Infections pathogènes à Gram négatif multirésistantes chez les nouveau-nés à haut risque dans le nord-est du Mexique (InfGNMDR-Neo)

Les enquêteurs proposent une approche de conception mixte, une étude de cohorte avec une analyse cas-témoin nichée. Les sujets de l'étude seront les isolats gram-négatifs du laboratoire clinique de l'hôpital d'étude. Le facteur d'exposition de la cohorte sera la présence ou l'absence d'un isolat bactérien à Gram négatif multirésistant.

La cohorte prospective permettra l'estimation de la charge d'infection à Gram négatif dans la population à l'étude et la caractérisation de tous les isolats de micro-organismes des sujets de l'étude au niveau du phénotype et du génotype, en particulier en ce qui concerne l'expression de la résistance multidrogue (MDR) associée gènes (caractérisation moléculaire des isolats Gram-négatifs MDR); la cohorte sera formée par chaque nouveau-né, depuis l'admission en soins spéciaux, la date d'isolement puis le suivi jusqu'à la résolution, qu'il soit sorti vivant, décédé ou transféré dans un autre établissement. Les ratios de risque pour chacun de ces résultats seront calculés.

L'analyse cas-témoins permettra à l'équipe de recherche d'identifier les principaux facteurs de risque présents chez les personnes qui avaient ou n'avaient pas un isolat gram-négatif MDR, en calculant les rapports de cotes associés pour les facteurs périnataux concomitants. Autre objectif du projet, établir des corrélations et mesurer les facteurs de risque (Odds ratios) entre l'infection à Gram négatif par des organismes MDR et les maladies concomitantes et les traitements proposés dans la pouponnière de soins spéciaux (médicaux [antibiotiques, anti-inflammatoires non stéroïdiens, stéroïdes, autres ], les procédures chirurgicales et cliniques) chez les nouveau-nés sous soins spéciaux, seront également atteints grâce à l'approche des études de cas et de contrôles emboîtés.

Enfin, un dérivé de ce projet sera la création du référentiel régional du nord-est du Mexique d'isolats bactériens chez les nouveau-nés sous soins spéciaux. Dans un premier temps, ce référentiel conservera des échantillons de bactéries, à la fois Gram-négatives et Gram-positives, ainsi qu'une base de données anonyme spécialement développée des individus hébergeant ces infections. Dans un avenir proche, l'objectif de ce référentiel pourrait s'étendre à la préservation des champignons, des parasites et peut-être des isolats viraux.

L'équipe de recherche a également proposé un objectif exploratoire, sous réserve de disponibilité budgétaire, à savoir la caractérisation et la comparaison de l'immuno-phénotype des individus atteints d'infection à Gram négatif par des organismes résistants à la MDR, de ceux infectés par d'autres organismes et de ceux non infectés. touchés par des complications infectieuses.

Tous les isolats gram-négatifs seront sondés pour l'expression génique de 38 locus de résistance aux antibiotiques sélectionnés, et 96 échantillons sélectionnés seront étudiés plus avant par séquençage de nouvelle génération.