Étude sur les tests génétiques chez les jeunes adultes atteints de cancer (Gen-Y)

Les chercheurs mèneront un essai randomisé auprès de jeunes adultes atteints de cancer (YA) afin de tester rigoureusement l'hypothèse selon laquelle les tests universels identifient de nombreux patients YA présentant un risque de cancer germinal qui seraient manqués par les stratégies de test conventionnelles, afin d'améliorer l'adhésion aux interventions de réduction des risques chez les JA avec susceptibilité au cancer, et d'accroître la certitude parmi les proches de ces patients à risque génétique accru. Le principal résultat de l'essai randomisé sera la détermination des proposants, mais dans une étude complémentaire, les chercheurs exploreront également l'utilité supplémentaire des tests universels en ce qui concerne la détermination du risque chez les parents.

Les patients consentants seront immédiatement randomisés à l'aide d'un algorithme de randomisation généré par ordinateur utilisant des tailles de blocs variables permutées avec une séquence masquée. La randomisation sera stratifiée selon le sexe, les critères d'orientation du National Comprehensive Cancer Network/American College of Medical Genetics and Genomics (NCCN/ACMG) (répond/ne répond pas) et l'hôpital (c'est-à-dire HUP par rapport aux autres hôpitaux de Penn Medicine). Notez qu'en raison des différences démographiques entre les hôpitaux, les enquêteurs utilisent le type d'hôpital comme indicateur de race/ethnicité et ne stratifieront donc pas séparément. La randomisation se produira dans un rapport de 2:1 (expérimental : contrôle).

Le recrutement des patients pour les tests génétiques sera terminé dans les 12 premiers mois. Si les patients reçoivent un résultat pathogène ou probablement pathogène, ils seront suivis jusqu'à cinq ans pour évaluer l'impact de l'aide à la décision clinique. Le recrutement prendra fin lorsqu'environ 1238 sujets seront inscrits. Les sujets seront recrutés dans cinq sites de Penn Medicine, dont l'hôpital de l'Université de Pennsylvanie (HUP), le Penn Presbyterian Medical Center (PPMC), l'hôpital de Pennsylvanie (PAH), l'hôpital du comté de Chester (CCH) et l'hôpital général de Lancaster (LGH).

Les patients qui sont informés de leur statut d'éligibilité et qui manifestent un intérêt à participer à l'étude seront dirigés vers un site Web éducatif sur le risque de cancer héréditaire et les implications des tests génétiques pour les patients et les membres de leur famille. Ils recevront également des informations sur l'étude. S'ils souhaitent donner leur consentement après avoir visionné le module éducatif, les patients seront automatiquement envoyés à REDCap où, après leur consentement, ils rempliront également une brève enquête pour obtenir des informations démographiques et des antécédents familiaux. Les patients auront également la possibilité d'examiner les informations, de donner leur consentement et de compléter la collecte de données sociodémographiques et familiales via des formulaires papier.

Après avoir fourni un consentement éclairé signé et déterminé le risque élevé/faible (sur la base des directives de l'ACMG/NCCN et déterminé soit par le coordinateur de recherche de l'étude, soit par le conseiller en génétique clinique, comme indiqué ci-dessus), les patients seront randomisés selon un ratio de 2:1 (expérimental : contrôle) dans l'un des deux bras de l'étude stratifiés selon le sexe, répondant aux critères NCCN/ACMG et le type d'hôpital (HUP vs. autre). Les personnes inscrites à l'étude seront encouragées à s'inscrire pour utiliser leur portail patient local, si elles ne l'ont pas déjà fait, afin de recevoir des communications sur l'étude, des informations sur la santé et des alertes de maintien de la santé.

