Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Profilowanie drobnoustrojów w kieszonkach związanych z przewlekłym zapaleniem przyzębia przy użyciu sekwencjonowania metagenomicznego 16s RNA

9 czerwca 2020 zaktualizowane przez: sudhir rama varma, Ajman University

Profilowanie drobnoustrojów w kieszeniach związanych z pacjentami z przewlekłym zapaleniem przyzębia w populacji Zjednoczonych Emiratów Arabskich przy użyciu sekwencjonowania metagenomicznego 16s RNA

Badanie zostało opracowane zgodnie z Deklaracją Helsińską w sprawie badań medycznych z udziałem Komisji Etyki Uniwersytetu Ajman (2017-A-DN-04). Świadoma zgoda wszystkich uczestników została uzyskana przed udziałem w badaniu. Uczestnicy byli ogólnie zdrowi, bez historii antybiotyków przez ostatnie trzy miesiące. Pacjenci rekrutowani do badania zostali zdiagnozowani jako II stopień uogólnionego zapalenia przyzębia zgodnie z klasyfikacją ze światowych warsztatów z 2017 r. dotyczących „klasyfikacji chorób i schorzeń przyzębia i tkanek wokół implantów”. Uwzględniono stan przyzębia wskazujący na nasilenie klinicznej utraty przyczepu międzyzębowego na poziomie 3-4 mm, ubytki kości w zakresie 15-33% w badaniu radiologicznym oraz bez utraty zębów. Do badania włączono złożoność zapalenia przyzębia z maksymalną głębokością sondowania ≤ 5 mm z poziomą utratą kości oraz o zasięgu i rozmieszczeniu > 30% zajętych zębów. Łącznie pobrano 80 próbek płytki nazębnej o charakterystyce klinicznej pacjenta obejmującego wiek pomiędzy 25-39 lat, 36 kobiet i 44 mężczyzn. Płytkę poddziąsłową zebrano sterylną kiretą z policzkowej części trzonowców szczęki i językowej części siekaczy żuchwy do fiolki zawierającej 200 ul buforu CL.

Przegląd badań

Status

Zakończony

Warunki

Interwencja / Leczenie

Szczegółowy opis

Zebrane próbki łysinek następnie świeżo przygotowano do izolacji DNA przy użyciu ABIOpure TM Total DNA (wersja 2.0) (nr kat.: M501DP100) zgodnie z instrukcją producenta. Wszystkie próbki oceniono pod kątem ilościowego oznaczenia DNA za pomocą spektrofotometrii, a następnie określono ilościowo za pomocą metody fluorometrycznej. Dokonano tego przy użyciu DeNovix DS-11 FX (DeNovix). Po oznaczeniu ilościowym DNA przeprowadzono ocenę integralności DNA na 0,8% żelu agarozowym z bromkiem etydyny. W celu przygotowania biblioteki NGS wszystkie próbki poddano amplifikacji PCR genu 16S rRNA w wyizolowanym bakteryjnym DNA. Zastosowane startery były ukierunkowane na region V3-V4 genu 16S rRNA. Sekwencje starterów pełnej długości, przy użyciu standardowej nomenklatury nukleotydów IUPAC, zgodne z protokołem ukierunkowanym na ten region, to:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Metoda elektroforezy żelowej została wykorzystana do przetwarzania danych o sekwencji mikrobiomu QIIMES 16

Typ studiów

Interwencyjne

Zapisy (Rzeczywisty)

80

Faza

  • Nie dotyczy

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Lokalizacje studiów

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

14 lat do 56 lat (Dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • U pacjentów włączonych do badania rozpoznano uogólnione zapalenie przyzębia stopnia II
  • Sprawny medycznie

Kryteria wyłączenia:

  • Pacjenci z zapaleniem dziąseł lub zapaleniem przyzębia stopnia III
  • Niesprawny medycznie

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Główny cel: Badania usług zdrowotnych
  • Przydział: Randomizowane
  • Model interwencyjny: Zadanie dla jednej grupy
  • Maskowanie: Pojedynczy

Broń i interwencje

Grupa uczestników / Arm
Interwencja / Leczenie
Eksperymentalny: Zapalenie przyzębia, dorośli
Próbki płytki nazębnej pobrano z kieszonki poddziąsłowej i wysłano do laboratorium w celu analizy metagenomicznej
Genetyczny: Sekwencjonowanie metagenomiki 16s RNA
Płytkę poddziąsłową zebrano sterylną kiretą z policzkowej części trzonowców szczęki i językowej części siekaczy żuchwy do fiolki zawierającej 200 ul buforu CL.
Inne nazwy:
  • Izolacja DNA
Eksperymentalny: Analiza metgenomiczna
Analiza pełnej liczby bakterii
Genetyczny: Sekwencjonowanie metagenomiki 16s RNA
Płytkę poddziąsłową zebrano sterylną kiretą z policzkowej części trzonowców szczęki i językowej części siekaczy żuchwy do fiolki zawierającej 200 ul buforu CL.
Inne nazwy:
  • Izolacja DNA

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Skład taksonomiczny drobnoustrojów
Ramy czasowe: Od linii podstawowej do 3 miesięcy
Skład określono stosując próbki płytki poddziąsłowej i przeprowadzając sekwencjonowanie metagenomiczne 16s
Od linii podstawowej do 3 miesięcy

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Ajman University

Śledczy

  • Główny śledczy: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

10 listopada 2017

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

15 września 2018

Ukończenie studiów (Rzeczywisty)

7 października 2019

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

7 czerwca 2020

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

9 czerwca 2020

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

11 czerwca 2020

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

11 czerwca 2020

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

9 czerwca 2020

Ostatnia weryfikacja

1 czerwca 2020

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • F-H-17-11-03

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

Nie

Opis planu IPD

Skład taksonomiczny drobnoustrojów

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Sekwencjonowanie metagenomiki 16s RNA

Wyszukaj podobne próby

Sponsorzy i współpracownicy

Warunki medyczne

Interwencje lekowe

CROs by country

CROs in South Africa

Warunki

Rzadkie choroby

Interwencje lekowe

Suplementy diety

Sponsor / Współpracownicy

Lokalizacje

Subskrybuj