Genetikai tesztelés rákos fiatal felnőtteknél, tanulmány (Gen-Y)

A kutatók randomizált vizsgálatot fognak végezni fiatal felnőtt (YA) rákos betegek körében, hogy szigorúan teszteljék azt a hipotézist, miszerint az univerzális tesztelés sok olyan YA-beteget azonosít, akiknél fennáll a csíravonal rák kockázata, akiket a hagyományos tesztelési stratégiák kihagynának, hogy javítsák a kockázatcsökkentő beavatkozások betartását a YA-k körében. a rákra való fogékonyság, valamint a fokozott genetikai kockázatnak kitett betegek hozzátartozói körében. A randomizált vizsgálat elsődleges eredménye a proband megállapítása lesz, de egy kísérő vizsgálat során a kutatók azt is feltárják, hogy az univerzális tesztelés milyen inkrementális hasznát veszi a rokonok közötti kockázat megállapításának.

A beleegyező betegeket azonnal randomizálják egy számítógép által generált randomizációs algoritmus segítségével, amely permutált változó blokkméreteket és rejtett sorrendet használ. A véletlenszerű besorolást nem, a National Comprehensive Cancer Network/American College of Medical Genetics and Genomics (NCCN/ACMG) beutalási kritériumai (megfelel/nem felel meg) és a kórház (azaz HUP és más Penn Medicine kórházak) szerint rétegzik. Vegye figyelembe, hogy a kórházak közötti demográfiai különbségek miatt a vizsgálók a kórháztípust használják a rassz/etnikai hovatartozás helyettesítőjeként, ezért nem fognak külön rétegezni. A véletlenszerűsítés 2:1 arányban történik (kísérleti: kontroll).

A betegek genetikai vizsgálatra történő beiratkozása az első 12 hónapon belül megtörténik. Ha a betegek patogén vagy valószínű patogén eredményt kapnak, akkor legfeljebb öt évig követik őket, hogy értékeljék a klinikai döntéstámogatás hatását. A toborzás akkor ér véget, ha hozzávetőleg 1238 alanyt vesznek fel. Az alanyokat a Penn Medicine öt telephelyén toborozzák, köztük a Pennsylvaniai Egyetem Kórházában (HUP), a Penn Presbyterian Medical Centerben (PPMC), a Pennsylvaniai Kórházban (PAH), a Chester Megyei Kórházban (CCH) és a Lancaster General Hospitalban (LGH).

Azok a betegek, akik értesítést kaptak jogosultsági státuszukról, és érdeklődésüket jelzik a vizsgálatban való részvétel iránt, egy oktató weboldalra irányítják át az örökletes rákkockázatról, valamint a genetikai vizsgálatnak a betegekre és családtagjaira gyakorolt ​​​​hatásairól. A tanulmányról is tájékoztatást kapnak. Ha az oktatási modul megtekintése után bele kívánnak járulni, a betegek automatikusan a REDCap-ba kerülnek, ahol a beleegyezés után egy rövid felmérést is kitöltenek, hogy demográfiai és családtörténeti információkat szerezzenek. A betegeknek lehetőségük lesz az információk áttekintésére, a beleegyezés megadására, valamint a szociodemográfiai és a családtörténeti adatok gyűjtésének befejezésére papíralapú űrlapokon.

Az aláírt, tájékozott beleegyezés megadása és a magas/alacsony kockázat meghatározása (az ACMG/NCCN irányelvek alapján, és a kutatási koordinátor vagy a klinikai genetikai tanácsadó határozza meg a fent leírtak szerint) a betegeket 2:1 arányban véletlenszerűen besorolják (kísérleti: kontroll) a nemek szerint rétegzett két vizsgálati kar egyikébe, amelyek megfelelnek az NCCN/ACMG kritériumoknak és a kórház típusának (HUP vs. egyéb). A tanulmányokra jelentkezőket arra biztatjuk, hogy regisztráljanak helyi betegportáljuk használatára, ha még nem tették meg, hogy tanulmányi kommunikációt, egészségügyi információkat és egészségügyi karbantartási figyelmeztetéseket kapjanak.

