Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Mikrobiell profilering i lommer relatert til pasienter med kronisk periodontitt som bruker 16s RNA Metagenomics-sekvensering

9. juni 2020 oppdatert av: sudhir rama varma, Ajman University

Mikrobiell profilering i lommer relatert til pasienter med kronisk periodontitt i UAE-populasjon ved bruk av 16s RNA-metagenomikk-sekvensering

Studien ble utviklet i samsvar med Helsinki-erklæringen om medisinsk forskning som involverer Etikkkomiteen ved Ajman University (2017-A-DN-04). Informert samtykke fra alle deltakerne ble innhentet før deltakelse i studien. Deltakerne var systemisk friske uten noen historie med antibiotika de siste tre månedene. Pasienter rekruttert til studien ble diagnostisert som stadium II generalisert periodontitt i henhold til klassifiseringen fra 2017 verdensverkstedet om "klassifisering av periodontal og peri-implantat sykdom og tilstander". Periodontal status som indikerer alvorlighetsgraden av interdental klinisk festetap på 3-4 mm, radiografisk bentap mellom 15%-33% og uten tanntap ble inkludert. Kompleksiteten av periodontitt med en maksimal sonderingsdybde på ≤ 5 mm med horisontalt bentap og med en utstrekning og distribusjon med >30 % involverte tenner ble inkludert i studien. Totalt ble det samlet inn 80 plakkprøver med de kliniske egenskapene til pasienten, bestående av alder mellom 25-39 år, 36 kvinner og 44 menn. Den subgingivale plakk ble samlet ved bruk av en steril kyrett fra det bukkale aspektet av maxillære jeksler og lingualaspektet av mandibulære fortenner, i et hetteglass som inneholdt 200 µl Buffer CL.

Studieoversikt

Status

Fullført

Detaljert beskrivelse

De innsamlede plakkprøvene ble deretter nylaget for DNA-isolering ved bruk av ABIOpure TM Total DNA (versjon 2.0) (kat.nr.: M501DP100) i henhold til produsentens instruksjoner. Alle prøvene ble vurdert for DNA-kvantifisering ved bruk av spektrofotometri og videre kvantifisert ved bruk av den fluorometriske metoden. Dette ble utført ved hjelp av DeNovix DS-11 FX (DeNovix). I tillegg til DNA-kvantifiseringen ble vurdering av DNA-integritet løst på en 0,8 % agarosegel med etidiumbromid. For forberedelse av NGS-biblioteket gjennomgikk alle prøvene PCR-amplifisering av 16S rRNA-genet i det isolerte bakterielle DNA. Primerne som ble brukt hadde målrettet mot V3-V4-regionen til 16S rRNA-genet. Primersekvensene i full lengde, ved bruk av standard IUPAC-nukleotidnomenklatur, for å følge protokollen rettet mot denne regionen er:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Gelelektroforese-prosessen ble brukt til mikroforese-seleksjonsmetoden for mikroforese1 og ble brukt til mikroforese-prosessen for mikroforese1

Studietype

Intervensjonell

Registrering (Faktiske)

80

Fase

  • Ikke aktuelt

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

14 år til 56 år (Voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Pasienter rekruttert til studien ble diagnostisert som stadium II generalisert periodontitt
  • Medisinsk passe

Ekskluderingskriterier:

  • Pasienter med gingivitt eller stadium III periodontitt
  • Medisinsk uegnet

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Primært formål: Helsetjenesteforskning
  • Tildeling: Randomisert
  • Intervensjonsmodell: Enkeltgruppeoppdrag
  • Masking: Enkelt

Våpen og intervensjoner

Deltakergruppe / Arm
Intervensjon / Behandling
Eksperimentell: Periodontitt, voksen
Plakkprøver ble tatt fra subgingival lomme og sendt til laboratoriet for metagenomisk analyse
Den subgingivale plakk ble samlet ved bruk av en steril kyrett fra det bukkale aspektet av maxillære jeksler og lingualaspektet av mandibulære fortenner, i et hetteglass som inneholdt 200 µl Buffer CL.
Andre navn:
  • DNA-isolasjon
Eksperimentell: Metgenomisk analyse
Analyse for hele bakterietall
Den subgingivale plakk ble samlet ved bruk av en steril kyrett fra det bukkale aspektet av maxillære jeksler og lingualaspektet av mandibulære fortenner, i et hetteglass som inneholdt 200 µl Buffer CL.
Andre navn:
  • DNA-isolasjon

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Mikrobiell taksonomisk sammensetning
Tidsramme: Fra baseline til 3 måneder
Sammensetningen ble bestemt ved å bruke subgingivale plakkprøver og utføre 16s metagenomisk sekvensering
Fra baseline til 3 måneder

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

10. november 2017

Primær fullføring (Faktiske)

15. september 2018

Studiet fullført (Faktiske)

7. oktober 2019

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

7. juni 2020

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

9. juni 2020

Først lagt ut (Faktiske)

11. juni 2020

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

11. juni 2020

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

9. juni 2020

Sist bekreftet

1. juni 2020

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Andre studie-ID-numre

  • F-H-17-11-03

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

Nei

IPD-planbeskrivelse

Mikrobiell taksonomisk sammensetning

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere