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Inflamación estéril y aberraciones moleculares en MDS (InflamGen)

6 de abril de 2022 actualizado por: Medical University Innsbruck

Inflamación estéril y aberraciones moleculares en el síndrome mielodisplásico: determinantes de la calidad de vida y la vulnerabilidad

El objetivo de este estudio es la descripción de la posible asociación entre los perfiles genéticos de mutación/aberración, el tono inflamatorio y el fenotipo clínico en base a las RPM y la CVRS. Además de obtener una mejor comprensión de la correlación causal entre la genética, los procesos inflamatorios estériles y la calidad de vida (p. fatiga) en MDS, se supone que este estudio identificará nuevos biomarcadores potenciales y, en última instancia, objetivos terapéuticos.

Descripción general del estudio

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Anticipado)

130

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Estudio Contacto

Copia de seguridad de contactos de estudio

  • Nombre: Verena Petzer, MD
  • Número de teléfono: 82979 0043512504

Ubicaciones de estudio

    • Tyrol
      • Innsbruck, Tyrol, Austria, 6020
        • Reclutamiento
        • Medical University of Innsbruck
        • Contacto:
        • Contacto:

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

18 años y mayores (Adulto, Adulto Mayor)

Acepta Voluntarios Saludables

No

Géneros elegibles para el estudio

Todos

Método de muestreo

Muestra de probabilidad

Población de estudio

Diagnóstico de MDS, MDS/MPN basado en la clasificación actual de la OMS. CCUS y CHIP definidos por Valent (Valent, Oncotarget, 2018) y por Stauder (Stauder, Blood, 2018)

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Pacientes femeninos y masculinos > 18 años
  • Diagnóstico de MDS, MDS/MPN basado en la clasificación actual de la OMS. CCUS y CHIP definidos por Valent (Valent, Oncotarget, 2018) y por Stauder (Stauder, Blood, 2018)
  • Declaración de consentimiento firmada y fechada por el paciente de acuerdo con las Directrices ICH-GCP

Criterio de exclusión:

  • Cualquier otra enfermedad, ya sea física o mental, o cualquier anormalidad de laboratorio que impida una declaración de consentimiento por parte del paciente.
  • Pacientes con una infección aguda y/o no controlada, incluidos pacientes afebriles en tratamiento con medicación profiláctica antibiótica/antifúngica/antiviral
  • Cualquier enfermedad autoinmune preexistente que requiera una inmunosupresión sistémica
  • Terapia con esteroides (>10 mg de Prednison/día o equivalente), independientemente de su necesidad hasta 4 semanas antes de la inclusión en el estudio
  • Tratamiento anamnésico y/o actual con agentes hipometilantes (HMA) o imidas inmunomoduladoras (IMiD)
  • Estado posterior al trasplante alogénico de células madre
  • Quimioterapia previa o en curso
  • Período de embarazo o lactancia

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Modelos observacionales: Grupo
  • Perspectivas temporales: Futuro

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
SMD
  • Pacientes femeninos y masculinos mayores de 18 años
  • Diagnóstico de MDS, MDS/MPN basado en la clasificación actual de la OMS. CCUS y CHIP definidos por Valent (Valent, Oncotarget, 2018) y por Stauder (Stauder, Blood, 2018)
La secuenciación de muestras de pacientes se realizará en las instalaciones de ZIMCL. Tras la extracción del ADN, se realizará la secuenciación de granulocitos así como de linfocitos (control). Además de la secuenciación del exoma completo, se aplicará un panel de SOPHIA GENETICS (que también está disponible para diagnósticos de rutina) que incluye los siguientes genes específicos de MDS: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Cada muestra de paciente será "secuenciada en masa", lo que significa que las mutaciones relevantes se detectan hasta una frecuencia de alelos del 2%.

La activación del inflamasoma se cuantifica mediante análisis de patrones de citoquinas asociados al inflamasoma. Se realizarán ensayos multiplex para la cuantificación de las citocinas específicas del inflamasoma a partir del suero, así como de los sobrenadantes de las células sanguíneas estimuladas. La cuantificación de citocinas se realiza con Luminex FlexMap 3D. Los niveles de citoquinas en suero se cuantificarán en paralelo.

La cuantificación de los niveles de expresión de ARN de los productos génicos relacionados con el inflamasoma se realizará mediante qPCR de células sanguíneas estimuladas y no estimuladas (= criotubo). La extracción de ARN necesaria se realizará mediante un kit de extracción de ARN.

Se está llevando a cabo una evaluación detallada del estado inmunitario individual mediante el análisis de dos paneles especializados: el panel A proporciona una visión general amplia de varias poblaciones de células inmunitarias, mientras que el panel B identifica las suppoblaciones de células T.
El ADN se extraerá de las muestras fecales congeladas aplicando un método de batido de perlas utilizando un kit de aislamiento de ADN GNOME (MP Biomedicals). La calidad del ADN se evaluará utilizando una Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Después de la precipitación final, las muestras de ADN se volverán a suspender en tampón TE y se almacenarán a -80 °C para un análisis de secuenciación adicional. Para ello, se generarán bibliotecas de secuenciación utilizando un kit de preparación de muestras de ADN Nextera XT (Illumina). La calidad de la biblioteca se confirmará con una TapeStation Agilent 4200. La secuenciación aleatoria del genoma completo de las muestras fecales se llevará a cabo en una plataforma HiSeq2500 (Illumina).
Los datos demográficos y clínicos incluyen: edad, edad en el momento del diagnóstico inicial, sexo, diagnóstico, comorbilidades reales, medicación en el momento de la inclusión en el estudio, perfiles citogenéticos y moleculares y parámetros de laboratorio estándar (hemograma, recuento diferencial de leucocitos, bioquímica, estado del hierro, marcadores inflamatorios como PCR, albúmina, fibrinógeno).
La evaluación de la CVRS, de las actividades funcionales y del estado funcional será realizada por el paciente y/o el médico utilizando puntajes validados.
control
personas sanas de la misma edad
La secuenciación de muestras de pacientes se realizará en las instalaciones de ZIMCL. Tras la extracción del ADN, se realizará la secuenciación de granulocitos así como de linfocitos (control). Además de la secuenciación del exoma completo, se aplicará un panel de SOPHIA GENETICS (que también está disponible para diagnósticos de rutina) que incluye los siguientes genes específicos de MDS: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Cada muestra de paciente será "secuenciada en masa", lo que significa que las mutaciones relevantes se detectan hasta una frecuencia de alelos del 2%.

La activación del inflamasoma se cuantifica mediante análisis de patrones de citoquinas asociados al inflamasoma. Se realizarán ensayos multiplex para la cuantificación de las citocinas específicas del inflamasoma a partir del suero, así como de los sobrenadantes de las células sanguíneas estimuladas. La cuantificación de citocinas se realiza con Luminex FlexMap 3D. Los niveles de citoquinas en suero se cuantificarán en paralelo.

La cuantificación de los niveles de expresión de ARN de los productos génicos relacionados con el inflamasoma se realizará mediante qPCR de células sanguíneas estimuladas y no estimuladas (= criotubo). La extracción de ARN necesaria se realizará mediante un kit de extracción de ARN.

Se está llevando a cabo una evaluación detallada del estado inmunitario individual mediante el análisis de dos paneles especializados: el panel A proporciona una visión general amplia de varias poblaciones de células inmunitarias, mientras que el panel B identifica las suppoblaciones de células T.
El ADN se extraerá de las muestras fecales congeladas aplicando un método de batido de perlas utilizando un kit de aislamiento de ADN GNOME (MP Biomedicals). La calidad del ADN se evaluará utilizando una Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Después de la precipitación final, las muestras de ADN se volverán a suspender en tampón TE y se almacenarán a -80 °C para un análisis de secuenciación adicional. Para ello, se generarán bibliotecas de secuenciación utilizando un kit de preparación de muestras de ADN Nextera XT (Illumina). La calidad de la biblioteca se confirmará con una TapeStation Agilent 4200. La secuenciación aleatoria del genoma completo de las muestras fecales se llevará a cabo en una plataforma HiSeq2500 (Illumina).
Los datos demográficos y clínicos incluyen: edad, edad en el momento del diagnóstico inicial, sexo, diagnóstico, comorbilidades reales, medicación en el momento de la inclusión en el estudio, perfiles citogenéticos y moleculares y parámetros de laboratorio estándar (hemograma, recuento diferencial de leucocitos, bioquímica, estado del hierro, marcadores inflamatorios como PCR, albúmina, fibrinógeno).
La evaluación de la CVRS, de las actividades funcionales y del estado funcional será realizada por el paciente y/o el médico utilizando puntajes validados.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Periodo de tiempo
Definición de correlación entre aberraciones moleculares y el tono inflamatorio estéril
Periodo de tiempo: base
base
Definición de cómo las aberraciones genéticas y la inflamación estéril asociada afectan la calidad de vida relacionada con la salud (CVRS, por ejemplo, fatiga) y las actividades funcionales en pacientes con MDS, MDS/MPN o CHIP/CCUS
Periodo de tiempo: base
base

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Periodo de tiempo
Definición de correlación del tono inflamatorio estéril con variables clínicas (p. ej., progresión a leucemia mieloide aguda secundaria (sAML), complicaciones (p. ej., infecciones) y supervivencia)
Periodo de tiempo: base
base

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Investigadores

  • Investigador principal: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Publicaciones y enlaces útiles

La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

22 de enero de 2020

Finalización primaria (Anticipado)

1 de enero de 2023

Finalización del estudio (Anticipado)

1 de enero de 2023

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

16 de marzo de 2020

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

16 de marzo de 2020

Publicado por primera vez (Actual)

18 de marzo de 2020

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

7 de abril de 2022

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

6 de abril de 2022

Última verificación

1 de enero de 2022

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

Indeciso

Descripción del plan IPD

Presentación en congresos y publicación en una revista revisada por pares

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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