若年がん患者の遺伝子検査に関する研究 (Gen-Y)

研究者らは、若年成人（YA）がん患者を対象に無作為化試験を実施し、従来の検査戦略では見逃される生殖細胞系がんリスクを有する多くの YA 患者をユニバーサル検査で特定するという仮説を厳密に検証し、YA のリスク低減介入への遵守を改善します。がん感受性を高め、遺伝的リスクが高いこれらの患者の近親者の間で確認を増やすこと。 無作為化試験の主な結果は発端者の確認ですが、関連研究では、研究者は親戚間のリスクの確認に関して普遍的なテストの追加の有用性も調査します.

同意した患者は、コンピューター生成のランダム化アルゴリズムを使用して即座にランダム化されます。これには、配列が隠蔽された可変ブロック サイズの並べ替えが使用されます。 無作為化は、性別、National Comprehensive Cancer Network/American College of Medical Genetics and Genomics (NCCN/ACMG) の紹介基準 (満たしている/満たしていない)、および病院 (HUP と他の Penn Medicine 病院) によって層別化されます。 病院間の人口統計学的な違いのため、研究者は病院の種類を人種/民族の代用として使用しているため、個別に階層化しないことに注意してください. 無作為化は 2:1 の比率で行われます (実験: コントロール)。

遺伝子検査への患者登録は、最初の 12 か月以内に完了します。 患者が病原性または病原性の可能性のある結果を受け取った場合、臨床意思決定支援の影響を評価するために最大 5 年間追跡されます。 募集は、約1238科目登録された時点で終了します。 被験者は、ペンシルバニア大学病院 (HUP)、ペン長老派医療センター (PPMC)、ペンシルバニア病院 (PAH)、チェスター郡病院 (CCH)、およびランカスター総合病院 (LGH) を含む 5 つのペン医学施設で募集されます。

適格性を通知され、研究への参加に関心を示した患者は、遺伝性がんのリスクと、患者および家族に対する遺伝子検査の影響に関する教育ウェブサイトに誘導されます。 また、研究に関する情報も提供されます。 教育モジュールを見た後に同意したい場合、患者は自動的に REDCap に送られ、同意に続いて、人口統計および家族歴情報を取得するための簡単な調査も完了します。 患者はまた、情報を確認し、同意を与え、紙のフォームを介して社会人口統計学的および家族歴のデータ収集を完了するオプションがあります。

-署名されたインフォームドコンセントの提供と高/低リスクの決定（ACMG / NCCNガイドラインに基づいており、上記で概説したように研究研究コーディネーターまたは臨床遺伝カウンセラーのいずれかによって決定されます）、患者は2：1の比率で無作為化されます（実験的：性別、NCCN/ACMG 基準、および病院タイプ (HUP vs. その他) で層別化された 2 つの研究群の 1 つに分類されます。 研究の登録者は、研究の連絡、健康情報、および健康維持のアラートを受け取るために、ローカルの患者ポータルを使用するようにサインアップすることをお勧めします。

表現型ベース（標準）群に無作為に割り付けられた患者の管理は、患者が遺伝的素因を持つリスクが高いか低いかによって異なります。 高リスク基準を満たさない患者は、通常の臨床ケアを受けます（つまり、遺伝カウンセラーへの研究主導の紹介はありません）。 高リスク基準を満たしている患者は、遺伝カウンセラーの推奨と患者の好みに基づいて、標準的ながん遺伝学評価と検査のために、治療を行っているペン メディスン医療機関の遺伝カウンセラーに紹介されます。 遺伝子検査を受けるこのアームの参加者は追跡され、結果は研究データベースに手動で入力されますが、Ambry Genetics (普遍的な検査介入アームで使用されるラボ) でテストされた場合、肯定的な結果は直接にインポートされますPennChart (調査員の Epic のローカル インスタンス) は、既に構築され、運用されている安全なインターフェイスを経由します。

ユニバーサル検査群に無作為に割り付けられた患者は、唾液または血液サンプルのいずれかを提供し、Ambry Genetics が実施する広範ながんリスク遺伝子パネルの配列決定を行います。 遺伝子検査の結果は、安全なインターフェース (HL7) を介して Ambry から PennChart に直接送られます。 NCCN/ACMG 基準に従って高リスクであると特定された患者は、治療機関の遺伝カウンセラーに紹介され、通常の臨床検査ではなく、Ambry 広域がんリスク遺伝子パネルを使用した検査を受けるよう求められます。 上記のように、臨床試験のフォローアップを行わない場合は、郵送された遺伝子検査キットを使用して研究チームによって検査されます (Ambry Genetics へのプリペイド メーラー付き)。 低リスクであると特定された患者は、郵送された遺伝子検査キットを介して、Ambry 広域がんリスク遺伝子パネルを使用した検査を受けます（上記のとおり）。

