Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Microbiële profilering in pockets gerelateerd aan patiënten met chronische parodontitis met behulp van 16s RNA Metagenomics Sequencing

9 juni 2020 bijgewerkt door: sudhir rama varma, Ajman University

Microbiële profilering in zakken gerelateerd aan chronische parodontitispatiënten in de VAE-bevolking met behulp van 16s RNA Metagenomics-sequencing

De studie is ontwikkeld in overeenstemming met de Verklaring van Helsinki over medisch onderzoek waarbij de Ethische Commissie van de Universiteit van Ajman betrokken is (2017-A-DN-04). Geïnformeerde toestemming van alle deelnemers werd verkregen vóór deelname aan het onderzoek. De deelnemers waren systemisch gezond en hadden de afgelopen drie maanden geen voorgeschiedenis van antibiotica. Patiënten die voor het onderzoek werden gerekruteerd, werden gediagnosticeerd als stadium II gegeneraliseerde parodontitis volgens de classificatie van de wereldworkshop van 2017 over de "classificatie van parodontale en peri-implantaire ziekten en aandoeningen". Parodontale status die de ernst aangeeft van interdentaal klinisch aanhechtingsverlies van 3-4 mm, radiografisch botverlies tussen 15%-33% en zonder tandverlies werden opgenomen. De complexiteit van parodontitis met een maximale sondeerdiepte van ≤ 5 mm met horizontaal botverlies en met een omvang en verdeling met >30% betrokken tanden werden in de studie opgenomen. Er werden in totaal 80 plaquemonsters verzameld met de klinische kenmerken van de patiënt, bestaande uit een leeftijd tussen 25-39 jaar, 36 vrouwen en 44 mannen. De subgingivale plaque werd verzameld met behulp van een steriele curette van het buccale aspect van maxillaire molaren en het linguale aspect van mandibulaire snijtanden, in een flesje dat 200 µl Buffer CL bevatte.

Studie Overzicht

Toestand

Voltooid

Gedetailleerde beschrijving

De verzamelde plaquemonsters werden vervolgens vers bereid voor de DNA-isolatie met behulp van ABIOpure TM Total DNA (versie 2.0) (cat. nr.: M501DP100) volgens de instructies van de fabrikant. Alle monsters werden beoordeeld op DNA-kwantificering met behulp van spectrofotometrie en verder gekwantificeerd met behulp van de fluorometrische methode. Dit werd uitgevoerd met behulp van DeNovix DS-11 FX (DeNovix). Naast de DNA-kwantificering werd de DNA-integriteit bepaald op een 0,8% agarosegel met ethidiumbromide. Voor de voorbereiding van de NGS-bibliotheek ondergingen alle monsters PCR-amplificatie van het 16S-rRNA-gen in het geïsoleerde bacteriële DNA. De gebruikte primers waren gericht op het V3-V4-gebied van het 16S-rRNA-gen. De primersequenties van volledige lengte, met behulp van de standaard IUPAC-nucleotidennomenclatuur, om het protocol voor deze regio te volgen, zijn:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Gelelektroforesemethode werd gebruikt voor de grootteselectie en de bioinformatica-pijplijn die werd gebruikt voor het verwerken van microbioom 16S-sequentiegegevens was QIIME

Studietype

Ingrijpend

Inschrijving (Werkelijk)

80

Fase

  • Niet toepasbaar

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

14 jaar tot 56 jaar (Volwassen)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Patiënten die voor het onderzoek werden gerekruteerd, werden gediagnosticeerd als stadium II gegeneraliseerde parodontitis
  • Medisch geschikt

Uitsluitingscriteria:

  • Patiënten met gingivitis of stadium III parodontitis
  • Medisch ongeschikt

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Primair doel: Onderzoek naar gezondheidsdiensten
  • Toewijzing: Gerandomiseerd
  • Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
  • Masker: Enkel

Wapens en interventies

Deelnemersgroep / Arm
Interventie / Behandeling
Experimenteel: Parodontitis, volwassen
Plaque-monsters werden uit de subgingivale pocket genomen en naar het laboratorium gestuurd voor metagenomische analyse
De subgingivale plaque werd verzameld met behulp van een steriele curette van het buccale aspect van maxillaire molaren en het linguale aspect van mandibulaire snijtanden, in een flesje dat 200 µl Buffer CL bevatte.
Andere namen:
  • DNA-isolatie
Experimenteel: Metgenomische analyse
Analyse voor hele bacterietelling
De subgingivale plaque werd verzameld met behulp van een steriele curette van het buccale aspect van maxillaire molaren en het linguale aspect van mandibulaire snijtanden, in een flesje dat 200 µl Buffer CL bevatte.
Andere namen:
  • DNA-isolatie

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Microbiële taxonomische samenstelling
Tijdsspanne: Van Baseline tot 3 maanden
De samenstelling werd bepaald met behulp van subgingivale plaquemonsters en het uitvoeren van 16s metagenomische sequencing
Van Baseline tot 3 maanden

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

10 november 2017

Primaire voltooiing (Werkelijk)

15 september 2018

Studie voltooiing (Werkelijk)

7 oktober 2019

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

7 juni 2020

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

9 juni 2020

Eerst geplaatst (Werkelijk)

11 juni 2020

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

11 juni 2020

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

9 juni 2020

Laatst geverifieerd

1 juni 2020

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Andere studie-ID-nummers

  • F-H-17-11-03

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

Nee

Beschrijving IPD-plan

Microbiële taxonomische samenstelling

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren