Sélection d'antibiotiques à l'aide du séquençage de nouvelle génération et de la culture d'urine (ACCESS)

La NGS sera réalisée sur des urines évacuées collectées dans le cadre de soins de routine environ 30 jours avant la chirurgie. Les résultats seront présentés au pharmacien des maladies infectieuses dans les 48 à 72 heures pour l'aider à sélectionner les antibiotiques les plus appropriés. De manière indépendante, dans le cadre des soins de routine, les chirurgiens choisiront l'antibiotique qu'ils utiliseront dans chaque cas, tandis que les pharmaciens des maladies infectieuses sélectionneront leur choix optimal. Environ 220 sujets seront répartis au hasard dans un rapport de 1 : 1 pour recevoir soit la recommandation d'antibiotiques NGS, soit le traitement prescrit par une prophylaxie standard de soins (SOC). Les sujets affectés aux soins standard recevront des cultures d'urine pour analyse et le médecin choisira les antibiotiques en fonction des résultats selon la pratique habituelle. Les sujets affectés au groupe NGS, en plus des résultats de culture d'urine de routine, recevront les résultats de culture d'urine NGS à un pharmacien spécialisé en médicaments expérimentaux (ID), et les recommandations seront partagées avec le médecin pour déterminer la sélection des antibiotiques. Le médecin décidera finalement des antibiotiques appropriés à prescrire. Environ 7 à 14 jours après la chirurgie, le personnel de recherche effectuera un appel téléphonique pour poser des questions sur les infections postopératoires, les complications et les antibiotiques supplémentaires prescrits.