Инфекции полирезистентных грамотрицательных патогенов у новорожденных с высоким риском на северо-востоке Мексики (InfGNMDR-Neo)

Исследователи предлагают подход со смешанным дизайном, когортное исследование с вложенным анализом случай-контроль. Субъектами исследования будут грамотрицательные изоляты в клинической лаборатории исследовательской больницы. Фактором воздействия когорты будет наличие или отсутствие изолята грамотрицательных бактерий с множественной лекарственной устойчивостью.

Проспективная когорта позволит оценить бремя грамотрицательной инфекции в исследуемой популяции и охарактеризовать все микроорганизмы, выделенные от субъектов исследования, на уровне фенотипа и генотипа, в частности, в отношении выраженности множественной лекарственной устойчивости (МЛУ), связанной с гены (молекулярная характеристика грамотрицательных изолятов с МЛУ); когорта будет формироваться каждым новорожденным с момента поступления в отделение особого ухода, даты изоляции, а затем последующего наблюдения до разрешения, будь то выписка живым, мертвым или путем перевода в другое учреждение. Будут рассчитаны коэффициенты риска для каждого из этих исходов.

Анализ случай-контроль позволит исследовательской группе определить основные факторы риска, присутствующие у тех лиц, у которых в дальнейшем был или не был изолят грамотрицательного MDR, путем расчета связанных отношений шансов для сопутствующих перинатальных факторов. Другая цель проекта — установить корреляции и измерить факторы риска (отношения шансов) между грамотрицательной инфекцией МЛУ-организмами и сопутствующими заболеваниями и лечением, предлагаемым в специализированном стационаре (медикаментозные [антибиотики, нестероидные противовоспалительные препараты, стероиды, др. ], хирургические и клинические процедуры) у новорожденных, находящихся под особым наблюдением, также будет достигаться с помощью подхода исследования вложенных случаев и контролей.

Наконец, производным от этого проекта станет создание Регионального репозитория северо-восточных мексиканских бактериальных изолятов у новорожденных, находящихся под особым присмотром. На первом этапе в этом репозитории будут храниться образцы бактерий, как грамотрицательных, так и грамположительных, а также специально разработанная анонимная база данных носителей этих инфекций. В ближайшем будущем центр внимания этого репозитория может расшириться до сохранения грибков, паразитов и, возможно, вирусных изолятов.

Исследовательская группа также предложила исследовательскую цель, при условии наличия бюджета, а именно характеристику и сравнение иммунофенотипа лиц, пораженных грамотрицательной инфекцией устойчивыми к МЛУ микроорганизмами, лиц с инфекцией другими микроорганизмами и лиц, не инфицированных с инфекционными осложнениями.

Все грамотрицательные изоляты будут исследованы на экспрессию генов 38 выбранных локусов устойчивости к антибиотикам, а 96 отобранных образцов будут дополнительно изучены с помощью секвенирования следующего поколения.