Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Mikrobiprofilointi taskuissa, jotka liittyvät krooniseen parodontiittipotilaisiin, joissa käytetään 16s RNA:n metagenomiikan sekvensointia

tiistai 9. kesäkuuta 2020 päivittänyt: sudhir rama varma, Ajman University

Mikrobiprofilointi taskuissa, jotka liittyvät krooniseen parodontiittipotilaisiin Yhdistyneiden arabiemiirikuntien väestössä käyttäen 16s RNA:n metagenomiikkasekvensointia

Tutkimus on kehitetty Ajmanin yliopiston eettisen komitean (2017-A-DN-04) lääketieteellisen tutkimuksen Helsingin julistuksen mukaisesti. Kaikilta osallistujilta hankittiin tietoinen suostumus ennen tutkimukseen osallistumista. Osallistujat olivat systeemisesti terveitä, eikä heillä ole ollut antibiootteja viimeisen kolmen kuukauden aikana. Tutkimukseen rekrytoiduilla potilailla diagnosoitiin vaiheen II yleistynyt parodontiitti vuoden 2017 maailmanlaajuisen työpajan luokituksen mukaan "parodontaali- ja peri-implanttisairauksien ja -tilojen luokittelu". Parodontaalista tila, joka osoittaa hampaiden välisen kliinisen kiinnittymisen vakavuuden 3–4 mm, röntgenkuvaus 15–33 % ja ilman hampaiden menetystä. Tutkimukseen sisältyi parodontiitin monimutkaisuus, jonka suurin koetussyvyys oli ≤ 5 mm ja vaakasuora luukato ja jonka laajuus ja jakautuminen yli 30 % hampaista. Potilaan kliinisistä ominaisuuksista kerättiin yhteensä 80 plakkinäytettä, jotka koostuivat iästä 25-39 vuotta, 36 naista ja 44 miestä. Subgingivaalinen plakki kerättiin käyttämällä steriiliä kyrettiä yläleuan poskihampaiden bukkaalista ja alaleuan etuhampaiden linguaalista puolta pulloon, joka sisälsi 200 ui puskuri-CL-puskuria.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Valmis

Ehdot

Interventio / Hoito

Yksityiskohtainen kuvaus

Kerätyt plakkinäytteet valmistettiin sitten juuri DNA-eristystä varten käyttämällä ABIOpure TM Total DNA:ta (versio 2.0) (luettelonumero: M501DP100) valmistajan ohjeiden mukaisesti. Kaikista näytteistä arvioitiin DNA:n kvantifiointi käyttämällä spektrofotometriaa ja kvantifioitiin edelleen käyttämällä fluorometristä menetelmää. Tämä suoritettiin käyttämällä DeNovix DS-11 FX:ää (DeNovix). DNA:n kvantifioinnin lisäksi DNA:n eheyden arviointi suoritettiin 0,8-prosenttisella agaroosigeelillä etidiumbromidin kanssa. NGS-kirjaston valmistusta varten kaikille näytteille tehtiin 16S-rRNA-geenin PCR-amplifikaatio eristetyssä bakteeri-DNA:ssa. Käytetyt alukkeet oli kohdistettu 16S-rRNA-geenin V3-V4-alueelle. Täyspitkät alukesekvenssit, joissa käytetään standardia IUPAC-nukleotidinimikkeistöä, tälle alueelle kohdistetun protokollan noudattamiseksi ovat:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGGTATCTAAT:lle käytettiin biotietojen ja biotietojen käsittelyn menetelmää6 putkien kokoa1 tai GGGGTATCTAATmeille

Opintotyyppi

Interventio

Ilmoittautuminen (Todellinen)

80

Vaihe

  • Ei sovellettavissa

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

14 vuotta - 56 vuotta (Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Tutkimukseen rekrytoiduilla potilailla diagnosoitiin vaiheen II yleistynyt parodontiitti
  • Lääketieteellisesti sopiva

Poissulkemiskriteerit:

  • Potilaat, joilla on ientulehdus tai vaiheen III parodontiitti
  • Lääketieteellisesti kelpaamaton

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Ensisijainen käyttötarkoitus: Terveyspalvelututkimus
  • Jako: Satunnaistettu
  • Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
  • Naamiointi: Yksittäinen

Aseet ja interventiot

Osallistujaryhmä / Arm
Interventio / Hoito
Kokeellinen: Parodontiitti, Aikuinen
Plakkinäytteet otettiin subgingivaalisesta taskusta ja lähetettiin laboratorioon metagenomista analyysiä varten
Geneettinen: 16s RNA Metagenomics -sekvensointi
Subgingivaalinen plakki kerättiin käyttämällä steriiliä kyrettiä yläleuan poskihampaiden bukkaalista ja alaleuan etuhampaiden linguaalista puolta pulloon, joka sisälsi 200 ui puskuri-CL-puskuria.
Muut nimet:
  • DNA:n eristäminen
Kokeellinen: Metgenominen analyysi
Koko bakteerimäärän analyysi
Geneettinen: 16s RNA Metagenomics -sekvensointi
Subgingivaalinen plakki kerättiin käyttämällä steriiliä kyrettiä yläleuan poskihampaiden bukkaalista ja alaleuan etuhampaiden linguaalista puolta pulloon, joka sisälsi 200 ui puskuri-CL-puskuria.
Muut nimet:
  • DNA:n eristäminen

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Mikrobien taksonominen koostumus
Aikaikkuna: Perustasosta 3 kuukauteen
Koostumus määritettiin käyttämällä subgingivaalisia plakkinäytteitä ja suorittamalla 16s metagenominen sekvensointi
Perustasosta 3 kuukauteen

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

Ajman University

Tutkijat

  • Päätutkija: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Perjantai 10. marraskuuta 2017

Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)

Lauantai 15. syyskuuta 2018

Opintojen valmistuminen (Todellinen)

Maanantai 7. lokakuuta 2019

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Sunnuntai 7. kesäkuuta 2020

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 9. kesäkuuta 2020

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Torstai 11. kesäkuuta 2020

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Torstai 11. kesäkuuta 2020

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 9. kesäkuuta 2020

Viimeksi vahvistettu

Maanantai 1. kesäkuuta 2020

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Avainsanat

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • F-H-17-11-03

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

Ei

IPD-suunnitelman kuvaus

Mikrobien taksonominen koostumus

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Parodontaaliset sairaudet

Kliiniset tutkimukset 16s RNA Metagenomics -sekvensointi

Hae vastaavia kokeiluja

Sponsorit ja yhteistyökumppanit

Sairaudet

Huumeiden interventiot

CROs by country

CROs in Mozambique

Ehdot

Harvinaiset sairaudet

Huumeiden interventiot

Ravintolisät

Sponsori / yhteistyökumppanit

Sijainnit

Tilaa