Генетическое тестирование молодых людей с онкологическими заболеваниями (Gen-Y)

Исследователи проведут рандомизированное исследование среди молодых взрослых (молодых) больных раком, чтобы тщательно проверить гипотезу о том, что универсальное тестирование выявляет многих молодых людей с риском развития рака зародышевой линии, которые были бы пропущены традиционными стратегиями тестирования, чтобы улучшить соблюдение вмешательств по снижению риска среди молодых людей с раком. предрасположенность к раку, а также увеличить выявление среди родственников этих пациентов с повышенным генетическим риском. Первичным результатом рандомизированного исследования будет выявление пробандов, но в сопутствующем исследовании исследователи также изучат возрастающую полезность универсального тестирования в отношении установления риска среди родственников.

Давшие согласие пациенты будут немедленно рандомизированы с использованием созданного компьютером алгоритма рандомизации с использованием переставленных переменных размеров блоков со скрытой последовательностью. Рандомизация будет стратифицирована по полу, критериям направления Национальной комплексной онкологической сети/Американского колледжа медицинской генетики и геномики (NCCN/ACMG) (соответствует/не соответствует) и больнице (например, HUP по сравнению с другими больницами Penn Medicine). Обратите внимание, что из-за демографических различий между больницами исследователи используют тип больницы в качестве косвенного показателя расовой/этнической принадлежности и поэтому не будут проводить стратификацию по нему отдельно. Рандомизация будет происходить в соотношении 2:1 (экспериментальный: контрольный).

Регистрация пациентов для генетического тестирования будет завершена в течение первых 12 месяцев. Если пациенты получают патогенный или вероятно патогенный результат, они будут находиться под наблюдением до пяти лет для оценки влияния поддержки принятия клинических решений. Набор завершится, когда будет зачислено примерно 1238 субъектов. Субъекты будут набраны в пяти учреждениях Penn Medicine, включая Больницу Университета Пенсильвании (HUP), Пресвитерианский медицинский центр Пенсильвании (PPMC), Больницу Пенсильвании (PAH), Больницу округа Честер (CCH) и Больницу общего профиля Ланкастера (LGH).

Пациенты, уведомленные о своем статусе приемлемости и выразившие интерес к участию в исследовании, будут перенаправлены на образовательный веб-сайт, посвященный риску наследственного рака и последствиям генетического тестирования для пациентов и членов их семей. Им также будет предоставлена ​​информация об исследовании. Если они захотят дать согласие после просмотра образовательного модуля, пациенты будут автоматически отправлены в REDCap, где после согласия они также заполнят краткий опрос для получения демографической информации и информации о семейном анамнезе. Пациенты также будут иметь возможность просматривать информацию, давать согласие и заполнять данные по социально-демографическому и семейному анамнезу с помощью бумажных форм.

После предоставления подписанного информированного согласия и определения высокого/низкого риска (на основе руководящих принципов ACMG/NCCN и определяемого либо координатором исследования, либо клиническим консультантом по генетике, как указано выше), пациенты будут рандомизированы в соотношении 2:1 (экспериментальный: контроль) в одну из двух групп исследования, стратифицированных по полу, соответствующим критериям NCCN/ACMG и типу больницы (HUP по сравнению с другими). Участникам исследования будет предложено зарегистрироваться на своем местном портале для пациентов, если они еще этого не сделали, чтобы получать сообщения об исследовании, информацию о здоровье и предупреждения о состоянии здоровья.

Ведение пациентов, рандомизированных в фенотипическую (стандартную) группу, будет зависеть от того, относятся ли они к группе высокого или низкого риска генетической предрасположенности. Пациентам, которые не соответствуют критериям высокого риска, будет оказана рутинная клиническая помощь (т. Пациенты, соответствующие критериям высокого риска, будут направлены к генетическому консультанту в лечащее учреждение Penn Medicine для стандартной оценки генетики рака и тестирования на основе рекомендаций генетического консультанта и предпочтений пациента. Участники этой группы, которые проходят генетическое тестирование, будут отслеживаться, и результаты будут вручную внесены в базу данных исследования, хотя, если они будут протестированы в Ambry Genetics (лаборатория, используемая в группе вмешательства с универсальным тестированием), положительные результаты будут напрямую импортированы в базу данных. PennChart (локальный экземпляр Epic для следователей) через безопасный интерфейс, который уже построен и работает.

Пациенты, рандомизированные в группу универсального тестирования, предоставят образец слюны или крови для секвенирования широкой панели генов риска рака, проводимой Ambry Genetics. Результаты генетического теста будут поступать прямо в PennChart из Ambry через безопасный интерфейс (HL7). Пациентов, отнесенных к группе высокого риска в соответствии с критериями NCCN/ACMG, направят к генетическому консультанту в их лечебном учреждении, которого попросят пройти тестирование с использованием широкой панели генов риска рака Ambry, а не с помощью обычных клинических тестов. Если они не пройдут клиническое тестирование, как указано выше, они будут протестированы исследовательской группой с использованием наборов для генетического тестирования, отправленных по почте (с предоплаченными почтовыми рассылками Ambry Genetics). Пациенты, отнесенные к группе низкого риска, будут проходить тестирование с использованием обширной панели генов риска рака Ambry с помощью наборов для генетического тестирования, отправленных по почте (как указано выше).

Результаты участников, осмотренных консультантом по генетическим вопросам, будут раскрыты их командой по уходу. Участники, которые зарегистрируются удаленно, будут уведомлены о том, что их результаты доступны выбранным ими способом (портал для пациентов, почта или электронная почта). Пациентам с отрицательным результатом будет предоставлен результат предпочтительным методом и предоставлена ​​возможность поговорить с консультантом-генетиком. Те пациенты с положительными результатами будут обеспечены их результатами по телефону либо исследованием, либо их клиническими генетическими консультантами или врачом. Результаты пациентов, прошедших тестирование в Ambry, будут напрямую импортированы в их карты через HL7; публикация результатов через MyPennMedicine (MPM) будет происходить только после того, как генетический консультант или врач поговорит с пациентом (ручная публикация).

В рамках этого исследования проводится генетическое тестирование вариантов генов, которые, как известно, связаны с повышенным риском развития рака. Однако не исключено, что исследователям известны не все такие гены, и исследователей интересуют исследования, которые могут помочь их идентифицировать в будущем. В качестве дополнительной части исследования исследователи будут запрашивать согласие участников на использование образца их ДНК, чтобы помочь понять развитие рака и других заболеваний. Возможные будущие исследования могут включать другие исследования риска наследственного рака или связи между ДНК и результатами лечения, включая реакцию на лечение или вклад в исследования других заболеваний. Некоторые исследования могут включать секвенирование всего генома — метод, определяющий точную последовательность ДНК человека. Участники могут отказаться от участия в этом аспекте исследования и использовать только свои образцы для основного исследования.

Приемлемые участники будут определены с помощью одного из двух механизмов. Большинство из них будут идентифицированы с помощью системы электронных медицинских карт (EHR), которая в Penn Medicine является Epic, и будут переданы непосредственно исследовательской группе через реестр Epic. Участники будут проверены координатором исследования для определения права на участие в исследовании, убедившись, что они не соответствуют ни одному из критериев исключения из исследования на основе информации, содержащейся в электронных медицинских карточках.

В качестве альтернативы, некоторые подходящие участники будут определены во время встречи с консультантом-генетиком в одном из центров генетики рака Penn Medicine и набраны местным консультантом-генетиком с немедленной рандомизацией. К таким пациентам будут относиться, например, пациенты, которых необходимо осмотреть быстрее, чем их можно было бы найти в реестре Epic (например, пациенты с раком молочной железы перед операцией). Пациенты, у которых уже запланирована встреча с генетиком рака на момент их поступления в реестр Epic, будут набраны через своих консультантов-генетиков.

Участники, которые не соответствуют рекомендациям NCCN/ACMG по направлению к генетическому консультанту, будут получать обычную клиническую помощь, которая не включает посещение генетического консультанта или генетическое тестирование на предрасположенность к раку. Участники, которые соответствуют рекомендациям NCCN/ACMG, будут направлены к генетическому консультанту в своем лечебном учреждении. Генетическое тестирование будет назначено на основании клинических рекомендаций генетического консультанта и предпочтений пациента. Участники этой группы, проходящие генетическое тестирование, будут отслеживаться, а результаты будут вручную вводиться в базу данных исследования, хотя, если они будут протестированы в Ambry Genetics, положительные результаты могут быть напрямую импортированы в PennChart (наш локальный экземпляр Epic) через безопасный интерфейс. .

Участники, рандомизированные в группу универсального тестирования, пройдут генетическое тестирование с использованием широкой панели генов риска рака через Ambry Genetics. У участников будут взяты образцы слюны. Для пациентов с низким уровнем риска, а также для пациентов с высоким риском, которые отказываются от визитов генетического консультанта (GC), координаторы исследований (RC) отправят по почте комплект слюны вместе с предоплаченным почтовым отправлением, адресованным Ambry Genetics, и заполненной формой заявки на тестирование. к участнику.

Заказы будут размещены в PennChart и будут напрямую связаны с интерфейсом прикладного программирования (API) Ambry Genetics. Эта функция уже реализована в PennChart. Для обеих групп клинические отчеты из Ambry, включая интерпретацию вариантов, напрямую импортируются в PennChart. Результаты участников, осмотренных GC, будут возвращены этой командой по уходу. Участникам, давшим согласие удаленно, будет заранее сообщено, что они будут уведомлены выбранным ими способом (портал для пациентов, почта, электронная почта) о том, что их генетические результаты доступны. Отрицательные результаты будут предоставлены этим методом с возможностью посещения ГК по запросу. Участникам с положительными результатами патогенного/вероятно патогенного или варианта с неопределенной значимостью (P/LP или VUS) сообщат, что результаты доступны, и консультант-генетик исследования или их клинический консультант-генетик вернет их по телефону. Результаты VUS будут возвращены протестированным пациентам с соответствующими предостережениями.

Установление генетического риска среди взрослых родственников 1-й степени родства: в этой части исследования будут изучены различия в установлении генетического риска среди взрослых родственников 1-й степени родства пациентов, включенных в группу универсального тестирования, по сравнению с группой, ориентированной на фенотип, после комбинации направления пробанда и прямого контакта с клинической и/или исследовательской группой. Исследователи предполагают, что, тестируя всех молодых взрослых пациентов с солидными опухолями с помощью комплексной панели риска рака зародышевой линии, а не следуя стандартному подходу, ориентированному на рекомендации, к генетическому тестированию зародышевой линии пациентов с раком, исследователи выявят более высокую долю их 1st- родственники степени как имеющие повышенный генетический риск рака.