遺伝カウンセラーの診察を受けた参加者は、ケアチームによって結果が開示されます。 リモートで登録した参加者には、希望する方法 (患者ポータル、郵便、または電子メール) で結果が入手可能であることが通知されます。 陰性結果の患者には、好ましい方法で結果が提供され、遺伝カウンセラーと話すオプションが与えられます。 肯定的な結果が得られた患者には、研究または臨床遺伝カウンセラーまたは医師から電話で結果が提供されます。 Ambry で検査を受けた患者の結果は、HL7 を介してチャートに直接インポートされます。 MyPennMedicine (MPM) による結果のリリースは、遺伝カウンセラーまたは医師が患者と話した後にのみ行われます (手動リリース)。

この研究の一環として、がんリスクの増加に関連することが知られている遺伝子のバリアントについて、遺伝子検査が行われています。 しかし、研究者がそのような遺伝子のすべてを知っているわけではない可能性があり、研究者は将来それらを特定するのに役立つかもしれない研究に興味を持っています. 研究の任意の部分として、研究者は、がんや他の病気の発症を理解するのに役立つように、DNAサンプルを使用することについて参加者に同意を求めます. 可能性のある将来の研究には、遺伝性がんリスクに関する他の研究や、治療への反応や他の疾患研究への貢献など、DNA と医学的結果との関連性が含まれる可能性があります。 一部の研究には、人の DNA の正確な配列を決定する方法である全ゲノム配列決定が含まれる場合があります。 参加者は、研究のこの側面への参加を拒否し、主要な研究に使用されるサンプルのみを持っている場合があります。

適格な参加者は、2 つのメカニズムのいずれかによって識別されます。 ほとんどは、ペン メディシンでは Epic である電子カルテ (EHR) システムを通じて特定され、Epic レジストリを介して研究チームに直接紹介されます。 参加者は、EHRに含まれる情報に基づいて研究の除外基準を満たさないことを確認しながら、研究の適格性を判断するために研究研究コーディネーターによってスクリーニングされます。

あるいは、適格な参加者の中には、ペン・メディスンのがん遺伝学診療所の 1 つで遺伝カウンセラーに会った時点で特定され、地元の遺伝カウンセラーによって即時無作為化で募集されるものもあります。 これらの患者には、たとえば、Epic レジストリを介してピックアップされるよりも迅速に診察を受ける必要がある患者が含まれます (たとえば、手術前の乳がん患者)。 Epic レジストリに登録された時点で癌遺伝学の予約がすでに予定されている患者は、遺伝カウンセラーを通じて募集されます。

遺伝カウンセラーへの紹介に関するNCCN / ACMGガイドラインを満たさない参加者は、遺伝カウンセラーの訪問やがん素因の遺伝子検査を含まない定期的な臨床ケアを受けます。 NCCN/ACMG ガイドラインを満たしている参加者は、治療機関の遺伝カウンセラーに紹介されます。 遺伝子検査は、遺伝カウンセラーの臨床的推奨と患者の好みに基づいて注文されます。 遺伝子検査を受けるこの腕の参加者は追跡され、結果は研究データベースに手動で入力されますが、Ambry Genetics で検査された場合、安全なインターフェースを介して PennChart (Epic のローカル インスタンス) に肯定的な結果を直接インポートできます。 .

ユニバーサル検査群に無作為に割り付けられた参加者は、Ambry Genetics による広範ながんリスク遺伝子パネルを使用した遺伝子検査を受けます。 参加者は唾液サンプルを採取します。 リスクの低い患者、および遺伝カウンセラー (GC) の訪問を拒否するリスクの高い患者の場合、研究コーディネーター (RC) は、Ambry Genetics 宛てのプリペイド メーラーと記入済みの検査依頼書とともに、唾液キットを郵送します。参加者に。

注文は PennChart で行われ、Ambry Genetics のアプリケーション プログラミング インターフェイス (API) に直接リンクされます。 この機能は、PennChart で既に構築および実装されています。 両方のアームについて、バリアントの解釈を含む Ambry からの臨床レポートが PennChart に直接インポートされます。 GC によって確認された参加者には、そのケア チームから結果が返されます。 リモートで同意する参加者には、希望する方法 (患者ポータル、郵便、電子メール) で遺伝子結果が利用可能であることが通知されることが事前に通知されます。 否定的な結果は、要求に応じて GC 訪問のオプションとともに、その方法によって提供されます。 陽性の結果が病原性/病原性の可能性が高いか、または重要性が不明なバリアント（P / LPまたはVUS）の参加者は、結果が利用可能であり、研究遺伝カウンセラーまたは臨床遺伝カウンセラーから電話で返されることが通知されます。 VUS の結果は、適切な警告とともに、検査を受けた患者に返されます。

第1度成人近親者における遺伝的リスクの確認：研究のこの部分では、併用後の表現型指向型アームと比較して、ユニバーサルテスト群に割り当てられた患者の第1度成人近親者における遺伝的リスクの確認の違いを調査します。発端者による紹介と直接の臨床および/または研究チームのアウトリーチ。 研究者らは、がん患者の生殖細胞系遺伝子検査に対する標準的なガイドライン指向のアプローチに従うのではなく、包括的な生殖細胞系がんリスクパネルを用いてすべての若年成人の固形腫瘍患者を検査することにより、研究者が最初のがんのより高い割合を特定するという仮説を立てています。度近親者は遺伝性がんのリスクが高いとされています。