Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Mikrobiální profilování v kapsách související s chronickou parodontitidou pomocí 16s RNA metagenomického sekvenování

9. června 2020 aktualizováno: sudhir rama varma, Ajman University

Mikrobiální profilování v kapsách související s chronickou parodontitidou v populaci SAE pomocí 16s RNA metagenomického sekvenování

Studie byla vyvinuta v souladu s Helsinskou deklarací o lékařském výzkumu zahrnujícím Etický výbor na univerzitě Ajman (2017-A-DN-04). Před účastí ve studii byl získán informovaný souhlas všech účastníků. Účastníci byli systémově zdraví bez anamnézy antibiotik za poslední tři měsíce. Pacienti přijatí do studie byli diagnostikováni jako generalizovaná parodontitida stadia II podle klasifikace ze světového workshopu z roku 2017 o „klasifikaci onemocnění a stavů parodontu a periimplantátu“. Byl zahrnut stav parodontu indikující závažnost ztráty mezizubního úponu 3-4 mm, radiografický úbytek kosti mezi 15 % až 33 % a bez ztráty zubu. Do studie byla zahrnuta složitost parodontitidy s maximální hloubkou sondy ≤ 5 mm s horizontálním úbytkem kosti as rozsahem a distribucí s > 30 % postižených zubů. Celkem bylo odebráno 80 vzorků plaku s klinickými charakteristikami pacienta zahrnujícího věk mezi 25-39 lety, 36 žen a 44 mužů. Subgingivální plak byl odebrán pomocí sterilní kyrety z bukálního aspektu maxilárních molárů a lingválního aspektu mandibulárních řezáků do lahvičky obsahující 200 ul pufru CL.

Přehled studie

Postavení

Dokončeno

Podmínky

Intervence / Léčba

Detailní popis

Odebrané vzorky plaků byly poté čerstvě připraveny pro izolaci DNA pomocí ABIOpure TM Total DNA (verze 2.0) (kat. č.: M501DP100) podle pokynů výrobce. Všechny vzorky byly hodnoceny pro kvantifikaci DNA pomocí spektrofotometrie a dále kvantifikovány pomocí fluorometrické metody. To bylo provedeno pomocí DeNovix DS-11 FX (DeNovix). Kromě kvantifikace DNA bylo hodnocení integrity DNA vyřešeno na 0,8% agarózovém gelu s ethidium bromidem. Pro přípravu knihovny NGS byly všechny vzorky podrobeny PCR amplifikaci genu 16S rRNA v izolované bakteriální DNA. Použité primery byly cíleny do oblasti V3-V4 genu 16S rRNA. Sekvence primerů v plné délce používající standardní nukleotidovou nomenklaturu IUPAC, které se řídí protokolem zaměřeným na tuto oblast, jsou:

16SAmplikonPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmplikonPCRReversePrimer=5' GCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGAGAGAGACAGACAGGAGGACTACHCC selekce a pro zpracování dat byla použita elektroforetická metoda pro bioinformační analýzu velikosti II.

Typ studie

Intervenční

Zápis (Aktuální)

80

Fáze

  • Nelze použít

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

16 let až 58 let (Dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Pacienti zařazení do studie byli diagnostikováni jako generalizovaná parodontitida stadia II
  • Zdravotně způsobilý

Kritéria vyloučení:

  • Pacienti s gingivitidou nebo paradentózou stadia III
  • Zdravotně nezpůsobilý

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Primární účel: Výzkum zdravotnických služeb
  • Přidělení: Randomizované
  • Intervenční model: Přiřazení jedné skupiny
  • Maskování: Singl

Zbraně a zásahy

Skupina účastníků / Arm
Intervence / Léčba
Experimentální: Parodontitida, dospělí
Vzorky plaku byly odebrány ze subgingivální kapsy a odeslány do laboratoře pro metagenomickou analýzu
Genetický: 16s RNA Metagenomics sekvenování
Subgingivální plak byl odebrán pomocí sterilní kyrety z bukálního aspektu maxilárních molárů a lingválního aspektu mandibulárních řezáků do lahvičky obsahující 200 ul pufru CL.
Ostatní jména:
  • DNA izolace
Experimentální: Metgenomická analýza
Analýza celkového počtu bakterií
Genetický: 16s RNA Metagenomics sekvenování
Subgingivální plak byl odebrán pomocí sterilní kyrety z bukálního aspektu maxilárních molárů a lingválního aspektu mandibulárních řezáků do lahvičky obsahující 200 ul pufru CL.
Ostatní jména:
  • DNA izolace

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Mikrobiální taxonomické složení
Časové okno: Od základní linie do 3 měsíců
Složení bylo stanoveno pomocí vzorků subgingiválního plaku a provedením 16s metagenomického sekvenování
Od základní linie do 3 měsíců

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Ajman University

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

10. listopadu 2017

Primární dokončení (Aktuální)

15. září 2018

Dokončení studie (Aktuální)

7. října 2019

Termíny zápisu do studia

První předloženo

7. června 2020

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

9. června 2020

První zveřejněno (Aktuální)

11. června 2020

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

11. června 2020

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

9. června 2020

Naposledy ověřeno

1. června 2020

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • F-H-17-11-03

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

Ne

Popis plánu IPD

Mikrobiální taxonomické složení

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na 16s RNA Metagenomics sekvenování

Prohledejte podobné pokusy

Sponzoři a spolupracovníci

Zdravotní podmínky

Drogové intervence

CROs by country

CROs in Hungary

Podmínky

Vzácné nemoci

Drogové intervence

Doplňky stravy

Sponzor / Spolupracovníci

Místa

3
Předplatit