Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Steriele ontsteking en moleculaire afwijkingen bij MDS (InflamGen)

6 april 2022 bijgewerkt door: Medical University Innsbruck

Steriele ontsteking en moleculaire afwijkingen bij myelodysplastisch syndroom: bepalende factoren voor kwaliteit van leven en kwetsbaarheid

Het doel van deze studie is de beschrijving van het mogelijke verband tussen genetische mutatie-/afwijkingsprofielen, inflammatoire tonus en klinisch fenotype op basis van PROM's en HRQoL. Naast het beter begrijpen van de causale correlatie tussen genetica, steriele ontstekingsprocessen en kwaliteit van leven (bijv. vermoeidheid) bij MDS, zou deze studie potentiële nieuwe biomarkers en uiteindelijk therapeutische doelen moeten identificeren.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Interventie / Behandeling

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Verwacht)

130

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Contact Back-up

  • Naam: Verena Petzer, MD
  • Telefoonnummer: 82979 0043512504

Studie Locaties

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

18 jaar en ouder (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Kanssteekproef

Studie Bevolking

MDS-, MDS/MPN-diagnose op basis van de huidige WHO-classificatie. CCUS en CHIP gedefinieerd door Valent (Valent, Oncotarget, 2018) en door Stauder (Stauder, Blood, 2018)

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Vrouwelijke en mannelijke patiënten > 18 jaar
  • MDS-, MDS/MPN-diagnose op basis van de huidige WHO-classificatie. CCUS en CHIP gedefinieerd door Valent (Valent, Oncotarget, 2018) en door Stauder (Stauder, Blood, 2018)
  • Ondertekende en gedateerde toestemmingsverklaring door de patiënt volgens de ICH-GCP-richtlijnen

Uitsluitingscriteria:

  • Elke andere ziekte, lichamelijk of geestelijk, of laboratoriumafwijkingen die een toestemmingsverklaring van de patiënt verhinderen
  • Patiënten met een acute en/of ongecontroleerde infectie, inclusief patiënten die koorts hebben en worden behandeld met antibiotische/antischimmel-/antivirale profylactische medicatie
  • Elke reeds bestaande auto-immuunziekte die een systemische immunosuppressie vereist
  • Steroïdtherapie (>10 mg prednison/dag of equivalent), ongeacht de noodzaak ervan tot 4 weken vóór opname in het onderzoek
  • Anamnestische en/of huidige therapie met hypomethylerende middelen (HMA) of immunomodulerende imidegeneesmiddelen (IMiD's)
  • Status na allogene stamceltransplantatie
  • Eerdere of lopende chemotherapie
  • Zwangerschap of borstvoedingsperiode

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Observatiemodellen: Cohort
  • Tijdsperspectieven: Prospectief

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
MDS
  • Vrouwelijke en mannelijke patiënten van 18 jaar en ouder
  • MDS-, MDS/MPN-diagnose op basis van de huidige WHO-classificatie. CCUS en CHIP gedefinieerd door Valent (Valent, Oncotarget, 2018) en door Stauder (Stauder, Blood, 2018)
Diagnostische toets: Sequentiebepaling van de volgende generatie
Sequentiebepaling van patiëntmonsters zal worden uitgevoerd in de faciliteiten van ZIMCL. Na DNA-extractie zal zowel de sequentiebepaling van granulocyten als van lymfocyten (controle) worden uitgevoerd. Naast volledige exome-sequencing zal een panel van SOPHIA GENETICS (dat ook beschikbaar is voor routinematige diagnostiek) worden toegepast met de volgende MDS-specifieke genen: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Elk patiëntenmonster wordt "bulk-gesequenced", wat betekent dat relevante mutaties worden gedetecteerd tot een allelfrequentie van 2%.
Diagnostische toets: Tumorimmunologische onderzoeken - multiplexassays/kwantitatieve polymerasekettingreactie

Activering van het ontstekingsmasker wordt gekwantificeerd door analyses van met ontstekingsmasker geassocieerde cytokinepatronen. Multiplex assays voor de kwantificering van de ontstekingsremmende specifieke cytokines zullen zowel vanuit serum als van supernatanten van de gestimuleerde bloedcellen worden gedaan. Cytokine-kwantificering wordt uitgevoerd met Luminex FlexMap 3D. Serumcytokineniveaus zullen parallel worden gekwantificeerd.