La prise en charge des patients randomisés dans le bras basé sur le phénotype (standard) dépendra de leur identification comme présentant un risque élevé ou faible d'avoir une prédisposition génétique. Les patients qui ne répondent pas aux critères de risque élevé recevront des soins cliniques de routine (c. Les patients qui répondent aux critères de risque élevé seront référés à un conseiller en génétique de leur établissement de Penn Medicine traitant pour une évaluation et des tests génétiques standard du cancer basés sur la recommandation du conseiller en génétique et les préférences du patient. Les participants de ce bras qui reçoivent des tests génétiques seront suivis et les résultats seront saisis manuellement dans la base de données de l'étude, bien que s'ils sont testés à Ambry Genetics (le laboratoire utilisé dans le bras d'intervention de test universel), les résultats positifs seront directement importés dans PennChart (l'instance locale d'Epic des enquêteurs) via une interface sécurisée, déjà construite et opérationnelle.

Les patients randomisés dans le bras de test universel fourniront un échantillon de salive ou de sang pour le séquençage d'un large panel de gènes de risque de cancer réalisé par Ambry Genetics. Les résultats des tests génétiques iront directement dans PennChart d'Ambry via une interface sécurisée (HL7). Les patients identifiés comme étant à haut risque selon les critères du NCCN/ACMG seront référés à un conseiller en génétique de leur établissement de traitement, qui sera invité à obtenir des tests en utilisant le panel de gènes à large risque de cancer Ambry plutôt que par les tests cliniques habituels. S'ils ne font pas de suivi pour les tests cliniques, comme indiqué ci-dessus, ils seront testés par l'équipe de l'étude, à l'aide de kits de tests génétiques envoyés par la poste (avec des expéditeurs prépayés à Ambry Genetics). Les patients identifiés comme étant à faible risque subiront des tests à l'aide du large panel de gènes de risque de cancer Ambry via des kits de tests génétiques envoyés par la poste (comme ci-dessus).

Les participants vus par un conseiller en génétique se verront communiquer leurs résultats par leur équipe soignante. Les participants qui s'inscrivent à distance seront informés que leurs résultats sont disponibles via leur méthode préférée (portail patient, courrier ou e-mail). Les patients avec un résultat négatif recevront le résultat via la méthode préférée et auront la possibilité de parler avec un conseiller en génétique. Les patients dont les résultats sont positifs recevront leurs résultats par téléphone soit par l'étude, soit par leurs conseillers en génétique clinique ou leur médecin. Les patients testés à Ambry verront leurs résultats directement importés dans leurs dossiers via HL7 ; la diffusion des résultats via MyPennMedicine (MPM) n'aura lieu qu'après que le conseiller en génétique ou le médecin aura parlé avec le patient (diffusion manuelle).

Dans le cadre de cette étude, des tests génétiques sont effectués pour détecter des variantes de gènes connus pour être associés à un risque accru de cancer. Cependant, il est possible que les chercheurs ne connaissent pas tous ces gènes, et les chercheurs sont intéressés par des études qui pourraient aider à les identifier à l'avenir. Dans le cadre d'une partie facultative de l'étude, les enquêteurs solliciteront le consentement des participants pour utiliser leur échantillon d'ADN afin d'aider à comprendre le développement du cancer et d'autres maladies. Les futures recherches possibles pourraient inclure d'autres recherches sur le risque de cancer héréditaire ou le lien entre l'ADN et les résultats médicaux, y compris la réponse au traitement ou les contributions à d'autres recherches sur les maladies. Certaines recherches peuvent inclure le séquençage du génome entier, une méthode qui détermine la séquence exacte de l'ADN d'une personne. Les participants peuvent refuser de participer à cet aspect de l'étude et n'utiliser leurs échantillons que pour l'étude principale.

Les participants éligibles seront identifiés par l'un des deux mécanismes. La plupart seront identifiés via le système de dossier de santé électronique (DSE), qui chez Penn Medicine est Epic, et seront référés directement à l'équipe de l'étude via un registre Epic. Les participants seront sélectionnés par un coordinateur de recherche de l'étude pour déterminer l'éligibilité à l'étude, en s'assurant qu'ils ne répondent à aucun des critères d'exclusion de l'étude sur la base des informations contenues dans le DSE.

