- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT04425343
Mikrobielles Profiling in Taschen bei Patienten mit chronischer Parodontitis unter Verwendung von 16s-RNA-Metagenomik-Sequenzierung
Mikrobielles Profiling in Taschen im Zusammenhang mit Patienten mit chronischer Parodontitis in der Bevölkerung der Vereinigten Arabischen Emirate unter Verwendung von 16s-RNA-Metagenomik-Sequenzierung
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Die gesammelten Plaqueproben wurden dann mit ABIOpure TM Total DNA (Version 2.0) (Kat.-Nr.: M501DP100) nach Herstellerangaben frisch für die DNA-Isolierung aufbereitet. Alle Proben wurden für die DNA-Quantifizierung mittels Spektrophotometrie bewertet und weiter mit der fluorometrischen Methode quantifiziert. Dies wurde unter Verwendung von DeNovix DS-11 FX (DeNovix) durchgeführt. Nach der DNA-Quantifizierung wurde die Bewertung der DNA-Integrität auf einem 0,8 % Agarosegel mit Ethidiumbromid durchgeführt. Zur Vorbereitung der NGS-Bibliothek wurden alle Proben einer PCR-Amplifikation des 16S-rRNA-Gens in der isolierten Bakterien-DNA unterzogen. Die verwendeten Primer waren auf die V3-V4-Region des 16S-rRNA-Gens gerichtet. Die Primersequenzen in voller Länge unter Verwendung der Standard-IUPAC-Nukleotidnomenklatur, um dem Protokoll zu folgen, das auf diese Region abzielt, sind:
16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Die Gelelektrophorese-Methode wurde für die Größenauswahl verwendet und die Bioinformatik-Pipeline zur Verarbeitung der Mikrobiom-16S-Sequenzdaten war QIIME
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Phase
- Unzutreffend
Kontakte und Standorte
Studienorte
-
-
-
Ajman, Vereinigte Arabische Emirate, 009716
- Ajman University of Science and Technology
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Bei den für die Studie rekrutierten Patienten wurde generalisierte Parodontitis im Stadium II diagnostiziert
- Medizinisch fit
Ausschlusskriterien:
- Patienten mit Gingivitis oder Parodontitis im Stadium III
- Medizinisch untauglich
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Hauptzweck: Versorgungsforschung
- Zuteilung: Zufällig
- Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
- Maskierung: Single
Waffen und Interventionen
Teilnehmergruppe / Arm |
Intervention / Behandlung |
---|---|
Experimental: Parodontitis, Erwachsener
Plaqueproben wurden aus der subgingivalen Tasche entnommen und zur metagenomischen Analyse an das Labor geschickt
|
Die subgingivale Plaque wurde unter Verwendung einer sterilen Kürette von der bukkalen Seite der oberen Molaren und der lingualen Seite der unteren Schneidezähne in einem Fläschchen gesammelt, das 200 &mgr;l Puffer CL enthielt.
Andere Namen:
|
Experimental: Metgenomische Analyse
Analyse auf Gesamtkeimzahl
|
Die subgingivale Plaque wurde unter Verwendung einer sterilen Kürette von der bukkalen Seite der oberen Molaren und der lingualen Seite der unteren Schneidezähne in einem Fläschchen gesammelt, das 200 &mgr;l Puffer CL enthielt.
Andere Namen:
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
---|---|---|
Mikrobielle taxonomische Zusammensetzung
Zeitfenster: Von der Grundlinie bis zu 3 Monaten
|
Die Zusammensetzung wurde unter Verwendung von subgingivalen Plaqueproben und Durchführung einer 16s-metagenomischen Sequenzierung bestimmt
|
Von der Grundlinie bis zu 3 Monaten
|
Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Ermittler
- Hauptermittler: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- F-H-17-11-03
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
Beschreibung des IPD-Plans
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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