- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT04425343
Microbiële profilering in pockets gerelateerd aan patiënten met chronische parodontitis met behulp van 16s RNA Metagenomics Sequencing
Microbiële profilering in zakken gerelateerd aan chronische parodontitispatiënten in de VAE-bevolking met behulp van 16s RNA Metagenomics-sequencing
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
De verzamelde plaquemonsters werden vervolgens vers bereid voor de DNA-isolatie met behulp van ABIOpure TM Total DNA (versie 2.0) (cat. nr.: M501DP100) volgens de instructies van de fabrikant. Alle monsters werden beoordeeld op DNA-kwantificering met behulp van spectrofotometrie en verder gekwantificeerd met behulp van de fluorometrische methode. Dit werd uitgevoerd met behulp van DeNovix DS-11 FX (DeNovix). Naast de DNA-kwantificering werd de DNA-integriteit bepaald op een 0,8% agarosegel met ethidiumbromide. Voor de voorbereiding van de NGS-bibliotheek ondergingen alle monsters PCR-amplificatie van het 16S-rRNA-gen in het geïsoleerde bacteriële DNA. De gebruikte primers waren gericht op het V3-V4-gebied van het 16S-rRNA-gen. De primersequenties van volledige lengte, met behulp van de standaard IUPAC-nucleotidennomenclatuur, om het protocol voor deze regio te volgen, zijn:
16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Gelelektroforesemethode werd gebruikt voor de grootteselectie en de bioinformatica-pijplijn die werd gebruikt voor het verwerken van microbioom 16S-sequentiegegevens was QIIME
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Ajman, Verenigde Arabische Emiraten, 009716
- Ajman University of Science and Technology
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Patiënten die voor het onderzoek werden gerekruteerd, werden gediagnosticeerd als stadium II gegeneraliseerde parodontitis
- Medisch geschikt
Uitsluitingscriteria:
- Patiënten met gingivitis of stadium III parodontitis
- Medisch ongeschikt
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Onderzoek naar gezondheidsdiensten
- Toewijzing: Gerandomiseerd
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Enkel
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / Arm |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Experimenteel: Parodontitis, volwassen
Plaque-monsters werden uit de subgingivale pocket genomen en naar het laboratorium gestuurd voor metagenomische analyse
|
De subgingivale plaque werd verzameld met behulp van een steriele curette van het buccale aspect van maxillaire molaren en het linguale aspect van mandibulaire snijtanden, in een flesje dat 200 µl Buffer CL bevatte.
Andere namen:
|
|
Experimenteel: Metgenomische analyse
Analyse voor hele bacterietelling
|
De subgingivale plaque werd verzameld met behulp van een steriele curette van het buccale aspect van maxillaire molaren en het linguale aspect van mandibulaire snijtanden, in een flesje dat 200 µl Buffer CL bevatte.
Andere namen:
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Microbiële taxonomische samenstelling
Tijdsspanne: Van Baseline tot 3 maanden
|
De samenstelling werd bepaald met behulp van subgingivale plaquemonsters en het uitvoeren van 16s metagenomische sequencing
|
Van Baseline tot 3 maanden
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- F-H-17-11-03
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .