Ezt az oldalt automatikusan lefordították, és a fordítás pontossága nem garantált. Kérjük, olvassa el a angol verzió forrásszöveghez.

Mikrobás profilalkotás a zsebekben a krónikus parodontózisos betegekkel kapcsolatban 16s RNS metagenomikai szekvenálás segítségével

2020. június 9. frissítette: sudhir rama varma, Ajman University

Mikrobás profilalkotás a zsebekben az Egyesült Arab Emírségekben élő krónikus parodontózisos betegekhez kapcsolódóan a 16s RNS metagenomikai szekvenálás segítségével

A tanulmányt az orvosi kutatásról szóló Helsinki Nyilatkozat (2017-A-DN-04) bevonásával dolgozták ki az Ajman Egyetem Etikai Bizottságával. A vizsgálatban való részvétel előtt minden résztvevőtől tájékozott beleegyezést kaptak. A résztvevők szisztémásan egészségesek voltak, és nem kaptak antibiotikumot az elmúlt három hónapban. A vizsgálatba bevont betegeket II. stádiumú generalizált parodontitiszként diagnosztizálták a 2017-es világműhely „a parodontális és periimplantális betegségek és állapotok osztályozásáról” szóló osztályozása szerint. A periodontális státusz a 3-4 mm-es interdentális klinikai tapadás-vesztés súlyosságát, a radiográfiás csontvesztést 15-33% között, és fogvesztést nem tartalmazza. A vizsgálatba bevonták a ≤ 5 mm maximális szondázási mélységű, vízszintes csontvesztéssel járó periodontitis komplexitását, amelynek kiterjedése és eloszlása ​​több mint 30%-ban érintett fogak esetén. Összesen 80 plakkmintát gyűjtöttünk a páciens klinikai jellemzőivel, 25-39 év közöttiek, 36 nő és 44 férfi. A szubgingivális plakkot steril küret segítségével gyűjtöttük össze a felső nagyőrlőfogak bukkális és a mandibularis metszőfogak nyelvi oldaláról egy 200 µl CL puffert tartalmazó fiolába.

A tanulmány áttekintése

Állapot

Befejezve

Körülmények

Részletes leírás

Az összegyűjtött plakkmintákat ezután frissen készítettük elő a DNS-izoláláshoz ABIOpure TM Total DNA (2.0-s verzió) (katalógusszám: M501DP100) alkalmazásával a gyártó utasításai szerint. Az összes mintát spektrofotometriával értékeltük DNS mennyiségi meghatározására, majd fluorometriás módszerrel tovább kvantifikáltuk. Ez a DeNovix DS-11 FX (DeNovix) segítségével történt. A DNS mennyiségi meghatározását követően a DNS integritását 0,8%-os agaróz gélen oldottuk fel etidium-bromiddal. Az NGS-könyvtár elkészítéséhez az összes mintában az izolált bakteriális DNS-ben lévő 16S rRNS gén PCR-amplifikációját végeztük. Az alkalmazott primerek a 16S rRNS gén V3-V4 régióját célozták meg. A teljes hosszúságú primer szekvenciák a szabványos IUPAC nukleotid nómenklatúrát használva, az ezt a régiót célzó protokollt követve a következők:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGGTATCTAAT a bioadatok feldolgozása volt a mikroinformáció1 és a bioinformációs szekvencia1 elektroinformációt használták a csőmérethez

Tanulmány típusa

Beavatkozó

Beiratkozás (Tényleges)

80

Fázis

  • Nem alkalmazható

Kapcsolatok és helyek

Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.

Tanulmányi helyek

Részvételi kritériumok

A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.

Jogosultsági kritériumok

Tanulmányozható életkorok

14 év (Felnőtt)

Egészséges önkénteseket fogad

Nem

Tanulmányozható nemek

Összes

Leírás

Bevételi kritériumok:

  • A vizsgálatba bevont betegeket II. stádiumú generalizált parodontitisként diagnosztizálták
  • Orvosilag alkalmas

Kizárási kritériumok:

  • Fogínygyulladásban vagy III. stádiumú parodontózisban szenvedő betegek
  • Orvosilag alkalmatlan

Tanulási terv

Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.

Hogyan készül a tanulmány?

Tervezési részletek

  • Elsődleges cél: Egészségügyi szolgáltatások kutatása
  • Kiosztás: Véletlenszerűsített
  • Beavatkozó modell: Egyetlen csoportos hozzárendelés
  • Maszkolás: Egyetlen

Fegyverek és beavatkozások

Résztvevő csoport / kar
Beavatkozás / kezelés
Kísérleti: Parodontitis, felnőtt
A plakkmintákat a szubgingivális zsebből vettük, és a laborba küldtük metagenomikai elemzésre
A szubgingivális plakkot steril küret segítségével gyűjtöttük össze a felső nagyőrlőfogak bukkális és a mandibularis metszőfogak nyelvi oldaláról egy 200 µl CL puffert tartalmazó fiolába.
Más nevek:
  • DNS izolálás
Kísérleti: Metgenomikai elemzés
A teljes baktériumszám elemzése
A szubgingivális plakkot steril küret segítségével gyűjtöttük össze a felső nagyőrlőfogak bukkális és a mandibularis metszőfogak nyelvi oldaláról egy 200 µl CL puffert tartalmazó fiolába.
Más nevek:
  • DNS izolálás

Mit mér a tanulmány?

Elsődleges eredményintézkedések

Eredménymérő
Intézkedés leírása
Időkeret
Mikrobiális taxonómiai összetétel
Időkeret: Az alaphelyzettől 3 hónapig
Az összetételt szubgingivális plakk minták és 16 másodperces metagenomikus szekvenálás segítségével határoztuk meg.
Az alaphelyzettől 3 hónapig

Együttműködők és nyomozók

Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.

Szponzor

Nyomozók

  • Kutatásvezető: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Tanulmányi rekorddátumok

Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.

Tanulmány főbb dátumok

Tanulmány kezdete (Tényleges)

2017. november 10.

Elsődleges befejezés (Tényleges)

2018. szeptember 15.

A tanulmány befejezése (Tényleges)

2019. október 7.

Tanulmányi regisztráció dátumai

Először benyújtva

2020. június 7.

Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2020. június 9.

Első közzététel (Tényleges)

2020. június 11.

Tanulmányi rekordok frissítései

Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)

2020. június 11.

Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak

2020. június 9.

Utolsó ellenőrzés

2020. június 1.

Több információ

A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések

Egyéb vizsgálati azonosító számok

  • F-H-17-11-03

Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)

Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?

Nem

IPD terv leírása

Mikrobiális taxonómiai összetétel

Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok

Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz

Nem

Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz

Nem

Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .

Iratkozz fel