Alternativement, certains participants éligibles seront identifiés au moment où ils verront un conseiller en génétique dans l'une des pratiques de génétique du cancer de Penn Medicine et seront recrutés par leur conseiller en génétique local avec une randomisation immédiate. Ces patients comprendront, par exemple, des patients qui doivent être vus plus rapidement que ce qui serait pris en charge par le registre Epic (par exemple, des participants atteints d'un cancer du sein avant l'opération). Les patients qui ont déjà un rendez-vous avec la génétique du cancer au moment où ils sont pris en charge par le registre Epic seront recrutés par l'intermédiaire de leurs conseillers en génétique.

Les participants qui ne respectent pas les directives du NCCN/ACMG pour l'orientation vers un conseiller en génétique recevront des soins cliniques de routine, qui n'incluent pas la visite d'un conseiller en génétique ni les tests génétiques de prédisposition au cancer. Les participants qui respectent les directives du NCCN/ACMG seront référés à un conseiller en génétique dans leur établissement de traitement. Les tests génétiques seront ordonnés en fonction de la recommandation clinique du conseiller en génétique et de la préférence du patient. Les participants de ce bras qui reçoivent des tests génétiques seront suivis et les résultats seront saisis manuellement dans la base de données de l'étude, bien que s'ils sont testés chez Ambry Genetics, les résultats positifs peuvent être directement importés dans PennChart (notre instance locale d'Epic) via une interface sécurisée .

Les participants randomisés dans le bras de test universel subiront des tests génétiques à l'aide d'un large panel de gènes de risque de cancer via Ambry Genetics. Les participants auront des échantillons de salive prélevés. Pour les patients à faible risque, ainsi que pour les patients à haut risque qui refusent les visites du conseiller en génétique (GC), les coordonnateurs de recherche (CR) enverront un kit de salive, ainsi qu'un courrier prépayé adressé à Ambry Genetics et un formulaire de demande de test rempli, au participant.

Les commandes seront passées dans PennChart et seront directement liées à l'interface de programmation d'application (API) d'Ambry Genetics. Cette fonctionnalité a déjà été construite et implémentée dans PennChart. Pour les deux bras, les rapports cliniques d'Ambry, y compris les variantes d'interprétation, sont directement importés dans PennChart. Les participants vus par un GC verront leurs résultats retournés par cette équipe de soins. Les participants consentant à distance seront informés à l'avance qu'ils seront informés par leur méthode préférée (portail patient, courrier, e-mail) que leurs résultats génétiques sont disponibles. Les résultats négatifs seront fournis par cette méthode, avec l'option d'une visite au GC sur demande. Les participants avec des résultats positifs pathogènes/probablement pathogènes ou une variante de signification incertaine (P/LP ou VUS) seront informés que les résultats sont disponibles et seront renvoyés par téléphone par le conseiller en génétique de l'étude ou leur conseiller en génétique clinique. Les résultats VUS seront renvoyés aux patients testés avec les mises en garde appropriées.

Vérification du risque génétique chez les parents adultes au 1er degré : cette partie de l'étude explorera les différences dans la détermination du risque génétique chez les parents adultes au 1er degré des patients affectés au bras de test universel par rapport au bras dirigé par le phénotype après une combinaison d'aiguillage par le proposant et de sensibilisation directe de l'équipe clinique et/ou de recherche. Les enquêteurs émettent l'hypothèse qu'en testant tous les jeunes patients adultes atteints de tumeurs solides avec un panel complet de risque de cancer germinal plutôt que de suivre l'approche standard dirigée par les lignes directrices pour les tests génétiques germinaux des patients atteints de cancer, les enquêteurs identifieront une proportion plus élevée de leur 1er - degré de parenté comme étant à risque accru de cancer génétique.