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Perfil microbiano em bolsos relacionados a pacientes com periodontite crônica usando sequenciamento de metagenômica de RNA 16s

9 de junho de 2020 atualizado por: sudhir rama varma, Ajman University

Perfil microbiano em bolsos relacionados a pacientes com periodontite crônica na população dos Emirados Árabes Unidos usando sequenciamento de metagenômica de RNA 16s

O estudo foi desenvolvido em conformidade com a Declaração de Helsinque sobre pesquisa médica envolvendo o Comitê de Ética da Universidade de Ajman (2017-A-DN-04). O consentimento informado de todos os participantes foi obtido antes da participação no estudo. Os participantes eram sistemicamente saudáveis, sem história de antibióticos nos últimos três meses. Os pacientes recrutados para o estudo foram diagnosticados como periodontite generalizada estágio II de acordo com a classificação do workshop mundial de 2017 sobre a "classificação de doenças e condições periodontais e peri-implantares". Estado periodontal indicando a gravidade da perda de inserção clínica interdental de 3-4 mm, perda óssea radiográfica entre 15%-33% e sem perda dentária foram incluídos. A complexidade da periodontite com profundidade máxima de sondagem ≤ 5 mm com perda óssea horizontal e com extensão e distribuição com > 30% dos dentes envolvidos foram incluídos no estudo. Um total de 80 amostras de placas foram coletadas com as características clínicas do paciente compreendendo idade entre 25-39 anos, 36 mulheres e 44 homens. A placa subgengival foi coletada com uma cureta estéril da face vestibular dos molares superiores e da face lingual dos incisivos inferiores, em um frasco contendo 200µl de Buffer CL.

Visão geral do estudo

Status

Concluído

Condições

Intervenção / Tratamento

Descrição detalhada

As amostras de placa coletadas foram então preparadas recentemente para o isolamento de DNA usando ABIOpure TM Total DNA (versão 2.0) (Cat No: M501DP100) de acordo com as instruções do fabricante. Todas as amostras foram avaliadas quanto à quantificação do DNA por espectrofotometria e posteriormente quantificadas pelo método fluorométrico. Isso foi realizado usando DeNovix DS-11 FX (DeNovix). Além da quantificação do DNA, a avaliação da integridade do DNA foi resolvida em gel de agarose 0,8% com brometo de etídio. Para a preparação da biblioteca NGS, todas as amostras foram submetidas à amplificação por PCR do gene 16S rRNA no DNA bacteriano isolado. Os primers utilizados tinham como alvo a região V3-V4 do gene 16S rRNA. As sequências de iniciadores de comprimento total, usando a nomenclatura padrão de nucleotídeos da IUPAC, para seguir o protocolo direcionado a essa região são:

16SAmpliconPCRForwardPrimer=5' TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG 16SAmpliconPCRReversePrimer=5' GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC O método de eletroforese em gel foi usado para a seleção do tamanho e o pipeline de bioinformática usado para processar os dados da sequência 16S do microbioma foi QIIME

Tipo de estudo

Intervencional

Inscrição (Real)

80

Estágio

  • Não aplicável

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Locais de estudo

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

14 anos a 56 anos (Adulto)

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Gêneros Elegíveis para o Estudo

Tudo

Descrição

Critério de inclusão:

  • Os pacientes recrutados para o estudo foram diagnosticados como periodontite generalizada estágio II
  • medicamente apto

Critério de exclusão:

  • Pacientes com gengivite ou periodontite estágio III
  • Medicamente inapto

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Finalidade Principal: Pesquisa de serviços de saúde
  • Alocação: Randomizado
  • Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
  • Mascaramento: Solteiro

Armas e Intervenções

Grupo de Participantes / Braço
Intervenção / Tratamento
Experimental: Periodontite, Adulto
Amostras de placa foram retiradas da bolsa subgengival e enviadas ao laboratório para análise metagenômica
Genético: Sequenciamento de metagenômica de RNA 16s
A placa subgengival foi coletada com uma cureta estéril da face vestibular dos molares superiores e da face lingual dos incisivos inferiores, em um frasco contendo 200µl de Buffer CL.
Outros nomes:
  • Isolamento de DNA
Experimental: Análise metgenômica
Análise para contagem bacteriana total
Genético: Sequenciamento de metagenômica de RNA 16s
A placa subgengival foi coletada com uma cureta estéril da face vestibular dos molares superiores e da face lingual dos incisivos inferiores, em um frasco contendo 200µl de Buffer CL.
Outros nomes:
  • Isolamento de DNA

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Composição taxonômica microbiana
Prazo: Da linha de base até 3 meses
A composição foi determinada usando amostras de placa subgengival e realizando sequenciamento metagenômico de 16s
Da linha de base até 3 meses

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Patrocinador

Ajman University

Investigadores

  • Investigador principal: Sudhir Varma, MDS, Assistant Professor

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

10 de novembro de 2017

Conclusão Primária (Real)

15 de setembro de 2018

Conclusão do estudo (Real)

7 de outubro de 2019

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

7 de junho de 2020

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

9 de junho de 2020

Primeira postagem (Real)

11 de junho de 2020

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Real)

11 de junho de 2020

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

9 de junho de 2020

Última verificação

1 de junho de 2020

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Palavras-chave

Termos MeSH relevantes adicionais

Outros números de identificação do estudo

  • F-H-17-11-03

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

Não

Descrição do plano IPD

Composição taxonômica microbiana

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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