使用 16s RNA 宏基因组测序对与慢性牙周炎患者相关的牙周袋进行微生物分析
2020年6月9日 更新者：sudhir rama varma、Ajman University
使用 16s RNA 宏基因组测序对阿联酋人群中与慢性牙周炎患者相关的口袋进行微生物分析
该研究是根据涉及阿吉曼大学伦理委员会的医学研究赫尔辛基宣言 (2017-A-DN-04) 制定的。
在参与研究之前获得了所有参与者的知情同意。
参与者全身健康，过去三个月没有抗生素史。
根据 2017 年世界研讨会关于“牙周和种植体周围疾病和病症的分类”的分类，为该研究招募的患者被诊断为 II 期广泛性牙周炎。
牙周状态表明牙间临床附着损失的严重程度为 3-4 毫米，影像学骨质流失在 15%-33% 之间，并且没有牙齿脱落。
该研究包括最大探诊深度≤ 5mm 伴有水平骨缺损、范围和分布 >30% 牙齿受累的牙周炎的复杂性。
总共收集了 80 个斑块样本，患者的临床特征包括年龄在 25-39 岁之间，36 名女性和 44 名男性。
使用无菌刮匙从上颌磨牙的颊侧和下颌切牙的舌侧收集龈下菌斑，收集在含有 200μl 缓冲液 CL 的小瓶中。
研究概览
详细说明
然后根据制造商的说明，使用 ABIOpure TM 总 DNA（2.0 版）（货号：M501DP100）新鲜制备用于 DNA 分离的新鲜菌斑样品。 使用分光光度法对所有样品进行 DNA 定量评估，并使用荧光法进一步定量。 这是使用 DeNovix DS-11 FX (DeNovix) 进行的。 在 DNA 定量之后，DNA 完整性的评估在含有溴化乙锭的 0.8% 琼脂糖凝胶上解决。 对于 NGS 文库制备，所有样品都对分离的细菌 DNA 中的 16S rRNA 基因进行了 PCR 扩增。 使用的引物靶向 16S rRNA 基因的 V3-V4 区域。 全长引物序列，使用标准 IUPAC 核苷酸命名法，遵循针对该区域的协议是：
16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATATAAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRreversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC 凝胶电泳法用于大小选择，用于处理微生物组序列数据的生物信息学管道为 QIIME 16
研究类型
介入性
注册 (实际的)
80
阶段
- 不适用
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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Ajman、阿拉伯联合酋长国、009716
- Ajman University of Science and Technology
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
16年 至 58年 (成人)
接受健康志愿者
不
有资格学习的性别
全部
描述
纳入标准：
- 为该研究招募的患者被诊断为 II 期广泛性牙周炎
- 医学上适合
排除标准：
- 患有牙龈炎或III期牙周炎的患者
- 医学上不适合
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
- 主要用途：卫生服务研究
- 分配：随机化
- 介入模型：单组作业
- 屏蔽：单身的
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
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实验性的：牙周炎，成人
从龈下袋中取出牙菌斑样本并送至实验室进行宏基因组分析
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使用无菌刮匙从上颌磨牙的颊侧和下颌切牙的舌侧收集龈下菌斑，收集在含有 200μl 缓冲液 CL 的小瓶中。
其他名称：
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实验性的：宏基因组分析
全细菌计数分析
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使用无菌刮匙从上颌磨牙的颊侧和下颌切牙的舌侧收集龈下菌斑，收集在含有 200μl 缓冲液 CL 的小瓶中。
其他名称：
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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微生物分类组成
大体时间：从基线到 3 个月
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使用龈下菌斑样本并进行 16s 宏基因组测序来确定成分
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从基线到 3 个月
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 首席研究员：Sudhir Varma, MDS、Assistant Professor
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2017年11月10日
初级完成 (实际的)
2018年9月15日
研究完成 (实际的)
2019年10月7日
研究注册日期
首次提交
2020年6月7日
首先提交符合 QC 标准的
2020年6月9日
首次发布 (实际的)
2020年6月11日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2020年6月11日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2020年6月9日
最后验证
2020年6月1日
更多信息
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