암 연구를 가진 젊은 성인의 유전자 검사 (Gen-Y)

연구자들은 젊은 성인(YA) 암 환자들 사이에서 무작위 시험을 수행하여 보편적인 테스트가 기존의 테스트 전략으로는 놓칠 수 있는 생식계열 암 위험이 있는 많은 YA 환자를 식별한다는 가설을 엄격하게 테스트하여 암 감수성, 그리고 유전적 위험이 증가한 환자의 친척들 사이에서 확인을 증가시킵니다. 무작위 시험의 주요 결과는 발동자의 확인이지만 동반 연구에서 조사관은 친척 간의 위험 확인과 관련하여 보편적인 테스트의 점진적 유용성을 탐색할 것입니다.

동의한 환자는 은폐된 시퀀스와 함께 순열 가변 블록 크기를 사용하는 컴퓨터 생성 무작위화 알고리즘을 사용하여 즉시 무작위화됩니다. 무작위 배정은 성별, National Comprehensive Cancer Network/American College of Medical Genetics and Genomics(NCCN/ACMG) 추천 기준(충족/충족하지 않음), 병원(즉, HUP 대 기타 Penn Medicine 병원)별로 계층화됩니다. 병원 간의 인구통계학적 차이로 인해 조사관은 병원 유형을 인종/민족에 대한 대리로 사용하므로 별도로 계층화하지 않습니다. 무작위화는 2:1 비율로 발생합니다(실험: 대조군).

유전자 검사를 위한 환자 등록은 처음 12개월 이내에 완료됩니다. 환자가 병원성 또는 병원성 가능성이 있는 결과를 받은 경우 임상 의사 결정 지원의 영향을 평가하기 위해 최대 5년 동안 추적됩니다. 모집은 약 1238명의 피험자가 등록되면 종료됩니다. 펜실베니아 대학 병원(HUP), 펜실베이니아 장로병원(PPMC), 펜실베이니아 병원(PAH), 체스터 카운티 병원(CCH), 랭커스터 종합병원(LGH) 등 5개 펜실베니아 병원에서 피험자를 모집할 예정이다.

자격 상태를 통보받고 연구 참여에 대한 관심을 나타내는 환자는 유전성 암 위험과 환자 및 가족 구성원에 대한 유전자 검사의 의미에 대한 교육 웹사이트로 안내됩니다. 그들은 또한 연구에 대한 정보를 제공받을 것입니다. 교육 모듈을 본 후 동의를 원하는 경우, 환자는 자동으로 REDCap으로 보내지며 동의 후 간단한 설문 조사를 완료하여 인구 통계 및 가족력 정보를 얻습니다. 환자는 또한 종이 양식을 통해 정보를 검토하고 동의를 제공하며 사회인구학적 및 가족력 데이터 수집을 완료할 수 있습니다.

서명된 정보에 입각한 동의서를 제공하고 고위험/저위험 결정(ACMG/NCCN 지침을 기반으로 하며 위에서 설명한 대로 연구 연구 코디네이터 또는 임상 유전 상담사가 결정)에 따라 환자는 2:1 비율로 무작위 배정됩니다(실험적: 대조군)을 성별, NCCN/ACMG 기준 및 병원 유형(HUP 대 기타)에 따라 계층화된 두 연구 부문 중 하나로 분류했습니다. 연구 등록자는 아직 등록하지 않은 경우 연구 커뮤니케이션, 건강 정보 및 건강 유지 알림을 수신하기 위해 지역 환자 포털을 사용하도록 등록하도록 권장됩니다.

