹細胞移植後の状態
- 以前または進行中の化学療法
- 妊娠中または授乳中
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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MDS
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患者サンプルの配列決定は、ZIMCL の施設で実施されます。
DNA 抽出に続いて、顆粒球とリンパ球 (コントロール) の配列決定が行われます。
全エクソームシーケンスに加えて、SOPHIA GENETICS のパネル (ルーチン診断にも利用可能) が適用され、次の MDS 固有遺伝子が含まれます: ASXL1、BRAF、CBL、CEBPA、CSF3R、DNMT3A、EZH2、FLT3、HRAS、IDH1 、IDH2、KRAS、MPL、NPM1、NRAS、RUNX1、SF3B1、SRSF2、TET2、TP53、U2AF1、WT1、ZRSR。
各患者サンプルは「一括配列決定」されます。これは、関連する変異が 2% の対立遺伝子頻度まで検出されることを意味します。
インフラマソーム活性化は、インフラマソーム関連サイトカイン パターンの分析によって定量化されます。 インフラマソーム特異的サイトカインの定量化のためのマルチプレックスアッセイは、血清および刺激された血液細胞の上清から行われます。 Luminex FlexMap 3D を使用してサイトカインの定量化を行います。 血清サイトカインレベルは、並行して定量化されます。 インフラマソーム関連遺伝子産物の RNA 発現レベルの定量化は、非刺激および刺激 (= クライオチューブ) 血球からの qPCR によって実行されます。 必要な RNA 抽出は、RNA 抽出キットを使用して実行されます。
個々の免疫状態の詳細な評価は、2 つの専門パネルの分析によって行われています。パネル A は、さまざまな免疫細胞集団に関する広範な概要を提供し、パネル B は、T 細胞の sup 集団を特定します。
GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals) を使用したビーズ破砕法を適用して、凍結した糞便サンプルから DNA を抽出します。
DNA の品質は、Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies) を使用して評価されます。
最終的な沈殿物の後、DNA サンプルは TE バッファーに再懸濁され、さらにシーケンス分析のために-80 °C で保存されます。
この目的のために、Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina) を使用してシーケンス ライブラリを生成します。
ライブラリの品質は、Agilent 4200 TapeStation を使用して確認されます。
糞便サンプルの全ゲノム ショットガン シーケンスは、HiSeq2500 プラットフォーム (イルミナ) で実行されます。
人口統計学的データおよび臨床データには、年齢、初診時の年齢、性別、診断、実際の併存症、研究に組み入れたときの薬物療法、細胞遺伝学的および分子プロファイル、および標準検査パラメータ (血球数、白血球分画、生化学、鉄の状態、炎症マーカーなど) が含まれます。 CRP、アルブミン、フィブリノゲン)。
HRQOL、機能活動、およびパフォーマンスステータスの評価は、検証済みスコアを使用して患者および/または医師によって行われます。
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コントロール
年齢相応の健康な人
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患者サンプルの配列決定は、ZIMCL の施設で実施されます。
DNA 抽出に続いて、顆粒球とリンパ球 (コントロール) の配列決定が行われます。
全エクソームシーケンスに加えて、SOPHIA GENETICS のパネル (ルーチン診断にも利用可能) が適用され、次の MDS 固有遺伝子が含まれます: ASXL1、BRAF、CBL、CEBPA、CSF3R、DNMT3A、EZH2、FLT3、HRAS、IDH1 、IDH2、KRAS、MPL、NPM1、NRAS、RUNX1、SF3B1、SRSF2、TET2、TP53、U2AF1、WT1、ZRSR。
各患者サンプルは「一括配列決定」されます。これは、関連する変異が 2% の対立遺伝子頻度まで検出されることを意味します。
インフラマソーム活性化は、インフラマソーム関連サイトカイン パターンの分析によって定量化されます。 インフラマソーム特異的サイトカインの定量化のためのマルチプレックスアッセイは、血清および刺激された血液細胞の上清から行われます。 Luminex FlexMap 3D を使用してサイトカインの定量化を行います。 血清サイトカインレベルは、並行して定量化されます。 インフラマソーム関連遺伝子産物の RNA 発現レベルの定量化は、非刺激および刺激 (= クライオチューブ) 血球からの qPCR によって実行されます。 必要な RNA 抽出は、RNA 抽出キットを使用して実行されます。
個々の免疫状態の詳細な評価は、2 つの専門パネルの分析によって行われています。パネル A は、さまざまな免疫細胞集団に関する広範な概要を提供し、パネル B は、T 細胞の sup 集団を特定します。
GNOME DNA Isolation Kit (MP Biomedicals) を使用したビーズ破砕法を適用して、凍結した糞便サンプルから DNA を抽出します。
DNA の品質は、Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies) を使用して評価されます。
最終的な沈殿物の後、DNA サンプルは TE バッファーに再懸濁され、さらにシーケンス分析のために-80 °C で保存されます。
この目的のために、Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina) を使用してシーケンス ライブラリを生成します。
ライブラリの品質は、Agilent 4200 TapeStation を使用して確認されます。
糞便サンプルの全ゲノム ショットガン シーケンスは、HiSeq2500 プラットフォーム (イルミナ) で実行されます。
人口統計学的データおよび臨床データには、年齢、初診時の年齢、性別、診断、実際の併存症、研究に組み入れたときの薬物療法、細胞遺伝学的および分子プロファイル、および標準検査パラメータ (血球数、白血球分画、生化学、鉄の状態、炎症マーカーなど) が含まれます。 CRP、アルブミン、フィブリノゲン)。
HRQOL、機能活動、およびパフォーマンスステータスの評価は、検証済みスコアを使用して患者および/または医師によって行われます。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
|---|---|
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分子異常と無菌性炎症性緊張との相関関係の定義
時間枠:ベースライン
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ベースライン
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遺伝的異常および関連する無菌性炎症が、MDS、MDS/MPN、または CHIP/CCUS 患者の健康関連の生活の質 (HRQoL、疲労など) および機能的活動にどのように影響するかを定義します。
時間枠:ベースライン
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ベースライン
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二次結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
|---|---|
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無菌性炎症性トーヌスと臨床変数との相関関係の定義 (二次性急性骨髄性白血病 (sAML) への進行、合併症 (感染症など)、および生存など)
時間枠:ベースライン
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ベースライン
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Domink Wolf, Univ.Prof.、Medical University Innsbruck
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Valent P, Stauder R, Theurl I, Geissler K, Sliwa T, Sperr WR, Bettelheim P, Sill H, Pfeilstocker M. Diagnosis, management and response criteria of iron overload in myelodysplastic syndromes (MDS): updated recommendations of the Austrian MDS platform. Expert Rev Hematol. 2018 Feb;11(2):109-116. doi: 10.1080/17474086.2018.1420473. Epub 2018 Jan 2.
- Stauder R, Valent P, Theurl I. Anemia at older age: etiologies, clinical implications, and management. Blood. 2018 Feb 1;131(5):505-514. doi: 10.1182/blood-2017-07-746446. Epub 2017 Nov 15.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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