COVID-19 : Étude épidémiologique de la propagation du SARS-CoV-2 dans le ménage d'une personne ayant eu une maladie COVID-19 (FAMICOV)

La transmission du virus est possible à partir de patients sans ou avec très peu de symptômes. La charge virale est élevée dès le début des symptômes puis diminue jusqu'à la limite de détection à J21. La période de contagiosité débuterait 2,3 jours avant les symptômes (IC 95 %, 0,8-3,0 J) et atteindrait un pic à 0,7 J (IC à 95 %, -0,2-2,0 J). Cette contagiosité diminuerait alors rapidement dans les 7 jours avec une proportion estimée de transmission pré-symptomatique de 44 %.

Les anticorps IgG et IgM générés par le SARS-CoV-2 peuvent être détectés 1 à 3 semaines après l'exposition.

Guo et al ont étudié la cinétique des réponses IgM, IgA et IgG par un ELISA basé sur le noyau SARS-CoV-2 sur 208 plasmas de 82 cas confirmés et 58 cas probables de COVID-19. Les anticorps sont retrouvés dès le premier jour après le début des symptômes. Le délai médian de détection des IgM et IgA était de 5 jours (IQR, 3-6), tandis que les IgG étaient détectées 14 jours (IQR, 10-18) après l'apparition des symptômes, avec un taux de positivité de 85, 4 %, 92,7 % et 77,9 %, respectivement. Dans les cas confirmés et probables, les taux d'anticorps IgM positifs étaient de 75,6 % et 93,1 %, respectivement. L'efficacité de détection par IgM ELISA est supérieure à celle de la PCR après 5,5 jours d'apparition des symptômes. Le taux de détection des infections est augmenté (98,6 %) en combinant le test ELISA IgM avec la PCR pour chaque patient par rapport à un seul test qPCR (51,9 %). Aucune réactivité croisée n'a été trouvée avec les coronavirus courants.

Zhao et al ont recherché les anticorps totaux, IgM et IgG chez 173 patients (âge médian, 48 ans) avec COVID-19 confirmé par PCR. Le taux global de séroconversion, IgM et IgG, était de 93 %, 82,7 % et 64,7 %, respectivement, avec un délai médian de séroconversion vers le 12e jour. La présence d'anticorps est inférieure à 40% au cours de la semaine suivant le début de la maladie pour atteindre 100% (Ac), 94% (IgM) et 80% (IgG) au jour 15.

Dans une étude portant sur 285 patients atteints de COVID-19, 100 % des patients ont développé des anticorps spécifiques dans un délai moyen de 19 jours après l'apparition des symptômes. Le plateau des anticorps IgG et IgM est atteint six jours après la séroconversion.

Peu de données existent sur la propagation intra-familiale de la maladie COVID 19, notamment dans sa forme mineure ou modérée suivie en ambulatoire.

Une étude, réalisée en Chine, a évalué 318 clusters d'au moins 3 cas groupés > 3 cas qui concernaient un total de 1245 cas, survenus dans 320 communes. La majorité des cas sont regroupés à domicile (80%) puis dans les transports (26%). La plupart des cas regroupés à domicile concernent 3 à 5 cas. La cohabitation apparaît comme un risque majeur de contamination.

A Shenzhen, l'investigation de 39 cas COVID/PCR et leurs 1 286 contacts montre un taux de transmission (mesuré par PCR) de 111,2% [9,1 - 13,8]. Les taux de transmission sont importants lorsque les contacts vivent dans le ménage ou ont voyagé avec le cas index.

En France, peu de données sont encore disponibles. Une étude épidémiologique, réalisée fin mars 2020, a testé 661 personnes en sérologie en lien avec le lycée de Crépy-en-Valois (Oise) où travaillait un enseignant, premier cas de COVID français. Il semble que le taux d'attaque d'infection était le plus élevé parmi le personnel, les enseignants et les élèves des écoles secondaires, et beaucoup plus faible parmi les parents et les frères et sœurs des élèves.

La soudaineté de l'épidémie de COVID-19, sa propagation, son nouveau caractère ont fait échouer de nombreux systèmes de santé.

En l'absence de traitement efficace contre le COVID-19 à ce jour, seules des mesures préventives peuvent être efficaces.

Le caractère rapidement épidémique et le manque d'équipements de protection suffisants n'ont pas permis d'avoir des mesures de protection parfaitement adéquates, même après le confinement.

De même, dans l'entourage d'un patient atteint du COVID-19, la raréfaction des tests de diagnostic direct (PCR) de février à avril n'a permis de diagnostiquer que les personnes symptomatiques ayant recours au système hospitalier ou travaillant dans un système de soins.

Pour une réponse de santé publique adaptée, une estimation du nombre de personnes ayant rencontré le virus et potentiellement protégées est fondamentale.

Il existe peu de données sur l'exposition au virus, mesurée par la présence d'anticorps spécifiques dans l'entourage d'un cas index.

Plusieurs situations de confinement dans des espaces clos (bateaux de croisière) ont conduit à des taux de transmission de l'ordre de 20 %.

L'étude FAMI-CoV propose d'évaluer le taux d'exposition au virus chez les contacts partageant le même foyer de cas index. Une sous-étude évaluera la proportion d'anticorps neutralisants.

Il s'agit d'une étude transversale monocentrique réalisée sur la cohorte de patients index suivis en ambulatoire

Le recrutement se fera à partir du fichier actif des patients inclus dans la cohorte COVID/PSL ou des patients suivis en médecine de ville.

Dépistage Cette visite permet de proposer l'étude à chaque patient (cas INDEX) correspondant aux critères d'inclusion et à leurs contacts vivant dans le même ménage sur les données enregistrées dans les dossiers de suivi clinique.

Elle a lieu après vérification des critères d'inclusion et d'exclusion des sujets. Cette visite peut se faire par téléphone. Le formulaire d'information et de consentement du patient est remis au patient ou à sa famille.

Visite d'inclusion et test sérologique

Cette visite vous permet de :

1. expliquer les objectifs de l'étude et les méthodes d'essai
2. donner son consentement et obtenir des signatures
3. remplir le questionnaire pour les cas index et les contacts
4. réaliser un test rapide de recherche d'anticorps anti SARS-CoV-2, au bout du doigt (prélèvement effectué par un professionnel habilité à réaliser ces tests)
5. la lecture du résultat est immédiate
6. le résultat est remis et commenté à chaque membre du ménage ; ils seront conservés.

Ce processus est répété pour chaque cas index et chaque cas contact.

Réalisation du test rapide d'anticorps anti-SARS-CoV-2 Choix du test Le test rapide COVID-19 IgG/IgM (sang total/sérum/plasma) (COVID-PRESTO fabriqué par la société AAZ) est un test immunochromatographique en phase solide pour la détection rapide, qualitative et différentielle des anticorps IgG et IgM dirigés contre le SARSCoV -2 qui permet d'affirmer, en l'absence de symptômes, un contact avec le virus et une immunité acquise a priori protectrice. Le test utilise des anticorps anti IgM humains (ligne test IgM), des anticorps anti IgG humains (ligne test IgG) et des IgG de lapin (ligne contrôle (C)) immobilisés sur une bandelette de nitrocellulose. Le conjugué (antigènes COVID-19 recombinants marqués à l'or colloïdal) est également intégré à la bandelette.

Ce test a été évalué par 3 laboratoires (laboratoire de virologie de l'hôpital Bichat, laboratoire d'Orléans, laboratoire de référence CNR Lyon Pr B. Lina.

Pratique de l'épreuve

• Le test rapide est réalisé à l'aide d'une goutte de sang prélevée au bout du doigt (10 microlitres) à l'aide d'une lancette.
• La pipette compte-gouttes, tenue verticalement, recueille la goutte de sang total jusqu'à la "ligne de prélèvement"
• Déposer 1 goutte de sang total (10 μL dans le puits échantillon (S) de la cassette.
• Ajouter immédiatement 2 gouttes (80μL) de tampon dans le puits (B) de la cassette.
• Évitez les bulles d'air; s'il y a une bulle d'air, ajouter une 3ème goutte de tampon.

La lecture est effectuée au bout de 10 minutes maximum par le professionnel de santé sous contrôle médical. La positivité peut apparaître après 1 à 3 minutes.

La lecture ne doit pas dépasser 30 minutes. Les tests rapides seront réalisés soit par des personnels habilités qui les pratiquent régulièrement dans le cadre des actions de dépistage VIH/Hépatite.

En cas de séropositivité du test rapide, il pourra être proposé aux cas index et contacts adultes, un prélèvement sanguin de 5 ml de sang pour une sérothèque permettant une caractérisation des anticorps et notamment des anticorps neutralisants.