Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Mikrobiell profilering i fickor relaterade till patienter med kronisk parodontit som använder 16s RNA Metagenomics Sequencing

9 juni 2020 uppdaterad av: sudhir rama varma, Ajman University

Mikrobiell profilering i fickor relaterade till patienter med kronisk parodontit i UAE-population som använder 16s RNA Metagenomics-sekvensering

Studien har utvecklats i enlighet med Helsingforsdeklarationen om medicinsk forskning som involverar Etikkommittén vid Ajman University (2017-A-DN-04). Informerat samtycke från alla deltagare erhölls innan deltagande i studien. Deltagarna var systemiskt friska utan någon historia av antibiotika under de senaste tre månaderna. Patienter som rekryterats till studien diagnostiserades som steg II generaliserad parodontit enligt klassificeringen från 2017 års världsworkshop om "klassificering av periodontal och peri-implantat sjukdom och tillstånd". Parodontal status som indikerar svårighetsgraden av interdental klinisk fästförlust på 3-4 mm, radiografisk benförlust mellan 15%-33% och utan tandförlust inkluderades. Komplexiteten av parodontit med ett maximalt sonderingsdjup på ≤ 5 mm med horisontell benförlust och med en omfattning och fördelning med >30 % inblandade tänder inkluderades i studien. Totalt 80 plackprover samlades in med de kliniska egenskaperna hos patienten innefattande ålder mellan 25-39 år, 36 kvinnor och 44 män. Det subgingivala placket samlades upp med användning av en steril curette från den buckala aspekten av maxillära molarer och linguala aspekten av mandibulära incisiver, i en flaska innehållande 200 µl buffert CL.

Studieöversikt

Status

Avslutad

Betingelser

Detaljerad beskrivning

De insamlade plackproverna förbereddes sedan för DNA-isolering med användning av ABIOpure TM Total DNA (version 2.0) (Katnummer: M501DP100) enligt tillverkarens instruktioner. Alla prover utvärderades för DNA-kvantifiering med användning av spektrofotometri och kvantifierades ytterligare med den fluorometriska metoden. Detta utfördes med DeNovix DS-11 FX (DeNovix). Utöver DNA-kvantifieringen löstes bedömning av DNA-integritet på en 0,8 % agarosgel med etidiumbromid. För NGS-biblioteksberedning genomgick alla prover PCR-amplifiering av 16S rRNA-genen i det isolerade bakteriella DNA:t. De använda primrarna hade riktats mot V3-V4-regionen av 16S rRNA-genen. Fullängdsprimersekvenserna, med användning av standard IUPAC-nukleotidnomenklatur, för att följa protokollet som riktar sig till denna region är:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC användes gelelektroforesmetoden för sekvensval av mikrobioformater och användes QME för metoden för urval av mikroformat för mikroformatering av sekvenser och användes QME för bioformateringsprocessen.

Studietyp

Interventionell

Inskrivning (Faktisk)

80

Fas

  • Inte tillämpbar

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

14 år till 56 år (Vuxen)

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Patienter som rekryterats till studien diagnostiserades som steg II generaliserad parodontit
  • Medicinskt vältränad

Exklusions kriterier:

  • Patienter som har tandköttsinflammation eller parodontit i stadium III
  • Medicinskt olämplig

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Primärt syfte: Hälsovårdsforskning
  • Tilldelning: Randomiserad
  • Interventionsmodell: Enskild gruppuppgift
  • Maskning: Enda

Vapen och interventioner

Deltagargrupp / Arm
Intervention / Behandling
Experimentell: Parodontit, vuxen
Plackprover togs från subgingival ficka och skickades till labbet för metagenomisk analys
Det subgingivala placket samlades upp med användning av en steril curette från den buckala aspekten av maxillära molarer och linguala aspekten av mandibulära incisiver, i en flaska innehållande 200 µl buffert CL.
Andra namn:
  • DNA-isolering
Experimentell: Metgenomisk analys
Analys för hela bakterieantalet
Det subgingivala placket samlades upp med användning av en steril curette från den buckala aspekten av maxillära molarer och linguala aspekten av mandibulära incisiver, i en flaska innehållande 200 µl buffert CL.
Andra namn:
  • DNA-isolering

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Mikrobiell taxonomisk sammansättning
Tidsram: Från Baseline till 3 månader
Sammansättningen bestämdes med hjälp av subgingivala plackprover och genom att utföra 16s metagenomisk sekvensering
Från Baseline till 3 månader

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Utredare

  • Huvudutredare: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

10 november 2017

Primärt slutförande (Faktisk)

15 september 2018

Avslutad studie (Faktisk)

7 oktober 2019

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

7 juni 2020

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

9 juni 2020

Första postat (Faktisk)

11 juni 2020

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

11 juni 2020

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

9 juni 2020

Senast verifierad

1 juni 2020

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Andra studie-ID-nummer

  • F-H-17-11-03

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

Nej

IPD-planbeskrivning

Mikrobiell taxonomisk sammansättning

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera