Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Mikrobiel profilering i lommer relateret til patienter med kronisk parodontitis, der bruger 16s RNA Metagenomics-sekventering

9. juni 2020 opdateret af: sudhir rama varma, Ajman University

Mikrobiel profilering i lommer relateret til patienter med kronisk parodontitis i UAE-population ved hjælp af 16s RNA-metagenomik-sekventering

Undersøgelsen er udviklet i overensstemmelse med Helsinki-erklæringen om medicinsk forskning, der involverer den etiske komité ved Ajman University (2017-A-DN-04). Informeret samtykke fra alle deltagerne blev opnået før deltagelse i undersøgelsen. Deltagerne var systemisk raske uden antibiotika i de sidste tre måneder. Patienter rekrutteret til undersøgelsen blev diagnosticeret som trin II generaliseret parodontitis i henhold til klassifikationen fra 2017 verdensværkstedet om "klassificering af periodontal og peri-implantat sygdom og tilstande". Periodontal status, der indikerer sværhedsgraden af ​​interdentalt klinisk tilknytningstab på 3-4 mm, radiografisk knogletab mellem 15%-33% og uden tandtab var inkluderet. Kompleksiteten af ​​parodontitis med en maksimal sonderingsdybde på ≤ 5 mm med vandret knogletab og med en udstrækning og fordeling med >30 % involverede tænder blev inkluderet i undersøgelsen. I alt 80 plaqueprøver blev indsamlet med patientens kliniske karakteristika omfattende alder mellem 25-39 år, 36 kvinder og 44 mænd. Den subgingivale plaque blev opsamlet under anvendelse af en steril curette fra det bukkale aspekt af maxillære kindtænder og det linguale aspekt af mandibulære fortænder i et hætteglas indeholdende 200 µl Buffer CL.

Studieoversigt

Status

Afsluttet

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

De indsamlede plaqueprøver blev derefter friskforberedt til DNA-isolering under anvendelse af ABIOpure TM Total DNA (version 2.0) (kat.nr.: M501DP100) i henhold til producentens instruktioner. Alle prøverne blev vurderet til DNA-kvantificering ved hjælp af spektrofotometri og yderligere kvantificeret ved hjælp af den fluorometriske metode. Dette blev udført ved hjælp af DeNovix DS-11 FX (DeNovix). I forlængelse af DNA-kvantificeringen blev vurdering af DNA-integritet løst på en 0,8% agarosegel med ethidiumbromid. Til forberedelse af NGS-biblioteket gennemgik alle prøverne PCR-amplifikation af 16S rRNA-genet i det isolerede bakterielle DNA. De anvendte primere havde målrettet mod V3-V4-regionen af ​​16S rRNA-genet. Primersekvenserne i fuld længde, ved hjælp af standard IUPAC-nukleotidnomenklatur, for at følge protokollen, der er målrettet mod denne region, er:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Gelelektroforese-metoden blev brugt til mikroforese-udvælgelsesmetoden til mikroforese1, og blev brugt til Qme-metoden til bioformatering af sekvensen, og blev brugt til Qme-mikroforese-metoden.

Undersøgelsestype

Interventionel

Tilmelding (Faktiske)

80

Fase

  • Ikke anvendelig

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

14 år til 56 år (Voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Patienter rekrutteret til undersøgelsen blev diagnosticeret som trin II generaliseret parodontitis
  • Medicinsk velegnet

Ekskluderingskriterier:

  • Patienter med tandkødsbetændelse eller fase III paradentose
  • Medicinsk uegnet

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Primært formål: Sundhedstjenesteforskning
  • Tildeling: Randomiseret
  • Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
  • Maskning: Enkelt

Våben og indgreb

Deltagergruppe / Arm
Intervention / Behandling
Eksperimentel: Paradentose, voksen
Plaqueprøver blev taget fra subgingival lomme og sendt til laboratoriet til metagenomisk analyse
Genetisk: 16s RNA Metagenomics sekventering
Den subgingivale plaque blev opsamlet under anvendelse af en steril curette fra det bukkale aspekt af maxillære kindtænder og det linguale aspekt af mandibulære fortænder i et hætteglas indeholdende 200 µl Buffer CL.
Andre navne:
  • DNA isolering
Eksperimentel: Metgenomisk analyse
Analyse for hele bakterietal
Genetisk: 16s RNA Metagenomics sekventering
Den subgingivale plaque blev opsamlet under anvendelse af en steril curette fra det bukkale aspekt af maxillære kindtænder og det linguale aspekt af mandibulære fortænder i et hætteglas indeholdende 200 µl Buffer CL.
Andre navne:
  • DNA isolering

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Mikrobiel taksonomisk sammensætning
Tidsramme: Fra baseline til 3 måneder
Sammensætningen blev bestemt ved hjælp af subgingivale plakprøver og udførelse af 16s metagenomisk sekventering
Fra baseline til 3 måneder

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Ajman University

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

10. november 2017

Primær færdiggørelse (Faktiske)

15. september 2018

Studieafslutning (Faktiske)

7. oktober 2019

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

7. juni 2020

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

9. juni 2020

Først opslået (Faktiske)

11. juni 2020

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

11. juni 2020

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

9. juni 2020

Sidst verificeret

1. juni 2020

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • F-H-17-11-03

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

Ingen

IPD-planbeskrivelse

Mikrobiel taksonomisk sammensætning

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Periodontale sygdomme

Kliniske forsøg med 16s RNA Metagenomics sekventering

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Mexico

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner