Wielolekooporne zakażenia Gram-ujemnymi patogenami u noworodków wysokiego ryzyka w północno-wschodniej części Meksyku (InfGNMDR-Neo)

Badacze proponują podejście mieszane, badanie kohortowe z zagnieżdżoną analizą kliniczno-kontrolną. Badani będą gram-ujemnymi izolatami w laboratorium klinicznym szpitala badawczego. Czynnikiem narażenia kohorty będzie obecność lub brak wielolekoopornego izolatu bakterii Gram-ujemnych.

Prospektywna kohorta pozwoli oszacować obciążenie bakteriami Gram-ujemnymi w badanej populacji oraz scharakteryzować wszystkie mikroorganizmy wyizolowane od badanych na poziomie fenotypu i genotypu, szczególnie w odniesieniu do ekspresji oporności wielolekowej (MDR) związanej z geny (charakterystyka molekularna izolatów Gram-ujemnych MDR); kohorta będzie tworzona przez każdego noworodka, od przyjęcia do specjalnej opieki, dnia izolacji, a następnie obserwacji aż do rozstrzygnięcia, czy to wypis żywy, martwy, czy przeniesienie do innej placówki. Obliczone zostaną współczynniki ryzyka dla każdego z tych wyników.

Analiza przypadków-kontroli pozwoli zespołowi badawczemu zidentyfikować główne czynniki ryzyka występujące u tych osób, które dodatkowo miały lub nie miały gram-ujemnego izolatu MDR, poprzez obliczenie powiązanych ilorazów szans dla współistniejących czynników okołoporodowych. Kolejnym celem projektu było ustalenie korelacji i pomiar czynników ryzyka (ilorazów szans) pomiędzy zakażeniem Gram-ujemnymi organizmami MDR a współistniejącą chorobą i leczeniem oferowanym w żłobku specjalnym (leki [antybiotyki, niesteroidowe leki przeciwzapalne, sterydy, inne ], zabiegi chirurgiczne i kliniczne) u noworodków znajdujących się pod specjalną opieką, zostanie również osiągnięty poprzez podejście do zagnieżdżonych przypadków i badań kontrolnych.

Pochodną tego projektu będzie wreszcie utworzenie Regionalnego Repozytorium Północno-Wschodniego Meksyku izolatów bakteryjnych u noworodków objętych specjalną opieką. W pierwszym etapie repozytorium będzie przechowywać próbki bakterii, zarówno Gram-ujemnych, jak i Gram-dodatnich, wraz ze specjalnie opracowaną anonimową bazą danych osób będących nosicielami tych infekcji. W niedalekiej przyszłości obszar zainteresowania tego repozytorium może rozszerzyć się na ochronę grzybów, pasożytów i być może izolatów wirusowych.

Zespół badawczy zaproponował również cel badawczy, w zależności od dostępności środków budżetowych, a mianowicie scharakteryzowanie i porównanie fenotypu immunologicznego osób dotkniętych zakażeniem Gram-ujemnymi organizmami opornymi na MDR, zakażonych innymi organizmami i tych, które nie dotkniętych powikłaniami infekcyjnymi.

Wszystkie gram-ujemne izolaty będą badane pod kątem ekspresji genów 38 wybranych loci oporności na antybiotyki, a 96 wybranych próbek będzie dalej badanych przez sekwencjonowanie nowej generacji.