A fenotípus alapú (standard) csoportba randomizált betegek kezelése attól függ, hogy a genetikai hajlam magas vagy alacsony kockázatának vannak-e kitéve. Azok a betegek, akik nem felelnek meg a magas kockázati kritériumoknak, rutin klinikai ellátásban részesülnek (azaz nem kell tanulmányozni a genetikai tanácsadóhoz). Azokat a betegeket, akik megfelelnek a magas kockázati kritériumoknak, a kezelő Penn Medicine intézmény genetikai tanácsadójához irányítják, hogy a genetikai tanácsadó ajánlása és a beteg preferenciája alapján standard rákgenetikai értékelést és vizsgálatot végezzenek. Az ebben a karban részt vevő, genetikai vizsgálatban részesülő résztvevőket nyomon követik, és az eredményeket manuálisan beviszik a vizsgálati adatbázisba, bár ha az Ambry Geneticsnél (az univerzális tesztelő beavatkozási karban használt laborban) tesztelik őket, akkor a pozitív eredményeket közvetlenül importálják a vizsgálati adatbázisba. A PennChart (a nyomozók Epic helyi példánya) egy biztonságos interfészen keresztül, amely már meg van építve és működik.

Az univerzális vizsgálati csoportba randomizált betegek nyál- vagy vérmintát adnak az Ambry Genetics által végzett széles rákkockázati génpanel szekvenálása céljából. A genetikai tesztek eredményei közvetlenül a PennChartba kerülnek az Ambry-től egy biztonságos interfészen (HL7) keresztül. Az NCCN/ACMG-kritériumok szerint magas kockázatnak kitett betegeket a kezelő intézmény genetikai tanácsadójához irányítják, akit felkérnek arra, hogy a szokásos klinikai tesztek helyett az Ambry széles rákkockázati génpanel segítségével végezzen vizsgálatot. Ha nem követik nyomon a klinikai vizsgálatot, amint azt fentebb vázoltuk, a vizsgálati csoport megvizsgálja őket, postai úton küldött genetikai tesztelő készletek segítségével (előre fizetett levelekkel az Ambry Genetics számára). Az alacsony kockázatúként azonosított betegeket az Ambry széles körű rákkockázati génpanel segítségével tesztelik, postai úton elküldött genetikai tesztelő készleteken keresztül (a fentiek szerint).

A genetikai tanácsadó által meglátott résztvevők eredményeiket a gondozási csapatuk közli velük. A távolról beiratkozó résztvevők értesítést kapnak arról, hogy eredményeik elérhetők az általuk választott módszeren keresztül (betegportál, levél vagy e-mail). A negatív eredménnyel rendelkező betegek az előnyben részesített módszerrel megkapják az eredményt, és lehetőséget kapnak arra, hogy beszéljenek genetikai tanácsadóval. A pozitív eredménnyel rendelkező páciensek eredményeit telefonon tájékoztatják a vizsgálatban résztvevők, vagy klinikai genetikai tanácsadóik vagy orvosuk. Az Ambry-ben tesztelt betegek eredményei közvetlenül a HL7-en keresztül importálhatók a diagramjukba; Az eredmények közzététele a MyPennMedicine (MPM) segítségével csak akkor történik meg, ha a genetikai tanácsadó vagy az orvos beszélt a pácienssel (manuális kiadás).

A tanulmány részeként genetikai vizsgálatokat végeznek azon gének változataira vonatkozóan, amelyekről ismert, hogy fokozott rákkockázattal járnak együtt. Lehetséges azonban, hogy a kutatók nem ismernek minden ilyen gént, és a kutatókat olyan vizsgálatok érdeklik, amelyek segíthetnek azonosítani őket a jövőben. A vizsgálat választható részeként a kutatók beleegyezést kérnek a résztvevőktől, hogy DNS-mintájukat felhasználják a rák és más betegségek kialakulásának megértéséhez. A lehetséges jövőbeli kutatások magukban foglalhatnak más kutatásokat is, amelyek az öröklött rákkockázatra vagy a DNS és az orvosi eredmények közötti kapcsolatra vonatkoznak, beleértve a kezelésre adott választ vagy az egyéb betegségkutatásokhoz való hozzájárulást. Egyes kutatások magukban foglalhatják a teljes genom szekvenálását, egy olyan módszert, amely meghatározza az ember DNS-ének pontos szekvenciáját. A résztvevők elutasíthatják a vizsgálat ezen aspektusában való részvételt, és csak a mintáikat használhatják fel a fő vizsgálathoz.

A jogosult résztvevők azonosítása két mechanizmus egyikével történik. A legtöbbet az elektronikus egészségügyi nyilvántartás (EHR) rendszeren keresztül azonosítják, amely a Penn Medicine-nél az Epic, és az Epic nyilvántartáson keresztül közvetlenül a tanulmányozó csoporthoz kerülnek. A résztvevőket egy tanulmányi kutatási koordinátor átvizsgálja, hogy megállapítsa a tanulmányi jogosultságot, és megbizonyosodjon arról, hogy az EHR-ben szereplő információk alapján nem felelnek meg a vizsgálat egyetlen kizárási kritériumának sem.

Alternatív megoldásként néhány jogosult résztvevőt azonosítanak, amikor genetikai tanácsadót keresnek fel a Penn Medicine rákgenetikai praxisában, és a helyi genetikai tanácsadó azonnali randomizálással felveszi őket. Ezek közé a betegek közé tartoznak például azok a betegek, akiket gyorsabban kell ellátni, mint az Epic regiszteren keresztül (pl. mellrákos résztvevők a műtét előtt). Azokat a betegeket, akiknek az Epic regiszter általi felvételekor rákgenetikai vizsgálatra már időpontot egyeztettek, genetikai tanácsadójukon keresztül veszik fel.

Azok a résztvevők, akik nem felelnek meg az NCCN/ACMG-irányelveknek a genetikai tanácsadóhoz való utaláshoz, rutin klinikai ellátásban részesülnek, amely nem foglalja magában a genetikai tanácsadó látogatását vagy a rákra való hajlam genetikai vizsgálatát. Azokat a résztvevőket, akik megfelelnek az NCCN/ACMG irányelveinek, a kezelő intézmény genetikai tanácsadójához irányítják. A genetikai vizsgálatot a genetikai tanácsadó klinikai javaslata és a páciens preferenciája alapján rendelik el. Ezen a karon a genetikai vizsgálaton átesett résztvevőket nyomon követik, és az eredményeket manuálisan beírják a vizsgálati adatbázisba, bár ha az Ambry Geneticsnél tesztelik őket, a pozitív eredmények közvetlenül importálhatók a PennChartba (az Epic helyi példánya) egy biztonságos felületen keresztül. .

Az univerzális tesztelési karba véletlenszerűen kiválasztott résztvevők genetikai vizsgálaton vesznek részt az Ambry Genetics széles rákkockázati génpaneljének felhasználásával. A résztvevőktől nyálmintát vesznek. Az alacsony kockázatú betegek, valamint a nagy kockázatú betegek számára, akik elutasítják a genetikai tanácsadó (GC) látogatását, a kutatási koordinátorok (RC-k) egy nyálkészletet küldenek, az Ambry Genetics-nek címzett előre fizetett levelet és a kitöltött vizsgálati igénylőlapot, a résztvevőnek.

A megrendeléseket a PennChartban adják le, és közvetlenül az Ambry Genetics alkalmazásprogramozási felületéhez (API) kapcsolódnak. Ezt a funkciót a PennChart már felépítette és implementálta. Mindkét kar esetében az Ambry klinikai jelentései, beleértve a variánsok értelmezéseit is, közvetlenül a PennChartba importálódnak. A GC által látott résztvevők eredményeiket az adott gondozási csoport visszaküldi. A távolról beleegyező résztvevőket előzetesen értesítjük, hogy az általuk választott módszerrel (betegportál, levél, e-mail) értesítést kapnak arról, hogy genetikai eredményeik rendelkezésre állnak. Negatív eredményeket ez a módszer biztosítja, kérésre GC látogatás lehetőségével. A kórokozó/valószínűleg patogén vagy bizonytalan jelentőségű variáns (P/LP vagy VUS) pozitív eredménnyel rendelkező résztvevőket értesítjük arról, hogy az eredmények rendelkezésre állnak, és a vizsgálat genetikai tanácsadója vagy klinikai genetikai tanácsadója telefonon visszaküldi őket. A VUS-eredményeket megfelelő figyelmeztetés mellett visszaküldik a tesztelt betegeknek.

A genetikai kockázat megállapítása 1. fokú felnőtt rokonok körében: A tanulmány ezen része feltárja a genetikai kockázat megállapításának különbségeit az univerzális tesztelési ágba besorolt ​​betegek 1. fokú felnőtt rokonai között, összehasonlítva a fenotípusra irányított ággal kombinációt követően. a vizsgálati terület beutalása, valamint a közvetlen klinikai és/vagy kutatócsoport tájékoztatása. A kutatók azt feltételezik, hogy azáltal, hogy minden szolid daganatos fiatal felnőtt beteget átfogó csíravonal-rákkockázati panellel tesztelnek, nem pedig a rákos betegek csíravonal-genetikai vizsgálatának szokásos, irányelvekre szabott megközelítését követik, a vizsgálók nagyobb arányban fogják azonosítani az 1. fokú rokonai fokozott genetikai rákkockázatnak vannak kitéve.