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Réalisation de séquençage de tous les gènes humains connus en cas de détection de malformations fœtales cérébrales, rénales ou ophtalmologiques pendant la grossesse afin de poser un diagnostic étiologique et de préciser le pronostic fœtal (PRENATEX)

10 novembre 2020 mis à jour par: University Hospital, Strasbourg, France

Contribution du séquençage de l'exome en période prénatale derrière les caractéristiques échographiques évocatrices d'une maladie génétique rare

Les malformations congénitales concernent 3 % des grossesses ; la plupart d'entre eux peuvent être vus pendant la grossesse. Pour certaines malformations, un prélèvement invasif (biopsie de trophoblaste ou amniocentèse) est proposé pour rechercher une anomalie chromosomique par la technique de la puce à ADN. Cependant, certains signes fortement évocateurs d'une pathologie génétique (et non chromosomique) ont un taux de diagnostic très faible avec cette technique. En l'absence de diagnostic étiologique, le pronostic pour l'enfant à naître est très difficile à évaluer, car on ne peut pas savoir si la malformation fœtale est réellement isolée ou associée à d'autres caractéristiques inédites dans le cadre d'une condition syndromique.

Pour certaines malformations fortement évocatrices d'une condition génétique, nous proposons de réaliser un exome (i.e. toutes les parties codantes du génome) séquençage du trio (l'enfant et les 2 parents) avec un délai d'accouchement compatible avec la situation d'urgence d'une grossesse (6 semaines maximum). Nous appliquerons des filtres bioinformatiques pour analyser uniquement les gènes connus pour être impliqués dans la malformation présente chez l'enfant à naître et ainsi éviter l'identification de variants dans des gènes non apparentés. Ces listes de gènes ont été préalablement validées par les Filières Maladies Rares et les laboratoires de diagnostic affiliés. Les malformations retenues sont : 1) les anomalies du système nerveux central (microcéphalie (<- 2DS) avec anomalies de giration, anomalies de la fosse postérieure, anomalies de la ligne médiane sauf agénésie du corps calleux), 2) les anomalies ophtalmologiques (microphtalmie, hyperplasie vitreuse) et 3) anomalies rénales (gros reins hyperéchogènes).

Aperçu de l'étude

Statut

Recrutement

Les conditions

Intervention / Traitement

Type d'étude

Interventionnel

Inscription (Anticipé)

90

Phase

  • N'est pas applicable

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Lieux d'étude

  • France
      • Besançon, France, 25030
        • Pas encore de recrutement
        • CHU de Besançon
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Lionel VAN MALDERGEM
        • Sous-enquêteur:
          • Juliette PIARD
        • Sous-enquêteur:
          • Elise BOUCHER
      • Dijon, France, 21079
        • Pas encore de recrutement
        • CHU de Dijon
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Christel THAUVIN
        • Sous-enquêteur:
          • Laurence FAIVRE
        • Sous-enquêteur:
          • Arthur SORLIN
        • Sous-enquêteur:
          • Sébastien MOUTTON
      • Lyon, France
        • Pas encore de recrutement
        • Hospices Civils de Lyon
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Audrey PUTOUX
      • Mulhouse, France, 68070
        • Pas encore de recrutement
        • Groupe Hospitalier Region Mulhouse Et Sud Alsace
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Emmanuelle GINGLINGER
        • Sous-enquêteur:
          • Edgar MONTOYA RAMIREZ
      • Nancy, France, 54042
        • Pas encore de recrutement
        • CHU de Nancy
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Laetitia LAMBERT
        • Sous-enquêteur:
          • Bruno LEHEUP
      • Paris, France, 75013
        • Pas encore de recrutement
        • Hôpital de la Pitié Salpêtrière
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Delphine HERON
      • Paris, France, 75012
        • Pas encore de recrutement
        • Hôpital d'Enfants Armand-Trousseau
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Alexandra AFENJAR
      • Paris, France, 75743
        • Pas encore de recrutement
        • Hopital Necker Enfants Malades
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Tania ATTIE-BITACH
      • Reims, France, 51092
        • Pas encore de recrutement
        • CHU de Reims
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Martine DOCO-FENZY
        • Sous-enquêteur:
          • Céline POIRSIER
      • Rennes, France, 35203
        • Pas encore de recrutement
        • CHU de Rennes
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Sylvie ODENT
      • Strasbourg, France, 67098
        • Recrutement
        • Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg
        • Sous-enquêteur:
          • Vincent LAUGEL
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Elise SCHAEFER
        • Sous-enquêteur:
          • Hélène DOLLFUS
        • Sous-enquêteur:
          • Salima EL CHEHADEH
        • Sous-enquêteur:
          • Romain FAVRE
      • Toulouse, France, 31059
        • Pas encore de recrutement
        • CHU de Toulouse
        • Contact:
        • Chercheur principal:
          • Patrick CALVAS

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

La description

Critère d'intégration:

  • Père et mère d'un enfant à naître ayant dépassé l'âge de la majorité
  • Consentement daté et signé par la mère et par le père
  • Père et mère capables de comprendre les objectifs et les risques de l'étude
  • Pour la maman, grossesse en cours (entre 12 et 34 semaines)
  • Pour la mère, grossesse avec présence d'une malformation à l'échographie, confirmée par un médecin du centre multidisciplinaire de diagnostic prénatal, entrant dans les indications retenues pour cette étude
  • Validation clinique de l'éligibilité du couple par un expert pour certaines des indications sélectionnées
  • Père et mère affiliés à une protection sociale santé

Critère d'exclusion:

  • Anomalie génétique ou chromosomique identifiée expliquant la malformation observée
  • Impossibilité de donner des informations au père et/ou à la mère (père ou mère en situation d'urgence ou de danger de mort)
  • Père et/ou mère sous la protection de la justice
  • Père et/ou mère sous tutelle ou curatelle
  • Femme qui allaite

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Objectif principal: Diagnostique
  • Répartition: N / A
  • Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
  • Masquage: Aucun (étiquette ouverte)

Armes et Interventions

Groupe de participants / Bras
Intervention / Traitement
Autre: 90 trios (270 sujets : 90 fœtus, 90 mères, 90 pères)
Génétique: CGH-array et séquençage de l'exome
Un échantillon de sang sera utilisé pour le CGH-array et le séquençage de l'exome

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Apport diagnostique du séquençage de l'exome en période prénatale par rapport à l'analyse chromosomique (CGH-array) réalisée dans les soins de santé actuels
Délai: 13 mois
Comparaison du nombre de diagnostics génétiques réalisés par séquençage d'exome et par CGH-array.
13 mois

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Effets sur la gestion de la grossesse et/ou les soins postnatals de l'enfant dus à un diagnostic étiologique
Délai: 13 mois
Pourcentage de soins fœtus/enfants prénatals et/ou postnatals modifiés par le résultat moléculaire
13 mois
Étude de faisabilité de la réalisation du séquençage de l'exome en période prénatale en termes de délai de livraison des résultats
Délai: 13 mois
Délai d'obtention des résultats depuis l'inclusion du trio (en jours) en précisant le délai pour chaque étape (réception, séquençage, analyse bioinformatique, interprétation) (en jours)
13 mois

Autres mesures de résultats

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Difficultés d'interprétation du séquençage de l'exome en période prénatale
Délai: 13 mois
Nombre de variants de signification inconnue identifiés par séquençage d'exome avec et sans filtres bioinformatiques (exome ciblé)
13 mois
Identification de nouveaux gènes responsables de malformations fœtales
Délai: 13 mois
Si les résultats du CGH-array et du séquençage ciblé de l'exome sont négatifs, analyse de l'ensemble du séquençage de l'exome pour trouver de nouveaux gènes impliqués dans le développement fœtal
13 mois

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

University Hospital, Strasbourg, France

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

5 août 2020

Achèvement primaire (Anticipé)

1 septembre 2021

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 septembre 2023

Dates d'inscription aux études

Première soumission

26 mai 2020

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

26 mai 2020

Première publication (Réel)

28 mai 2020

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

13 novembre 2020

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

10 novembre 2020

Dernière vérification

1 novembre 2020

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • 7344

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Indécis

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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