표현형 기반(표준) 부문에 무작위 배정된 환자의 관리는 유전적 소인을 가질 위험이 높거나 낮은 것으로 확인되었는지 여부에 따라 달라집니다. 고위험 기준을 충족하지 않는 환자는 일상적인 임상 치료를 받게 됩니다(즉, 연구 관련 유전 상담사에게 위탁하지 않음). 고위험 기준을 충족하는 환자는 유전 상담사 추천 및 환자 선호도에 따라 표준 암 유전학 평가 및 검사를 위해 치료 Penn Medicine 기관의 유전 상담사에게 의뢰됩니다. 유전자 검사를 받는 이 팔의 참가자는 추적되고 결과는 연구 데이터베이스에 수동으로 입력되지만 Ambry Genetics(보편적 검사 중재 팔에 사용되는 실험실)에서 검사를 받는 경우 긍정적인 결과는 직접 데이터베이스로 가져옵니다. 이미 구축되어 작동 중인 보안 인터페이스를 통한 PennChart(조사관의 Epic 로컬 인스턴스).

범용 테스트 부문에 무작위로 배정된 환자는 Ambry Genetics가 수행하는 광범위한 암 위험 유전자 패널의 시퀀싱을 위해 타액 또는 혈액 샘플을 제공합니다. 유전자 검사 결과는 보안 인터페이스(HL7)를 통해 Ambry의 PennChart로 직접 전달됩니다. NCCN/ACMG 기준에 따라 고위험군으로 확인된 환자는 치료 기관의 유전 상담사에게 의뢰되며, 일반 임상 검사 대신 Ambry 광역 암 위험 유전자 패널을 사용하여 검사를 받도록 요청받게 됩니다. 위에서 설명한 대로 임상 테스트에 대한 후속 조치를 취하지 않으면 우편으로 발송된 유전자 테스트 키트(Ambry Genetics로 선불 우편 발송)를 사용하여 연구 팀에서 테스트를 받게 됩니다. 위험이 낮은 것으로 확인된 환자는 우편으로 발송된 유전자 검사 키트(위와 같이)를 통해 Ambry 광역 암 위험 유전자 패널을 사용하여 검사를 받게 됩니다.

유전 상담사가 보는 참가자는 치료 팀에서 결과를 공개하게 됩니다. 원격으로 등록한 참가자는 선호하는 방법(환자 포털, 우편 또는 이메일)을 통해 결과를 확인할 수 있다는 알림을 받게 됩니다. 결과가 음성인 환자에게는 선호하는 방법을 통해 결과가 제공되고 유전 상담사와 상담할 수 있는 옵션이 제공됩니다. 양성 결과를 얻은 환자는 연구 또는 임상 유전 상담사 또는 의사가 전화로 결과를 제공합니다. Ambry에서 테스트한 환자는 결과를 HL7을 통해 차트로 직접 가져옵니다. MyPennMedicine(MPM)을 통한 결과 공개는 유전 상담사 또는 의사가 환자와 대화한 후에만 발생합니다(수동 공개).

이 연구의 일환으로 암 위험 증가와 관련된 것으로 알려진 유전자의 변이체에 대한 유전자 검사가 수행되고 있습니다. 그러나 조사관이 그러한 모든 유전자를 알지 못할 가능성이 있으며 조사관은 향후 유전자를 식별하는 데 도움이 될 수 있는 연구에 관심이 있습니다. 연구의 선택적 부분으로 조사관은 암 및 기타 질병의 발달을 이해하는 데 도움이 되도록 DNA 샘플을 사용하기 위해 참가자의 동의를 구할 것입니다. 가능한 향후 연구에는 유전성 암 위험 또는 치료에 대한 반응이나 다른 질병 연구에 대한 기여를 포함하여 DNA와 의학적 결과 사이의 연관성에 대한 다른 연구가 포함될 수 있습니다. 일부 연구에는 사람 DNA의 정확한 서열을 결정하는 방법인 전체 게놈 시퀀싱이 포함될 수 있습니다. 참가자는 연구의 이러한 측면에 대한 참여를 거부할 수 있으며 주요 연구에만 샘플을 사용합니다.

적격 참가자는 두 가지 메커니즘 중 하나를 통해 식별됩니다. 대부분은 Penn Medicine에서 Epic인 전자 건강 기록(EHR) 시스템을 통해 식별되며 Epic 레지스트리를 통해 연구 팀에 직접 참조됩니다. 참가자는 EHR에 포함된 정보를 기반으로 연구의 제외 기준을 충족하지 않는지 확인하여 연구 자격을 결정하기 위해 연구 연구 코디네이터가 선별합니다.

또는 일부 적격 참가자는 Penn Medicine 암 유전학 실습 중 하나에서 유전 상담사를 볼 때 식별되고 즉시 무작위로 현지 유전 상담사에 의해 모집됩니다. 예를 들어 이러한 환자에는 Epic 레지스트리를 통해 선택되는 것보다 더 빨리 진찰을 받아야 하는 환자가 포함됩니다(예: 수술 전 유방암 참여자). Epic 등록소에서 픽업할 때 암 유전학 예약이 이미 예약되어 있는 환자는 유전 상담사를 통해 모집됩니다.

유전 상담사 추천에 대한 NCCN/ACMG 지침을 충족하지 않는 참가자는 유전 상담사 방문 또는 암 소인에 대한 유전 검사를 포함하지 않는 일상적인 임상 치료를 받게 됩니다. NCCN/ACMG 지침을 충족하는 참가자는 치료 기관의 유전 상담사에게 의뢰됩니다. 유전자 검사는 유전 상담사의 임상 권고 및 환자 선호도에 따라 지시됩니다. 유전자 검사를 받는 이 팔의 참가자는 추적되고 결과는 수동으로 연구 데이터베이스에 입력되지만 Ambry Genetics에서 검사를 받는 경우 안전한 인터페이스를 통해 양성 결과를 PennChart(Epic의 로컬 인스턴스)로 직접 가져올 수 있습니다. .

범용 검사 부문에 무작위 배정된 참가자는 Ambry Genetics를 통해 광범위한 암 위험 유전자 패널을 사용하여 유전자 검사를 받게 됩니다. 참가자는 타액 샘플을 수집합니다. 저위험 환자와 유전 상담사(GC) 방문을 거부하는 고위험 환자의 경우, 연구 코디네이터(RC)는 Ambry Genetics로 발송되는 선불 우편물 및 작성된 테스트 요청 양식과 함께 타액 키트를 우편으로 발송합니다. 참가자에게.

주문은 PennChart에 배치되며 Ambry Genetics API(응용 프로그래밍 인터페이스)와 직접 연결됩니다. 이 기능은 이미 PennChart에 구축 및 구현되었습니다. 두 팔 모두 변형 해석을 포함한 Ambry의 임상 보고서를 PennChart로 직접 가져옵니다. GC가 본 참가자는 해당 치료 팀에서 결과를 반환받게 됩니다. 원격으로 동의하는 참여자는 선호하는 방법(환자 포털, 우편, 이메일)을 통해 유전자 결과를 사용할 수 있다는 알림을 미리 받게 됩니다. 부정적인 결과는 요청 시 GC 방문 옵션과 함께 해당 방법으로 제공됩니다. 양성 결과가 병원성/병원성일 가능성이 있거나 불확실한 의미의 변형(P/LP 또는 VUS)을 가진 참가자는 연구 유전 상담사 또는 임상 유전 상담사가 결과를 사용할 수 있으며 전화로 회신할 것임을 알립니다. VUS 결과는 적절한 경고와 함께 테스트 환자에게 반환됩니다.

1차 성인 ​​친척 간의 유전적 위험 확인: 연구의 이 부분에서는 조합 후 표현형 지정 암과 비교하여 보편적 테스트 암에 할당된 환자의 1차 성인 ​​친척 간의 유전적 위험 확인의 차이를 탐색합니다. 발의자 및 직접적인 임상 및/또는 연구 팀 아웃리치에 의한 추천. 연구자들은 암 환자의 생식계열 유전자 검사에 대한 표준 가이드라인 지향적 접근 방식을 따르기보다 포괄적인 생식계열 암 위험 패널로 고형 종양이 있는 모든 젊은 성인 환자를 검사함으로써 연구자들이 더 높은 비율의 첫 번째- 증가된 유전적 암 위험에 처한 것으로 학위 친척.