- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT04425343
Profilage microbien dans les poches liées aux patients atteints de parodontite chronique à l'aide du séquençage métagénomique de l'ARN 16s
Profilage microbien dans les poches liées aux patients atteints de parodontite chronique dans la population des Émirats arabes unis à l'aide du séquençage métagénomique de l'ARN 16s
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Les échantillons de plaque collectés ont ensuite été fraîchement préparés pour l'isolement de l'ADN à l'aide d'ABIOpure TM Total DNA (version 2.0) (Cat No: M501DP100) conformément aux instructions du fabricant. Tous les échantillons ont été évalués pour la quantification de l'ADN à l'aide de la spectrophotométrie et ensuite quantifiés à l'aide de la méthode fluorimétrique. Cela a été réalisé à l'aide de DeNovix DS-11 FX (DeNovix). Suite à la quantification de l'ADN, l'évaluation de l'intégrité de l'ADN a été résolue sur un gel d'agarose à 0,8 % avec du bromure d'éthidium. Pour la préparation de la bibliothèque NGS, tous les échantillons ont subi une amplification par PCR du gène de l'ARNr 16S dans l'ADN bactérien isolé. Les amorces utilisées avaient ciblé la région V3-V4 du gène de l'ARNr 16S. Les séquences d'amorces pleine longueur, utilisant la nomenclature nucléotidique standard IUPAC, pour suivre le protocole ciblant cette région sont :
16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC La méthode d'électrophorèse sur gel a été utilisée pour la sélection de la taille et le pipeline bioinformatique utilisé pour le traitement des données de séquence 16S du microbiome était QIIME
Type d'étude
Inscription (Réel)
Phase
- N'est pas applicable
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Ajman, Emirats Arabes Unis, 009716
- Ajman University of Science and Technology
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
La description
Critère d'intégration:
- Les patients recrutés pour l'étude ont reçu un diagnostic de parodontite généralisée de stade II
- Médicalement en forme
Critère d'exclusion:
- Patients souffrant de gingivite ou de parodontite de stade III
- Médicalement inapte
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Objectif principal: Recherche sur les services de santé
- Répartition: Randomisé
- Modèle interventionnel: Affectation à un seul groupe
- Masquage: Seul
Armes et Interventions
Groupe de participants / Bras |
Intervention / Traitement |
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Expérimental: Parodontite, adulte
Des échantillons de plaque ont été prélevés dans la poche sous-gingivale et envoyés au laboratoire pour analyse métagénomique
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La plaque sous-gingivale a été collectée à l'aide d'une curette stérile de la face vestibulaire des molaires maxillaires et de la face linguale des incisives mandibulaires, dans un flacon contenant 200 µl de tampon CL.
Autres noms:
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Expérimental: Analyse metgénomique
Analyse pour le nombre total de bactéries
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La plaque sous-gingivale a été collectée à l'aide d'une curette stérile de la face vestibulaire des molaires maxillaires et de la face linguale des incisives mandibulaires, dans un flacon contenant 200 µl de tampon CL.
Autres noms:
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Composition taxonomique microbienne
Délai: De la ligne de base à 3 mois
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La composition a été déterminée à l'aide d'échantillons de plaque sous-gingivale et en effectuant un séquençage métagénomique 16s
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De la ligne de base à 3 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- F-H-17-11-03
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Description du régime IPD
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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