Стерильное воспаление и молекулярные аберрации при МДС (InflamGen)
6 апреля 2022 г. обновлено: Medical University Innsbruck
Стерильное воспаление и молекулярные аберрации при миелодиспластическом синдроме: детерминанты качества жизни и уязвимости
Целью данного исследования является описание возможной связи между профилями генетических мутаций/аберраций, воспалительным тонусом и клиническим фенотипом на основе PROM и HRQoL.
Помимо лучшего понимания причинно-следственной связи между генетикой, стерильными воспалительными процессами и качеством жизни (например,
утомляемость) при МДС, предполагается, что это исследование позволит определить потенциальные новые биомаркеры и, в конечном счете, терапевтические мишени.
Обзор исследования
Статус
Рекрутинг
Условия
Вмешательство/лечение
- Диагностический тест: Секвенирование следующего поколения
- Диагностический тест: Онкоиммунологические исследования - мультиплексные анализы/количественная полимеразная цепная реакция
- Диагностический тест: проточной цитометрии
- Диагностический тест: Метагеномика образцов стула
- Диагностический тест: Клинические/демографические данные
- Другой: Выявление HRQoL
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Ожидаемый)
130
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Контакты исследования
- Имя: Domink Wolf, Univ.Prof.
- Номер телефона: 24003 0043512504
- Электронная почта: dominik.wolf@i-med.ac.at
Учебное резервное копирование контактов
- Имя: Verena Petzer, MD
- Номер телефона: 82979 0043512504
Места учебы
-
-
Tyrol
-
Innsbruck, Tyrol, Австрия, 6020
- Рекрутинг
- Medical University of Innsbruck
-
Контакт:
- Dominik Wolf, Univ.Prof.
- Номер телефона: 24003 0043512504
- Электронная почта: dominik.wolf@i-med.ac.at
-
Контакт:
- Verena Petzer, MD
- Номер телефона: 82979 +43-512-504
- Электронная почта: verena.petzer@i-med.ac.at
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
18 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Полы, имеющие право на обучение
Все
Метод выборки
Вероятностная выборка
Исследуемая популяция
Диагноз МДС, МДС/МПН основан на современной классификации ВОЗ.
CCUS и CHIP определены Valent (Valent, Oncotarget, 2018) и Stauder (Stauder, Blood, 2018)
Описание
Критерии включения:
- Пациенты женского и мужского пола > 18 лет
- Диагноз МДС, МДС/МПН основан на современной классификации ВОЗ. CCUS и CHIP определены Valent (Valent, Oncotarget, 2018) и Stauder (Stauder, Blood, 2018)
- Подписанное и датированное заявление о согласии пациента в соответствии с рекомендациями ICH-GCP.
Критерий исключения:
- Любое другое заболевание, будь то физическое или психическое, или любые лабораторные отклонения, препятствующие заявлению согласия пациента.
- Пациенты с острой и/или неконтролируемой инфекцией, в том числе пациенты без лихорадки при лечении антибиотиками/противогрибковыми/противовирусными профилактическими препаратами
- Любое ранее существовавшее аутоиммунное заболевание, требующее системной иммуносупрессии.
- Стероидная терапия (>10 мг преднизона/день или эквивалент), независимо от ее необходимости, в течение 4 недель до включения в исследование.
- Анамнестическая и/или текущая терапия гипометилирующими средствами (ГМА) или иммуномодулирующими имидными препаратами (ИМиД)
- Состояние после аллогенной трансплантации стволовых клеток
- Предыдущая или текущая химиотерапия
- Беременность или период грудного вскармливания
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Когорта
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
МДС
|
Секвенирование образцов пациентов будет проводиться в помещениях ZIMCL.
После выделения ДНК будет проведено секвенирование гранулоцитов, а также лимфоцитов (контроль).
В дополнение к полноэкзомному секвенированию будет применяться панель от SOPHIA GENETICS (которая также доступна для рутинной диагностики), включающая следующие специфические гены МДС: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1. , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR.
Каждый образец пациента будет «массово секвенирован», что означает, что соответствующие мутации обнаруживаются вплоть до частоты аллеля 2%.
Активация инфламмасом количественно оценивается анализом паттернов цитокинов, связанных с инфламмасомами. Мультиплексные анализы для количественного определения специфических для воспаления цитокинов будут проводиться как в сыворотке, так и в супернатантах стимулированных клеток крови. Количественное определение цитокинов проводят с помощью Luminex FlexMap 3D. Параллельно будут количественно определять уровни цитокинов в сыворотке. Количественное определение уровней экспрессии РНК генных продуктов, связанных с инфламмасомой, будет выполняться с помощью количественной ПЦР из нестимулированных и стимулированных (=криопробирки) клеток крови. Необходимая экстракция РНК будет выполняться с использованием набора для экстракции РНК.
Детальная оценка индивидуального иммунного статуса проводится путем анализа двух специализированных панелей: панель А дает общий обзор различных популяций иммунных клеток, а панель В идентифицирует суп-популяции Т-клеток.
ДНК будет извлечена из замороженных образцов фекалий методом взбивания гранул с использованием набора для выделения ДНК GNOME (MP Biomedicals).
Качество ДНК будет оцениваться с использованием Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies).
После окончательного осаждения образцы ДНК будут повторно суспендированы в буфере TE и сохранены при температуре -80 ° C для дальнейшего анализа последовательности.