Kwantificering van RNA-expressieniveaus van inflammasoom-gerelateerde genproducten zal worden uitgevoerd door qPCR's van niet-gestimuleerde en gestimuleerde (=cryotube) bloedcellen. De nodige RNA-extractie zal worden uitgevoerd met behulp van een RNA-extractiekit.

Diagnostische toets: flowcytometrie
Een gedetailleerde evaluatie van de individuele immuunstatus wordt uitgevoerd door de analyse van twee gespecialiseerde panels: Panel A geeft een breed overzicht van verschillende immuuncelpopulaties, terwijl Panel B T-cel-suppopulaties identificeert.
Diagnostische toets: Metagenomics van ontlastingsmonsters
DNA zal worden geëxtraheerd uit bevroren fecale monsters met behulp van een methode waarbij kralen worden geslagen met behulp van een GNOME DNA-isolatiekit (MP Biomedicals). De DNA-kwaliteit wordt beoordeeld met behulp van een Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Na de laatste precipitatie zullen DNA-monsters opnieuw worden gesuspendeerd in TE-buffer en bij -80 °C worden bewaard voor verdere sequentieanalyse. Daartoe zullen sequencing-bibliotheken worden gegenereerd met behulp van een Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). De kwaliteit van de bibliotheek wordt bevestigd met behulp van een Agilent 4200 TapeStation. Hele-genoom shotgun-sequencing van fecale monsters zal worden uitgevoerd op een HiSeq2500-platform (Illumina).
Diagnostische toets: Klinische/demografische gegevens
Demografische en klinische gegevens omvatten: leeftijd, leeftijd bij eerste diagnose, geslacht, diagnose, feitelijke comorbiditeit, medicatie bij opname in onderzoek, cytogenetische en moleculaire profielen en standaard laboratoriumparameters (bloedbeeld, differentieel aantal leukocyten, biochemie, ijzerstatus, ontstekingsmarkers zoals CRP, albumine, fibrinogeen).
Ander: Elicitatie van de HRQoL
Evaluatie van HRQOL, van functionele activiteiten en van de prestatiestatus zal worden gedaan door de patiënt en/of de arts met behulp van gevalideerde scores.
controle
gezonde personen van dezelfde leeftijd
Diagnostische toets: Sequentiebepaling van de volgende generatie
Sequentiebepaling van patiëntmonsters zal worden uitgevoerd in de faciliteiten van ZIMCL. Na DNA-extractie zal zowel de sequentiebepaling van granulocyten als van lymfocyten (controle) worden uitgevoerd. Naast volledige exome-sequencing zal een panel van SOPHIA GENETICS (dat ook beschikbaar is voor routinematige diagnostiek) worden toegepast met de volgende MDS-specifieke genen: ASXL1, BRAF, CBL, CEBPA, CSF3R, DNMT3A, EZH2, FLT3, HRAS, IDH1 , IDH2, KRAS, MPL, NPM1, NRAS, RUNX1, SF3B1, SRSF2, TET2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR. Elk patiëntenmonster wordt "bulk-gesequenced", wat betekent dat relevante mutaties worden gedetecteerd tot een allelfrequentie van 2%.
Diagnostische toets: Tumorimmunologische onderzoeken - multiplexassays/kwantitatieve polymerasekettingreactie

Activering van het ontstekingsmasker wordt gekwantificeerd door analyses van met ontstekingsmasker geassocieerde cytokinepatronen. Multiplex assays voor de kwantificering van de ontstekingsremmende specifieke cytokines zullen zowel vanuit serum als van supernatanten van de gestimuleerde bloedcellen worden gedaan. Cytokine-kwantificering wordt uitgevoerd met Luminex FlexMap 3D. Serumcytokineniveaus zullen parallel worden gekwantificeerd.

Kwantificering van RNA-expressieniveaus van inflammasoom-gerelateerde genproducten zal worden uitgevoerd door qPCR's van niet-gestimuleerde en gestimuleerde (=cryotube) bloedcellen. De nodige RNA-extractie zal worden uitgevoerd met behulp van een RNA-extractiekit.

Diagnostische toets: flowcytometrie
Een gedetailleerde evaluatie van de individuele immuunstatus wordt uitgevoerd door de analyse van twee gespecialiseerde panels: Panel A geeft een breed overzicht van verschillende immuuncelpopulaties, terwijl Panel B T-cel-suppopulaties identificeert.
Diagnostische toets: Metagenomics van ontlastingsmonsters
DNA zal worden geëxtraheerd uit bevroren fecale monsters met behulp van een methode waarbij kralen worden geslagen met behulp van een GNOME DNA-isolatiekit (MP Biomedicals). De DNA-kwaliteit wordt beoordeeld met behulp van een Agilent 4200 TapeStation (Agilent Technologies). Na de laatste precipitatie zullen DNA-monsters opnieuw worden gesuspendeerd in TE-buffer en bij -80 °C worden bewaard voor verdere sequentieanalyse. Daartoe zullen sequencing-bibliotheken worden gegenereerd met behulp van een Nextera XT DNA Sample Prep Kit (Illumina). De kwaliteit van de bibliotheek wordt bevestigd met behulp van een Agilent 4200 TapeStation. Hele-genoom shotgun-sequencing van fecale monsters zal worden uitgevoerd op een HiSeq2500-platform (Illumina).
Diagnostische toets: Klinische/demografische gegevens
Demografische en klinische gegevens omvatten: leeftijd, leeftijd bij eerste diagnose, geslacht, diagnose, feitelijke comorbiditeit, medicatie bij opname in onderzoek, cytogenetische en moleculaire profielen en standaard laboratoriumparameters (bloedbeeld, differentieel aantal leukocyten, biochemie, ijzerstatus, ontstekingsmarkers zoals CRP, albumine, fibrinogeen).
Ander: Elicitatie van de HRQoL
Evaluatie van HRQOL, van functionele activiteiten en van de prestatiestatus zal worden gedaan door de patiënt en/of de arts met behulp van gevalideerde scores.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Tijdsspanne
Definitie van de correlatie tussen moleculaire afwijkingen en de steriele inflammatoire tonus
Tijdsspanne: basislijn
basislijn
Definitie hoe genetische afwijkingen en geassocieerde steriele ontstekingen van invloed zijn op gezondheidsgerelateerde kwaliteit van leven (HRQoL, bijv. vermoeidheid) en functionele activiteiten bij patiënten met MDS, MDS/MPN of CHIP/CCUS
Tijdsspanne: basislijn
basislijn

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Tijdsspanne
Definitie van correlatie van steriele inflammatoire tonus met klinische variabelen (bijv. progressie naar secundaire acute myeloïde leukemie (sAML), complicaties (bijv. infecties) en overleving)
Tijdsspanne: basislijn
basislijn

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Medical University Innsbruck

Medewerkers

University Hospital, Bonn
Universitätsklinikum Leipzig

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Domink Wolf, Univ.Prof., Medical University Innsbruck

Publicaties en nuttige links

De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.

Algemene publicaties

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

22 januari 2020

Primaire voltooiing (Verwacht)

1 januari 2023

Studie voltooiing (Verwacht)

1 januari 2023

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

16 maart 2020

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

16 maart 2020

Eerst geplaatst (Werkelijk)

18 maart 2020

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

7 april 2022

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

6 april 2022

Laatst geverifieerd

1 januari 2022

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • 20200129-2183

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

Onbeslist

Beschrijving IPD-plan

Presentatie op conferenties en publicatie in een peer-reviewed tijdschrift

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren