Incidence de la PAV chez les patients atteints de COVID-19 sévère (CoV-AP)

La pneumonie sous ventilation assistée (PAV) est l'infection la plus courante contractée en unité de soins intensifs (USI). À ce jour, il n'y a pas d'étalon-or diagnostique pour la PAV, et son diagnostic est basé sur des scores qui incluent des paramètres radiologiques, cliniques, de laboratoire et microbiologiques. De plus, il n'y a pas de recommandation univoque concernant le type de diagnostic microbiologique. Certaines recommandations suggèrent l'utilisation de méthodes non invasives (aspiration endotrachéale, ETA) avec des cultures semi-quantitatives, tandis que d'autres suggèrent le prélèvement d'échantillons respiratoires distaux (lavage broncho-alvéolaire, BAL) avec des cultures quantitatives. Alors que la première méthode se caractérise par une sensibilité plus élevée et une spécificité plus faible, la seconde a en revanche une spécificité plus élevée. À ce jour, rien ne prouve qu'une méthode soit supérieure à l'autre en termes de résultats cliniques.

Chez les patients atteints d'une infection grave par le SRAS-CoV-2, la maladie COVID-19 elle-même et les thérapies immunomodulatrices ont un impact direct sur la plupart des paramètres cliniques, de laboratoire et radiologiques nécessaires pour obtenir un diagnostic de PAV. Dans ce contexte, une approche diagnostique caractérisée par une sensibilité plus élevée couplée à une spécificité plus faible pourrait conduire à un nombre élevé de faux positifs. Le plus grand risque est celui d'un surdiagnostic de PAV et d'un surtraitement conséquent, avec la toxicité thérapeutique associée et une résistance accrue aux antibiotiques.

A l'hôpital investigateurs, le diagnostic de PAV repose sur une suspicion clinico-radiologique selon le score de Johanson (révélation ou progression d'infiltrats à la radiographie pulmonaire + au moins deux des trois critères cliniques suivants : fièvre > 38°C, leucocytose ou leucopénie, sécrétions purulentes), largement validée chez les patients non COVID. Jusqu'à fin 2020, les données microbiologiques permettant de confirmer le diagnostic de PAV suspectée cliniquement et d'orienter l'antibiothérapie reposaient sur la réalisation d'ETA de surveillance bihebdomadaire. Compte tenu de la spécificité limitée de cette approche dans le cadre du COVID-19, à partir de fin 2020, les patients infectés par le SRAS-CoV-2 et suspectés de PAV subissent, si cliniquement possible, un prélèvement d'échantillons respiratoires distaux en réalisant un BAL/mini-BAL .

La présente étude de cohorte prospective-rétrospective vise à évaluer l'incidence de la PAV confirmée microbiologiquement avec BAL (partie prospective) et surveillance bihebdomadaire ETA (partie rétrospective) chez les patients ventilés mécaniquement atteints de COVID-19 en USI. Dans la partie prospective, des analyses immunologiques et virologiques seront réalisées sur des échantillons biologiques (sang, voies respiratoires) prélevés chez des patients au diagnostic de PAV.

L'étude durera 12 mois.