С этой целью будут созданы библиотеки секвенирования с использованием набора для подготовки образцов ДНК Nextera XT (Illumina).
Качество библиотеки будет подтверждено с помощью Agilent 4200 TapeStation.
Полногеномное секвенирование образцов фекалий будет проводиться на платформе HiSeq2500 (Illumina).
Демографические и клинические данные включают: возраст, возраст при первоначальном диагнозе, пол, диагноз, фактические сопутствующие заболевания, прием лекарств на момент включения в исследование, цитогенетические и молекулярные профили и стандартные лабораторные параметры (анализ крови, дифференциальный подсчет лейкоцитов, биохимия, статус железа, воспалительные маркеры, такие как СРБ, альбумин, фибриноген).
Оценка HRQOL, функциональной активности и работоспособности будет проводиться пациентом и/или врачом с использованием утвержденных баллов.
|
|
контроль
здоровые лица соответствующего возраста
|
Секвенирование образцов пациентов будет проводиться в помещениях ZIMCL.
После выделения ДНК будет проведено секвенирование гранулоцитов, а также лимфоцитов (контроль).
В дополнение к полноэкзомному секвенированию будет применяться панель от SOPHIA GENETICS (которая также доступна для рутинной диагностики), включающая следующие специфические гены МДС: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1. , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR.
Каждый образец пациента будет «массово секвенирован», что означает, что соответствующие мутации обнаруживаются вплоть до частоты аллеля 2%.
Активация инфламмасом количественно оценивается анализом паттернов цитокинов, связанных с инфламмасомами. Мультиплексные анализы для количественного определения специфических для воспаления цитокинов будут проводиться как в сыворотке, так и в супернатантах стимулированных клеток крови. Количественное определение цитокинов проводят с помощью Luminex FlexMap 3D. Параллельно будут количественно определять уровни цитокинов в сыворотке. Количественное определение уровней экспрессии РНК генных продуктов, связанных с инфламмасомой, будет выполняться с помощью количественной ПЦР из нестимулированных и стимулированных (=криопробирки) клеток крови. Необходимая экстракция РНК будет выполняться с использованием набора для экстракции РНК.
Детальная оценка индивидуального иммунного статуса проводится путем анализа двух специализированных панелей: панель А дает общий обзор различных популяций иммунных клеток, а панель В идентифицирует суп-популяции Т-клеток.
ДНК будет извлечена из замороженных образцов фекалий методом взбивания гранул с использованием набора для выделения ДНК GNOME (MP Biomedicals).
Качество ДНК будет оцениваться с использованием Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies).
После окончательного осаждения образцы ДНК будут повторно суспендированы в буфере TE и сохранены при температуре -80 ° C для дальнейшего анализа последовательности.
С этой целью будут созданы библиотеки секвенирования с использованием набора для подготовки образцов ДНК Nextera XT (Illumina).
Качество библиотеки будет подтверждено с помощью Agilent 4200 TapeStation.
Полногеномное секвенирование образцов фекалий будет проводиться на платформе HiSeq2500 (Illumina).
Демографические и клинические данные включают: возраст, возраст при первоначальном диагнозе, пол, диагноз, фактические сопутствующие заболевания, прием лекарств на момент включения в исследование, цитогенетические и молекулярные профили и стандартные лабораторные параметры (анализ крови, дифференциальный подсчет лейкоцитов, биохимия, статус железа, воспалительные маркеры, такие как СРБ, альбумин, фибриноген).
Оценка HRQOL, функциональной активности и работоспособности будет проводиться пациентом и/или врачом с использованием утвержденных баллов.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Определение корреляции между молекулярными аберрациями и стерильным воспалительным тонусом
Временное ограничение: исходный уровень
|
исходный уровень
|
|
Определение того, как генетические аберрации и связанное с ними стерильное воспаление влияют на качество жизни, связанное со здоровьем (HRQoL, например, утомляемость) и функциональную активность у пациентов с МДС, МДС/МПН или CHIP/CCUS
Временное ограничение: исходный уровень
|
исходный уровень
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Определение корреляции стерильного воспалительного тонуса с клиническими переменными (например, прогрессирование во вторичный острый миелоидный лейкоз (sAML), осложнения (например, инфекции) и выживаемость)
Временное ограничение: исходный уровень
|
исходный уровень
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- Valent P, Stauder R, Theurl I, Geissler K, Sliwa T, Sperr WR, Bettelheim P, Sill H, Pfeilstocker M. Diagnosis, management and response criteria of iron overload in myelodysplastic syndromes (MDS): updated recommendations of the Austrian MDS platform. Expert Rev Hematol. 2018 Feb;11(2):109-116. doi: 10.1080/17474086.2018.1420473. Epub 2018 Jan 2.
- Stauder R, Valent P, Theurl I. Anemia at older age: etiologies, clinical implications, and management. Blood. 2018 Feb 1;131(5):505-514. doi: 10.1182/blood-2017-07-746446. Epub 2017 Nov 15.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
22 января 2020 г.
Первичное завершение (Ожидаемый)
1 января 2023 г.
Завершение исследования (Ожидаемый)
1 января 2023 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
16 марта 2020 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
16 марта 2020 г.
Первый опубликованный (Действительный)
18 марта 2020 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
7 апреля 2022 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
6 апреля 2022 г.
Последняя проверка
1 января 2022 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 20200129-2183
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Не определился
Описание плана IPD
Выступление на конференциях и публикация в рецензируемом журнале
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .