Polymorphismes du gène HSD3B1 avec des résultats chez les patients infectés par le SRAS-CoV-2
Une analyse exploratoire de l'expression des récepteurs et des protéases activatrices médiant l'entrée du SRAS-CoV-2 et l'association entre les polymorphismes du gène HSD3B1 et les résultats chez les patients infectés par le SRAS-CoV-2
L'étude comprend 2 sous-projets.
Sous-projet 1 : L'objectif est d'évaluer l'expression des récepteurs et des protéases activatrices médiant l'entrée et la propagation du SRAS-CoV-2 dans la population locale du Tessin.
Sous-projet 2 : L'objectif est d'étudier l'association entre les variations du gène HSD3B1 et l'évolution du COVID-19 dans la population locale du Tessin.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Sous-projet 1 :
Il s'agit d'une étude rétrospective observationnelle qui vise à évaluer l'expression des récepteurs et des protéases activatrices médiant l'entrée et la propagation du SRAS-CoV-2 dans la population locale du Tessin. Le niveau d'expression de ces facteurs sera comparé entre sujets infectés et non infectés. Le sous-projet examinera des échantillons d'ARN provenant d'écouvillons nasopharyngés prélevés sur des sujets testés pour le COVID-19.
Sous-projet 2 :
Il s'agit d'une étude rétrospective cas-témoin basée sur l'haplotype et le diplotype qui vise à étudier l'association entre les variations du gène HSD3B1 et l'issue du COVID-19 dans la population locale du Tessin. Le statut génétique de HSD3B1 sera défini et comparé entre deux groupes de patients : les patients qui ont subi une infection grave par le SRAS-CoV-2 (insuffisance pulmonaire sévère, admission en USI, éventuellement décès) et le groupe avec un COVID-19 léger à modéré maladie sans insuffisance pulmonaire et besoin d'oxygène.
Type d'étude
Inscription (Réel)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Bellinzona, Suisse, 6500
- Oncology Institute of Southern Switzerland (IOSI)
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Lugano, Suisse, 6900
- Clinica Luganese Moncucco
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Sous-projet 1
Critère d'intégration:
- Disponibilité de l'ARN extrait d'écouvillons nasopharyngés prélevés sur des sujets testés pour le COVID-19 ;
- Le sujet est âgé de 18 ans ou plus ;
- Consentement éclairé écrit (uniquement pour les patients positifs au SRAS-CoV-2 ; voir §5 pour plus de détails).
Critère d'exclusion:
- Refus documenté.
Sous-projet 2
Critère d'intégration:
- Patients SRAS-CoV-2 hospitalisés de sexe féminin et masculin ;
- Le patient est âgé de 18 ans ou plus ;
- Disponibilité des échantillons de tissus d'archives collectés à tout moment avant l'infection par le SRAS-CoV-2 pour toute raison clinique ;
- Caractéristiques clinico-pathologiques du COVID-19 et résultats cliniques enregistrés dans la base de données EOC et Clinica Luganese Moncucco ;
- Consentement éclairé écrit (voir §5 pour plus de détails).
Critère d'exclusion:
- Refus documenté.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Autre
- Perspectives temporelles: Rétrospective
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Patients testés pour le COVID-19
Les écouvillons nasopharyngés prélevés sur des patients testés pour le Covid-19 qui se sont révélés infectés et non infectés seront analysés pour évaluer l'expression des récepteurs et des protéases activatrices médiatrices du SRAS-CoV-2.
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Niveau d'expression de l'ARNm des gènes codant pour ACE2, TMPRSS2, TMPRSS4 et AR ainsi que des gènes de référence (bêta-actine et EPCAM) dans des écouvillons nasopharyngés prélevés sur des patients testés pour COVID-19
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Patients atteints d'une infection légère à modérée et sévère par le SARS-CoV-2
La paraffine fixée au formol sera analysée pour déterminer l'association entre le polymorphisme du gène HSD3B1 et les résultats chez les patients atteints de COVID-19
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Les blocs de tissus inclus dans la paraffine fixée au formol seront amplifiés à l'aide d'expériences basées sur la réaction en chaîne par polymérase (PCR) suivies d'un séquençage direct (séquençage Sanger)
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Expression des récepteurs et activation des protéases
Délai: 1 an
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Détermination du niveau d'expression des gènes ARNm
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1 an
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Prévalence des olymorphismes du HSD3B1
Délai: 1 an
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Détermination de la prévalence des polymorphismes des patients HSD3B1 atteints d'une infection SARS-CoV-2 sévère et légère à modérée
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1 an
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Association des polymorphismes du HSD3B1
Délai: 1 an
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Evaluation de l'association des polymorphismes du HSD3B1 avec des paramètres clinico-pathologiques
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1 an
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chaise d'étude: Ricardo Pereira Mestre, MD, Oncology Institute of Southern Switzerland (IOSI)
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Réel)
Achèvement de l'étude (Réel)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- COVID19-GeneExp
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
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