Multiläkemedelsresistenta gramnegativa patogeninfektioner hos nyfödda med hög risk i nordöstra Mexiko (InfGNMDR-Neo)

Utredarna föreslår en blandad designmetod, en kohortstudie med en kapslad fall-kontrollanalys. Studieämnen kommer att vara de gramnegativa isolaten vid studiesjukhusets kliniska laboratorium. Kohortens exponeringsfaktor kommer att vara närvaron eller frånvaron av ett multiläkemedelsresistens gramnegativt bakterieisolat.

Den blivande kohorten kommer att möjliggöra uppskattning av gramnegativ infektionsbörda i studiepopulationen och karakterisering av alla mikroorganismisolat från studiepersoner på fenotyp- och genotypnivå, specifikt i relation till uttrycket av multidrogresistens (MDR) associerad gener (Molekylär karakterisering av gramnegativa MDR-isolat); kohorten kommer att bildas av varje nyfödd, från intagningen till särskild vård, isoleringsdatumet och sedan uppföljning fram till upplösningen, vare sig det skrivs ut levande, död eller genom förflyttning till en annan inrättning. Riskkvoter för vart och ett av dessa utfall kommer att beräknas.

Fall-kontrollanalys kommer att göra det möjligt för forskargruppen att identifiera huvudriskfaktorer som finns hos de individer som ytterligare hade eller inte hade ett gramnegativt MDR-isolat, genom beräkning av associerade oddskvoter för samtidiga perinatala faktorer. Ett annat projektmål, att fastställa korrelationer och mäta riskfaktorer (oddskvoter) mellan gramnegativ infektion med MDR-organismer och samtidig sjukdom och behandlingar som erbjuds i specialvården (medicinska [antibiotika, icke-steroida antiinflammatoriska läkemedel, steroider, etc.) ], kirurgiska och kliniska procedurer) hos nyfödda under särskild vård, kommer också att uppnås genom studiemetoden för kapslade fall och kontroller.

Slutligen kommer ett derivat från detta projekt att vara etableringen av nordöstra Mexikos regionala förvar av bakterieisolat i nyfödda under särskild vård. I det första skedet kommer detta förvar att bevara prover av bakterier, både gramnegativa och grampositiva, tillsammans med en speciellt utvecklad anonym databas över de individer som är värd för dessa infektioner. Inom en snar framtid kan fokus för detta förvar utökas till att bevara svamp, parasiter och kanske virala isolat.

Forskargruppen har också föreslagit ett utforskande mål, beroende på budgettillgänglighet, och det är karakterisering och jämförelse av immunfenotypen för de individer som drabbats av gramnegativ infektion med MDR-resistenta organismer, de med infektion med andra organismer och de som inte påverkas av infektiösa komplikationer.

Alla gramnegativa isolat kommer att undersökas för genuttryck av 38 utvalda antibiotikaresistensloci, och 96 utvalda prover kommer att studeras ytterligare genom nästa generations sekvensering.